Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов
Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке...
Saved in:
| Published in: | Теорія оптимальних рішень |
|---|---|
| Date: | 2012 |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України
2012
|
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/85018 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-85018 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
2015-07-18T12:37:27Z 2015-07-18T12:37:27Z 2012 Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. XXXX-0013 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/85018 519.21 Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке и обновления матрицы феромонных путей, их эффективность подтверждена вычислительным экспериментом. Розглядається гідрофобно-полярна модель згортання протеїну, пропонується та досліджується алгоритм прогнозування третинної структури білка, розроблений на базі методу ОМК. Будується модель молекули протеїну в тривимірній трикутній решітці. Запропоновані методи апріорної оцінки позиції в решітці та поновлення матриці феромонних шляхів, їх ефективність підтверджена обчислювальним експериментом. The Hydrophobic-Hydrophilic protein folding model is examined, the algorithm based on ACO optimization method is proposed and analyzed for protein tertiary structure prediction. The molecule model is considered to be a chain whose monomers are placed on the vertices of 3D triangular lattice. The a priori position estimation method and pheromone trails updating method are deviced, computational experiment confirms their appropriateness. ru Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України Теорія оптимальних рішень Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов Аналіз ефективності алгоритмів ОМК для розв’язання задачі про згортання протеїну ANT colony optimization algorithms for protein folding problem analysis Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| spellingShingle |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| title_short |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| title_full |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| title_fullStr |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| title_full_unstemmed |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
| title_sort |
анализ эффективности алгоритмов омк для решения задачи о сворачивании протеинов |
| publishDate |
2012 |
| language |
Russian |
| container_title |
Теорія оптимальних рішень |
| publisher |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Аналіз ефективності алгоритмів ОМК для розв’язання задачі про згортання протеїну ANT colony optimization algorithms for protein folding problem analysis |
| description |
Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке и обновления матрицы феромонных путей, их эффективность подтверждена вычислительным экспериментом.
Розглядається гідрофобно-полярна модель згортання протеїну, пропонується та досліджується алгоритм прогнозування третинної структури білка, розроблений на базі методу ОМК. Будується модель молекули протеїну в тривимірній трикутній решітці. Запропоновані методи апріорної оцінки позиції в решітці та поновлення матриці феромонних шляхів, їх ефективність підтверджена обчислювальним експериментом.
The Hydrophobic-Hydrophilic protein folding model is examined, the algorithm based on ACO optimization method is proposed and analyzed for protein tertiary structure prediction. The molecule model is considered to be a chain whose monomers are placed on the vertices of 3D triangular lattice. The a priori position estimation method and pheromone trails updating method are deviced, computational experiment confirms their appropriateness.
|
| issn |
XXXX-0013 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/85018 |
| citation_txt |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
| first_indexed |
2025-12-07T15:59:58Z |
| last_indexed |
2025-12-07T15:59:58Z |
| _version_ |
1850865823469535232 |