Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність...
Збережено в:
| Дата: | 2009 |
|---|---|
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного
2009
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862718673848893440 |
|---|---|
| author | Гордєйчик, О.І. Щербатенко, І.С. |
| author_facet | Гордєйчик, О.І. Щербатенко, І.С. |
| citation_txt | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| description | Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність подібних нуклеотидних сайтів у філогенетично далеких родів вірусів, уточнено систематичне положення вірусу некрозу лізіантусу, виявлено особливості локалізації подібних нуклеотидних сайтів у вірусних геномах.
Проведено компьютерный поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномах фитопатогенных вирусов путем последовательного сопоставления двух геномных сиквенсов с возрастающей величиной сдвига их начальных позиций. Установлено граничные параметры неслучайного совпадения нуклеотидов в сиквенсах, показано наличие подобных нуклеотидных сайтов у филогенетически далеких родов вирусов, уточнено систематическое положение вируса некроза лизиантуса, выявлено особенности локализации подобных нуклеотидных сайтов в вирусных геномах.
Computational search for similar nucleotide sites in genomes of plant viruses was performed by successive comparison of two genomic sequences with increasing the displacement of their initial positions. Parameter limits of non-random nucleotide coincidence in sequences were determined, presence of similar nucleotide sites in phylogenetically different viral genera was shown, a taxonomy of lisianthus necrosis virus was specified, localization peculiarity of similar nucleotide sites in viral genomes was revealed.
|
| first_indexed | 2025-12-07T18:16:53Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-7784 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0201-8462 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T18:16:53Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного |
| record_format | dspace |
| spelling | Гордєйчик, О.І. Щербатенко, І.С. 2010-04-13T11:46:01Z 2010-04-13T11:46:01Z 2009 Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр. 0201-8462 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784 578.233 Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність подібних нуклеотидних сайтів у філогенетично далеких родів вірусів, уточнено систематичне положення вірусу некрозу лізіантусу, виявлено особливості локалізації подібних нуклеотидних сайтів у вірусних геномах. Проведено компьютерный поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномах фитопатогенных вирусов путем последовательного сопоставления двух геномных сиквенсов с возрастающей величиной сдвига их начальных позиций. Установлено граничные параметры неслучайного совпадения нуклеотидов в сиквенсах, показано наличие подобных нуклеотидных сайтов у филогенетически далеких родов вирусов, уточнено систематическое положение вируса некроза лизиантуса, выявлено особенности локализации подобных нуклеотидных сайтов в вирусных геномах. Computational search for similar nucleotide sites in genomes of plant viruses was performed by successive comparison of two genomic sequences with increasing the displacement of their initial positions. Parameter limits of non-random nucleotide coincidence in sequences were determined, presence of similar nucleotide sites in phylogenetically different viral genera was shown, a taxonomy of lisianthus necrosis virus was specified, localization peculiarity of similar nucleotide sites in viral genomes was revealed. uk Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного Експериментальні праці Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів Поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномных сиквенсах фитопатогенных вирусов Searching for Similar Nucleotide Sites in Genomic Sequences of Phytopathogenic Viruses Article published earlier |
| spellingShingle | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів Гордєйчик, О.І. Щербатенко, І.С. Експериментальні праці |
| title | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| title_alt | Поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномных сиквенсах фитопатогенных вирусов Searching for Similar Nucleotide Sites in Genomic Sequences of Phytopathogenic Viruses |
| title_full | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| title_fullStr | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| title_full_unstemmed | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| title_short | Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| title_sort | пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів |
| topic | Експериментальні праці |
| topic_facet | Експериментальні праці |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784 |
| work_keys_str_mv | AT gordêičikoí pošukpodíbnihnukleotidnihsaitívugenomnihsikvensahfítopatogennihvírusív AT ŝerbatenkoís pošukpodíbnihnukleotidnihsaitívugenomnihsikvensahfítopatogennihvírusív AT gordêičikoí poiskpodobnyhnukleotidnyhsaitovvgenomnyhsikvensahfitopatogennyhvirusov AT ŝerbatenkoís poiskpodobnyhnukleotidnyhsaitovvgenomnyhsikvensahfitopatogennyhvirusov AT gordêičikoí searchingforsimilarnucleotidesitesingenomicsequencesofphytopathogenicviruses AT ŝerbatenkoís searchingforsimilarnucleotidesitesingenomicsequencesofphytopathogenicviruses |