Моделирование свертывания протеина в пространстве
Рассматривается проблема прогнозирования третичной структуры протеина по заданной последовательности аминокислот. На основе НР-модели она формализуется в виде специальной задачи комбинаторной оптимизации, определенной на трехмерной треугольной решетке. Предложены два алгоритма локального поиска, эфф...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Компьютерная математика |
|---|---|
| Дата: | 2010 |
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України
2010
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/84576 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Моделирование свертывания протеина в пространстве / Л.Ф. Гуляницкий, В.А. Рудык // Компьютерная математика: сб. науч. тр. — 2010. — № 1. — С. 128-137. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862633219965321216 |
|---|---|
| author | Гуляницкий, Л.Ф. Рудык, В.А. |
| author_facet | Гуляницкий, Л.Ф. Рудык, В.А. |
| citation_txt | Моделирование свертывания протеина в пространстве / Л.Ф. Гуляницкий, В.А. Рудык // Компьютерная математика: сб. науч. тр. — 2010. — № 1. — С. 128-137. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Компьютерная математика |
| description | Рассматривается проблема прогнозирования третичной структуры протеина по заданной последовательности аминокислот. На основе НР-модели она формализуется в виде специальной задачи комбинаторной оптимизации, определенной на трехмерной треугольной решетке. Предложены два алгоритма локального поиска, эффективность которых исследована путем анализа результатов проведенного вычислительного эксперимента.
Розглядається проблема прогнозування третинної структури протеїну за заданою послідовністю амінокислот. На основі НР-моделі вона формалізується у вигляді спеціальної задачі комбінаторної оптимізації, яка визначена на тривимірній трикутній решітці. Запропоновано два методи локального пошуку, ефективність яких досліджена шляхом аналізу результатів проведеного обчислювального експерименту.
The problem of protein tertiary structure prediction from its amino acid sequence is examined. Basing on HP-model, it is formalized as a specific combinatorial optimization problem defined on a three-dimensional triangular lattice. Two local search methods are proposed and their efficiency is examined by analyzing the results of computational experiment.
|
| first_indexed | 2025-11-30T14:35:38Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-84576 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | ХХХХ-0003 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-30T14:35:38Z |
| publishDate | 2010 |
| publisher | Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Гуляницкий, Л.Ф. Рудык, В.А. 2015-07-10T14:51:34Z 2015-07-10T14:51:34Z 2010 Моделирование свертывания протеина в пространстве / Л.Ф. Гуляницкий, В.А. Рудык // Компьютерная математика: сб. науч. тр. — 2010. — № 1. — С. 128-137. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. ХХХХ-0003 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/84576 519.21 Рассматривается проблема прогнозирования третичной структуры протеина по заданной последовательности аминокислот. На основе НР-модели она формализуется в виде специальной задачи комбинаторной оптимизации, определенной на трехмерной треугольной решетке. Предложены два алгоритма локального поиска, эффективность которых исследована путем анализа результатов проведенного вычислительного эксперимента. Розглядається проблема прогнозування третинної структури протеїну за заданою послідовністю амінокислот. На основі НР-моделі вона формалізується у вигляді спеціальної задачі комбінаторної оптимізації, яка визначена на тривимірній трикутній решітці. Запропоновано два методи локального пошуку, ефективність яких досліджена шляхом аналізу результатів проведеного обчислювального експерименту. The problem of protein tertiary structure prediction from its amino acid sequence is examined. Basing on HP-model, it is formalized as a specific combinatorial optimization problem defined on a three-dimensional triangular lattice. Two local search methods are proposed and their efficiency is examined by analyzing the results of computational experiment. ru Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України Компьютерная математика Теория и методы оптимизации Моделирование свертывания протеина в пространстве Моделювання згортання протеїну у просторі 3-D modelling of protein folding Article published earlier |
| spellingShingle | Моделирование свертывания протеина в пространстве Гуляницкий, Л.Ф. Рудык, В.А. Теория и методы оптимизации |
| title | Моделирование свертывания протеина в пространстве |
| title_alt | Моделювання згортання протеїну у просторі 3-D modelling of protein folding |
| title_full | Моделирование свертывания протеина в пространстве |
| title_fullStr | Моделирование свертывания протеина в пространстве |
| title_full_unstemmed | Моделирование свертывания протеина в пространстве |
| title_short | Моделирование свертывания протеина в пространстве |
| title_sort | моделирование свертывания протеина в пространстве |
| topic | Теория и методы оптимизации |
| topic_facet | Теория и методы оптимизации |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/84576 |
| work_keys_str_mv | AT gulânickiilf modelirovaniesvertyvaniâproteinavprostranstve AT rudykva modelirovaniesvertyvaniâproteinavprostranstve AT gulânickiilf modelûvannâzgortannâproteínuuprostorí AT rudykva modelûvannâzgortannâproteínuuprostorí AT gulânickiilf 3dmodellingofproteinfolding AT rudykva 3dmodellingofproteinfolding |