Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів

Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Date:2009
Main Authors: Гордєйчик, О.І., Щербатенко, І.С.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного 2009
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-7784
record_format dspace
spelling Гордєйчик, О.І.
Щербатенко, І.С.
2010-04-13T11:46:01Z
2010-04-13T11:46:01Z
2009
Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр.
0201-8462
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784
578.233
Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність подібних нуклеотидних сайтів у філогенетично далеких родів вірусів, уточнено систематичне положення вірусу некрозу лізіантусу, виявлено особливості локалізації подібних нуклеотидних сайтів у вірусних геномах.
Проведено компьютерный поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномах фитопатогенных вирусов путем последовательного сопоставления двух геномных сиквенсов с возрастающей величиной сдвига их начальных позиций. Установлено граничные параметры неслучайного совпадения нуклеотидов в сиквенсах, показано наличие подобных нуклеотидных сайтов у филогенетически далеких родов вирусов, уточнено систематическое положение вируса некроза лизиантуса, выявлено особенности локализации подобных нуклеотидных сайтов в вирусных геномах.
Computational search for similar nucleotide sites in genomes of plant viruses was performed by successive comparison of two genomic sequences with increasing the displacement of their initial positions. Parameter limits of non-random nucleotide coincidence in sequences were determined, presence of similar nucleotide sites in phylogenetically different viral genera was shown, a taxonomy of lisianthus necrosis virus was specified, localization peculiarity of similar nucleotide sites in viral genomes was revealed.
uk
Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного
Експериментальні праці
Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
Поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномных сиквенсах фитопатогенных вирусов
Searching for Similar Nucleotide Sites in Genomic Sequences of Phytopathogenic Viruses
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
spellingShingle Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
Гордєйчик, О.І.
Щербатенко, І.С.
Експериментальні праці
title_short Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
title_full Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
title_fullStr Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
title_full_unstemmed Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
title_sort пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів
author Гордєйчик, О.І.
Щербатенко, І.С.
author_facet Гордєйчик, О.І.
Щербатенко, І.С.
topic Експериментальні праці
topic_facet Експериментальні праці
publishDate 2009
language Ukrainian
publisher Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного
format Article
title_alt Поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномных сиквенсах фитопатогенных вирусов
Searching for Similar Nucleotide Sites in Genomic Sequences of Phytopathogenic Viruses
description Проведено комп’ютерний пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномах фітопатогенних вірусів шляхом послідовного співставлення двох геномних сиквенсів зі зростаючою величиною зсуву їх початкових позицій. Встановлено граничні параметри невипадкової збіжності нуклеотидів у сиквенсах, показано наявність подібних нуклеотидних сайтів у філогенетично далеких родів вірусів, уточнено систематичне положення вірусу некрозу лізіантусу, виявлено особливості локалізації подібних нуклеотидних сайтів у вірусних геномах. Проведено компьютерный поиск подобных нуклеотидных сайтов в геномах фитопатогенных вирусов путем последовательного сопоставления двух геномных сиквенсов с возрастающей величиной сдвига их начальных позиций. Установлено граничные параметры неслучайного совпадения нуклеотидов в сиквенсах, показано наличие подобных нуклеотидных сайтов у филогенетически далеких родов вирусов, уточнено систематическое положение вируса некроза лизиантуса, выявлено особенности локализации подобных нуклеотидных сайтов в вирусных геномах. Computational search for similar nucleotide sites in genomes of plant viruses was performed by successive comparison of two genomic sequences with increasing the displacement of their initial positions. Parameter limits of non-random nucleotide coincidence in sequences were determined, presence of similar nucleotide sites in phylogenetically different viral genera was shown, a taxonomy of lisianthus necrosis virus was specified, localization peculiarity of similar nucleotide sites in viral genomes was revealed.
issn 0201-8462
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/7784
citation_txt Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів / О.І. Гордєйчик, І.С. Щербатенко // Мікробіол. журн. — 2009. — Т. 71, № 4. — С. 63-70. — Бібліогр.: 18 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT gordêičikoí pošukpodíbnihnukleotidnihsaitívugenomnihsikvensahfítopatogennihvírusív
AT ŝerbatenkoís pošukpodíbnihnukleotidnihsaitívugenomnihsikvensahfítopatogennihvírusív
AT gordêičikoí poiskpodobnyhnukleotidnyhsaitovvgenomnyhsikvensahfitopatogennyhvirusov
AT ŝerbatenkoís poiskpodobnyhnukleotidnyhsaitovvgenomnyhsikvensahfitopatogennyhvirusov
AT gordêičikoí searchingforsimilarnucleotidesitesingenomicsequencesofphytopathogenicviruses
AT ŝerbatenkoís searchingforsimilarnucleotidesitesingenomicsequencesofphytopathogenicviruses
first_indexed 2025-12-07T18:16:53Z
last_indexed 2025-12-07T18:16:53Z
_version_ 1850874436734943232