Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини
Уточнено локалiзацiю неоантигенної детермiнанти фiбрину людини в межах його фрагмента Вβ118–134. Порiвняльний аналiз iнгiбiторної дiї пептидiв Вβ109–126 i Вβ121–138 на полiмеризацiю фiбрину та iмуноферментний аналiз зв’язування монАТ I-3с з фiбрином людини, бика, коня, щура та кроля вказали на лока...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Datum: | 2013 |
| Hauptverfasser: | , , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainisch |
| Veröffentlicht: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2013
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/86204 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини / Л.П. Урвант, Є.М. Макогоненко, М.О. Пидюра, І.М. Колєснікова, Н.Е. Луговська, Е.В. Луговськой, С.В. Комісаренко // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2013. — № 10. — С. 170–175. — Бібліогр.: 12 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859668410290405376 |
|---|---|
| author | Урвант, Л.П. Макогоненко, Є.М. Пидюра, М.О. Колєснікова, І.М. Луговська, Н.Е. Луговськой, Е.В. Комісаренко, С.В. |
| author_facet | Урвант, Л.П. Макогоненко, Є.М. Пидюра, М.О. Колєснікова, І.М. Луговська, Н.Е. Луговськой, Е.В. Комісаренко, С.В. |
| citation_txt | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини / Л.П. Урвант, Є.М. Макогоненко, М.О. Пидюра, І.М. Колєснікова, Н.Е. Луговська, Е.В. Луговськой, С.В. Комісаренко // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2013. — № 10. — С. 170–175. — Бібліогр.: 12 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | Уточнено локалiзацiю неоантигенної детермiнанти фiбрину людини в межах його фрагмента Вβ118–134. Порiвняльний аналiз iнгiбiторної дiї пептидiв Вβ109–126 i Вβ121–138
на полiмеризацiю фiбрину та iмуноферментний аналiз зв’язування монАТ I-3с з фiбрином людини, бика, коня, щура та кроля вказали на локалiзацiю епiтопу у фрагментi Вβ126–135 фiбрину людини. На основi бiоiнформативного аналiзу молекул фiбриногену i фiбрину висловлено припущення, що експонування неоантигенної детермiнанти
при переходi фiбриногену у фiбрин вiдбувається внаслiдок ослаблення взаємодiї мiж β-,
α- та γ-ланцюгами у фрагментi суперспiралi, що включає Вβ73–138 дiлянку молекули
фiбрину.
Уточнена локализация неоантигенной детерминанты фибрина человека в пределах его фрагмента Вβ118–134. Сравнительный анализ ингибирующего действия пептидов Вβ109–126
и Вβ121–138 на полимеризацию фибрина и иммуноферментный анализ связывания монАТ
I-3с с фибрином человека, быка, лошади, крысы и кролика указали на локализацию эпитопа во фрагменте Вβ126–135 фибрина человека. На основе биоинформативного анализа молекул фибриногена и фибрина высказано предположение, что экспонирование неоантигенной детерминанты при переходе фибриногена в фибрин происходит вследствие ослабления
взаимодействия между β-, α- и γ-цепями во фрагменте суперспирали, который включает Вβ73–138 участок молекулы фибрина.
Localization of the neoantigenic determinant within Вβ118–134 fragment of human fibrin has been
clarified. Comparative analysis of the inhibitory influence of Bβ109–126 and Bβ121–138 peptides
on fibrin polymerization, immuno-enzyme assay of mAb I-3c to human, bovine, horse, rat and rabbit
fibrins binding indicated the location of epitope within Bβ126–135 part of Bβ118–138 fragment of
a molecule. Based on the bioinformatic analysis of fibrinogen and fibrin molecules, we suggested
that the neoantigenic determinant exposure at the fibrinogen-to-fibrin transition occured due to
weakening the interaction between β-, α-, and γ-chains of the coiled-coil region, including Bβ73–138
fragment of a fibrin molecule.
|
| first_indexed | 2025-11-30T12:38:58Z |
| format | Article |
| fulltext |
УДК 547.962.4;612.115
Л.П. Урвант, Є. М. Макогоненко, М. О. Пидюра,
I.М. Колєснiкова, Н. Е. Луговська,
член-кореспондент НАН України Е. В. Луговськой,
академiк НАН України С. В. Комiсаренко
Локалiзацiя епiтопу фiбринспецифiчного
моноклонального антитiла I-3с у Вβ118–134 фрагментi
фiбрину людини
Уточнено локалiзацiю неоантигенної детермiнанти фiбрину людини в межах його фраг-
мента Вβ118–134. Порiвняльний аналiз iнгiбiторної дiї пептидiв Вβ109–126 i Вβ121–138
на полiмеризацiю фiбрину та iмуноферментний аналiз зв’язування монАТ I-3с з фiб-
рином людини, бика, коня, щура та кроля вказали на локалiзацiю епiтопу у фрагмен-
тi Вβ126–135 фiбрину людини. На основi бiоiнформативного аналiзу молекул фiбрино-
гену i фiбрину висловлено припущення, що експонування неоантигенної детермiнанти
при переходi фiбриногену у фiбрин вiдбувається внаслiдок ослаблення взаємодiї мiж β-,
α- та γ-ланцюгами у фрагментi суперспiралi, що включає Вβ73–138 дiлянку молекули
фiбрину.
Ранiше нами було встановлено, що епiтоп фiбринспецифiчного моноклонального антитiла
(монАТ) I-3с експонується в дiлянцi Вβ118–134 фiбрину [1]. Було виявлено, що експозицiя
епiтопу монАТ I-3с пов’язана зi структурними перетвореннями в Е-регiонi i суперспiральнiй
дiлянцi молекули фiбриногену пiсля вiдщеплення фiбринопептидiв А у процесi трансфор-
мацiї її у фiбрин [2]. Оскiльки дiлянка Вβ118–134 має великий для епiтопу розмiр, ми
ставили за мету бiльш точно локалiзувати епiтоп монАТ I-3с та дослiдити механiзм його
експонування.
Фiбриноген людини й бика отримували з плазми кровi людини i бика шляхом фракцiйно-
го висолювання сульфатом натрiю [3], фiбриноген коня використовували виробництва фiр-
ми “Sigma”. Тромбiн видiляли за методом Fenton [4]. Пептиди QTSSSSQFVMVLLKDLWQ
та LKDLWQKRQKQVKDNENV, якi вiдповiдають Вβ109–126 та Вβ121–138 послiдовностi
молекули фiбрину, були синтезованi в лабораторiї хiмiї пептидiв Iнституту молекулярної
бiологiї iм. О.В. Енгельгарда РАН.
Забiр кровi кроля проводили з вушної вени за допомогою катетера. Кров щура лiнiї
Wistar отримували з яремної вени пiсля декапiтацiї. Свiжоотриману кров кроля та щура
одразу змiшували з антикоагулянтом (0,02 М ε-АКК та 3,8% цитрат Na) у спiввiдношен-
нi 9 : 1. Плазму отримували шляхом центрифугування кровi при 1500 об/хв протягом 15 хв.
До плазми додавали тромбiн до концентрацiї 1 NIH/мл i витримували протягом 30 хв.
Сформований фiбриновий згусток вимотували за допомогою скляної палички, промивали
в 0,15 М NaCl та розчиняли в 20 мМ оцтовiй кислотi.
Електрофорез у полiакриламiдному гелi в присутностi SDS здiйнювали за методом
Laemmli [5].
© Л.П. Урвант, Є. М. Макогоненко, М. О. Пидюра, I.М. Колєснiкова, Н.Е. Луговська, Е.В. Луговськой,
С. В. Комiсаренко, 2013
170 ISSN 1025-6415 Reports of the National Academy of Sciences of Ukraine, 2013, №10
Рис. 1. Вплив синтетичних пептидiв Вβ109–126 (1 ) та Вβ121–138 (2 ) на рiзнi стадiї полiмеризацiї фiбри-
ну: швидкiсть самоскладання протофiбрил (а); швидкiсть латеральної асоцiацiї протофiбрил (б ); кiнцеву
мутнiсть згустка (в)
Полiмеризацiю фiбрину дослiджували турбiдиметричним методом при довжинi хвилi
350 нм. Концентрацiя desAB фiбрину становила 0,1 мг/мл. Реакцiю полiмеризацiї проводи-
ли в 0,05 М амонiй-ацетатному буферi, pH 7,4, що мiстив 0,1 М NaCl i 0,1 мМ CaCl2.
Iмуноферментний аналiз проводили у мiкропланшетах (“Sarstedt”, Нiмеччина) за за-
гальною методикою для розчинних бiлкiв [6]. Фiбриноген людини, бика та коня, а також
фiбрин щура та кроля вносили в лунки мiкропланшета по 100 мкл кожного при концентрацiї
0,01 мг/мл в 0,02 М HEPES, pH 7,4, з 0,15 М NaCl. В лунки з фiбриногеном людини, бика та
коня додавали тромбiн до концентрацiї 1 NIH/мл. Зв’язування монАТ I-3с, специфiчних до
фiбрину людини, з фiбринами дослiджуваних видiв тварин детектували, використовуючи
як вториннi антитiла овечi антимишинi IgG-HRP кон’югати.
Комп’ютернi моделi молекул X-фрагментiв фiбриногену та фiбрину було отримано в про-
грамi Modeller [7]. Надалi данi моделi були дослiдженi методом конформацiйного аналiзу
за допомогою програми CONCOORD [8]. Комп’ютерний аналiз моделей та вiзуалiзацiю ви-
конано з використанням програм VMD [9] та PyMol [10].
Вплив пептидiв Вβ109–126 та Вβ121–138 на полiмеризацiю фiбрину людини.
Ранiше нами було показано, що епiтоп для монАТ I-3с i сайт латеральної асоцiацiї прото-
фiбрил фiбрину розташованi в дiлянцi Вβ118–134 фiбрин(ген)у людини. Для бiльш точної
локалiзацiї сайта латеральної асоцiацiї в цiй дiлянцi фiбрину людини дослiджували iнгi-
буючий вплив на полiмеризацiю фiбрину синтетичних пептидiв QTSSSSQFVMVLLKDLWQ
та LKDLWQKRQKQVKDNENV, якi iдентичнi вiдповiдно N-термiнальнiй (Вβ109–126) та
С-термiнальнiй (Вβ121–138) частинi послiдовностi Вβ118–134 молекули фiбрину. За до-
помогою методу турбiдиметричного аналiзу ми встановили, що пептид Вβ109–126 у кон-
центрацiї до 0,5 мМ не впливав на полiмеризацiю фiбрину (рис. 1). Водночас синтетичний
пептид, що вiдповiдав послiдовностi Вβ121–138, при тих самих концентрацiях iнгiбував по-
лiмеризацiю фiбрину. При цьому його дiя на окремi етапи полiмеризацiї була рiзною за
величиною. Так, вiн майже в 2 рази гальмував швидкiсть самоскладання протофiбрил i
в 2 рази зменшував кiнцеву мутнiсть згустка, що вказувало на зменшення товщини фiбрил
(див. рис. 1, а, б ). Найбiльшу гальмiвну дiю цей пептид чинив на швидкiсть латеральної
асоцiацiї протофiбрил, яка зменшувалася бiльш нiж у 20 разiв (див. рис. 1, б ). Пептид
Вβ121–138 також зв’язувався з монАТ I-3с, що свiдчило про iдентичнiсть структури пеп-
тиду в розчинi з його структурним аналогом в молекулi фiбрину [2]. Останнiй результат
свiдчить про те, що дiлянка Вβ121–138 мiстить сайт латеральної взаємодiї протофiбрил
ISSN 1025-6415 Доповiдi Нацiональної академiї наук України, 2013, №10 171
i пiдтверджує отриманi ранiше данi про iнгiбування полiмеризацiї фiбрину монАТ I-3с [1].
Наявнiсть у пептиду Вβ121–138 i монАТ I-3с подiбної iнгiбуючої дiї на процес латеральної
асоцiацiї протофiбрил i вiдсутнiсть такої у пептиду Вβ109–126 дає можливiсть припусти-
ти, що епiтоп моноклонального антитiла i, можливо, сайт латеральної асоцiацiї cформо-
вано тими ж самими амiнокислотними залишками, якi зосередженi в дiлянцi Вβ126–138
фiбрину.
Зв’язування монAТ I-3с з фiбрином людини i тварин. Для визначення бiльш точ-
ної локалiзацiї епiтопу монАТ I-3с у дiлянцi Вβ118–134 фiбрину ми дослiдили зв’язування
монАТ I-3с з фiбрином людини, бика, коня, щура та кроля, первинна структура яких з’я-
сована. За допомогою методу ELISA встановлено, що монАТ I-3с зв’язувалося з фiбрином
людини, кроля й коня, iммобiлiзованими в лунках мiкроплашки, i не зв’язувалося з фiбри-
ном бика i щура (рис. 2). Величина зв’язування монАТ I-3с з фiбрином коня i кроля була
вiдповiдно в 1,2 i 1,4 раза бiльша за таку з фiбрином людини.
Порiвняння первинної структури дiлянки Вβ121–138 фiбрину людини i фiбринiв тва-
рин показало, що найбiльша гомологiя для цих послiдовностей спостерiгається у фрагментi
Вβ118–125. Розглянемо первинну структуру Вβ121–138 дiлянки фiбрину людини i гомоло-
гiчних їй дiлянок фiбрину кроля, коня, щура та бика:
Очевидно, що дiлянка Вβ118–125 не є важливою для взаємодiї монАТ I-3с з фiбрином.
Навпаки, в дiлянцi Вβ126–138 фiбрину людини мають мiсце вiдмiнностi в амiнокислотних
послiдовностях фiбринiв, якi зв’язують i не зв’язують монАТ I-3с. Провiдну роль у процесi
зв’язування монАТ I-3с зi своїм епiтопом, iмовiрно, вiдiграє К130, який присутнiй у фiб-
ринi людини, кроля та коня i замiщений у фiбринi бика та щура на аспарагiн та аланiн
вiдповiдно. Важливими для зв’язування монАТ I-3с можуть бути також К127, R128, Q131,
K133, D134 i N135 амiнокислотнi залишки, положення яких у фiбринi людини, коня i кроля
повнiстю збiгаються. Це пiдтверджує припущення про локалiзацiю епiтопу в дiлянцi Вβ126–
135 фiбрину. Оскiльки дiлянка Вβ126–138 утворює α-спiраль, то висловлене припущення
узгоджується з тим фактом, що вказанi амiнокислотнi залишки розташованi на поверхнi
α-спiралi, оберненiй до водного середовища, що оточує молекулу, i є типовим для взаємодiї
антиген–антитiло (рис. 3, б ).
Механiзм експозицiї неоантигенної детермiнанти в ходi трансформацiї фiб-
риногену у фiбрин. Механiзм експонування неоантигенної детермiнанти, до якої були
отриманi фiбринспецифiчнi монАТ I-3с, дослiджено з використанням комп’ютерного мо-
делювання структури молекули фiбриногену i фiбрину [11, 12]. На основi структурного
аналiзу дiлянки Вβ126–138 в моделях фiбриногену i фiбрину, проведеного iз застосува-
нням методу конформацiйної динамiки CONCOORD, показано, що в молекулi фiбрино-
гену амiнокислотнi залишки D134 i N135, а також K130 екранованi сусiдньою частиною
172 ISSN 1025-6415 Reports of the National Academy of Sciences of Ukraine, 2013, №10
Рис. 2. Iмуноферментний аналiз зв’язування монАТ I-3с з фiбрином людини i рiзних видiв тварин, iммо-
бiлiзованим у лунках мiкроплашки (а). Електрофоретичний аналiз (б ) фiбриногену людини (1 ), бика (2 ),
коня (3 ) i фiбрину щура (4 ), кроля (5 ) у вiдновлюючих дисульфiднi зв’язки умовах. М — маркери молеку-
лярної маси
α-спiралi Вβ137–140 (див. рис. 3, б ). З рисунка видно, що в цьому мiсцi iснує перегин
в α-спiралi Вβ-ланцюга. Було визначено та порiвняно доступнiсть амiнокислотних зали-
шкiв Вβ126–138 для розчинника (води) у молекулах фiбриногену та фiбрину пiд час кон-
формацiйної динамiки (див. рис. 3, а). Пiсля трансформацiї фiбриногену у фiбрин, що
iнiцiюється вiдщепленням фiбринопептидiв А [1], доступнiсть до розчинника амiнокисло-
тних залишкiв Вβ126–128 у N-кiнцевiй частинi дiлянки зменшується, а в центральнiй —
Вβ129–133 i С-кiнцевiй частинi — Вβ134–136 вона збiльшується (див. рис. 3, а). Це вказує
на те, що в молекулi фiбрину вiдбуваються конформацiйнi змiни, направленi на випрям-
лення перегину α-спiралi в дiлянцi Вβ126–135 у напрямку розчинника, що, в свою чергу,
призводить до змiни доступностi до розчинника радикалiв амiнокислот, форми поверхнi
дiлянки, перерозподiлу зарядiв i, як наслiдок, формування неоантигенної детермiнанти
монАТ I-3с.
Для з’ясування можливої причини змiни конформацiї α-спiралi дiлянки Вβ121–138 фiб-
рину за допомогою програми VMD було проведено комп’ютерний аналiз ймовiрностi утво-
рення нековалентних зв’язкiв мiж амiнокислотними залишками пар ланцюгiв β–α, β–γ та
α–γ фiбриногену i фiбрину в дiлянцi суперспiралi, яка вiдповiдає областi Вβ73–138 мо-
лекули (рис. 4). Виявлено, що ймовiрнiсть мiжланцюгової взаємодiї в парах β–α та β–γ
зменшується на 14 та 15% вiдповiдно, а в парi α–γ — зростає на 36% (див. рис. 4). Цi
данi вказують на послаблення взаємодiї мiж β-, α- та γ-ланцюгами фiбрину, що може при-
зводити до змiни конформацiї в Вβ126–135 дiлянцi α-спiралi Вβ-ланцюга молекули фiб-
рину.
ISSN 1025-6415 Доповiдi Нацiональної академiї наук України, 2013, №10 173
Рис. 3. Зміна доступності до розчинника поверхні амінокислотних залишків ділянки Вβ126–138
молекули фібриногену до і після її трансформації у молекулу фібрину (а). Атомна модель поверхні
та поліпептидного ланцюга ділянки Вβ126–138 в молекулі фібриногену до і після її трансформації
у молекулу фібрину (б). Синім зображено епітоп монАТ І-3с, вишневим — ділянка, що, ймовірно,
частково екранує даний епітоп
Рис. 4. Ймовірність утворення нековалентних зв’язків між амінокислотними залишками β і α, β і
γ та α і γ ланцюгів у молекулі фібриногену до і після її трансформації у фібрин в області
суперспіралі, яка включає Вβ73–138 ділянку молекули
Таким чином, отриманi нами данi вказують на те, що неоантигенна детермiнанта, до
якої отримано фiбринспецифiчне монАТ I-3с, i пов’язаний з нею сайт латеральної асоцiацiї
протофiбрил розташованi в дiлянцi Вβ126–135 фiбрину.
1. Lugovskoy E.V., Gritsenko P.G., Kolesnikova I.N. et al. A neoantigenic determinant in coiled coil region
of human fibrin β-chain // Thromb. Res. – 2009. – 123, No 5. – P. 765–770.
2. Урвант Л.П., Макогоненко Є.М., Березницький Г.К. та iн. Вiдщеплення фiбринопептиду А ви-
кликає структурнi перебудови в 118–138 дiлянцi Вβ-ланцюга молекули фiбрин(оген)у // Доп. НАН
України. – 2012. – № 7. – С. 170–175.
3. Варецька Т.В. Мiкрогетерогеннiсть фiбриногену. Крiофiбриноген // Укр. бiохiм. журн. – 1960. – 32,
№ 1. – С. 13–24.
4. Thompson A.R., Enfield D. L., Ericsson L.H. et al. Human thrombin: partial primary structure // Arch.
Biochem. Biophys. – 1977. – 178, No 2. – P. 356–367.
5. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 //
Nature. – 1970. – 227, No 5259. – P. 680–685.
6. Harlow E., Lane D. Antibodies. A laboratory manual. – New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. –
726 p.
7. Eswar N., Webb B., Marti-Renom M.A. et al. Comparative protein structure modelling using Modeller //
Curr. Protoc. Bioinformatics. – 2006. – Chapter 5, Unit 5.6.
8. de Groot B. L., van Aalten D.M., Scheek R.M. et al. Prediction of protein conformational freedom from
distance constraints // Proteins. – 1997. – 29, No 2. – P. 240–251.
9. Humphrey W., Dalke A., Schulten K. VMD: visual molecular dynamics // J. Mol. Graph. – 1996. – 14,
No 1. – P. 33–38.
10. DeLano W.L. The PyMOL Molecular Graphics System. – San Carlos, CA: DeLano Scientific, 2002.
11. Yang Z., Mochalkin I., Doolittle R. F. A model of fibrin formation based on crystal structures of fibrinogen
and fibrin fragments complexed with synthetic peptides // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2000. – 97,
No 26. – P. 14156–14161.
12. Kollman J.M., Pandi L., Sawaya M.R. et al. Crystal structure of human fibrinogen // Biochemistry. –
2009. – 48, No 18. – P. 3877–3886.
Надiйшло до редакцiї 23.04.2013Iнститут бiохiмiї iм. О.В. Палладiна
НАН України, Київ
Л.П. Урвант, Е.М. Макогоненко, Н.А. Пыдюра, И.Н. Колесникова,
Н.Э. Луговская, член-корреспондент НАН Украины Э.В. Луговской,
академик НАН Украины С.В. Комисаренко
Локализация эпитопа фибринспецифического моноклонального
антитела I-3с в Вβ118–134 фрагменте фибрина человека
Уточнена локализация неоантигенной детерминанты фибрина человека в пределах его фраг-
мента Вβ118–134. Сравнительный анализ ингибирующего действия пептидов Вβ109–126
и Вβ121–138 на полимеризацию фибрина и иммуноферментный анализ связывания монАТ
I-3с с фибрином человека, быка, лошади, крысы и кролика указали на локализацию эпито-
па во фрагменте Вβ126–135 фибрина человека. На основе биоинформативного анализа мо-
лекул фибриногена и фибрина высказано предположение, что экспонирование неоантиген-
ной детерминанты при переходе фибриногена в фибрин происходит вследствие ослабления
взаимодействия между β-, α- и γ-цепями во фрагменте суперспирали, который включает
Вβ73–138 участок молекулы фибрина.
174 ISSN 1025-6415 Reports of the National Academy of Sciences of Ukraine, 2013, №10
L.P. Urvant, E.M. Makogonenko, N.A. Pydura, I.N. Kolesnikova,
N. E. Lugovskaya, Corresponding Member of the NAS of Ukraine E. V. Lugovskoi,
Academician of the NAS of Ukraine S.V. Komisarenko
Localization of epitope of fibrin specific monoclonal antibody I-3c
within Bβ118–134 fragment of human fibrin
Localization of the neoantigenic determinant within Вβ118–134 fragment of human fibrin has been
clarified. Comparative analysis of the inhibitory influence of Bβ109–126 and Bβ121–138 peptides
on fibrin polymerization, immuno-enzyme assay of mAb I-3c to human, bovine, horse, rat and rabbit
fibrins binding indicated the location of epitope within Bβ126–135 part of Bβ118–138 fragment of
a molecule. Based on the bioinformatic analysis of fibrinogen and fibrin molecules, we suggested
that the neoantigenic determinant exposure at the fibrinogen-to-fibrin transition occured due to
weakening the interaction between β-, α-, and γ-chains of the coiled-coil region, including Bβ73–138
fragment of a fibrin molecule.
ISSN 1025-6415 Доповiдi Нацiональної академiї наук України, 2013, №10 175
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-86204 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-30T12:38:58Z |
| publishDate | 2013 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Урвант, Л.П. Макогоненко, Є.М. Пидюра, М.О. Колєснікова, І.М. Луговська, Н.Е. Луговськой, Е.В. Комісаренко, С.В. 2015-09-09T17:18:43Z 2015-09-09T17:18:43Z 2013 Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини / Л.П. Урвант, Є.М. Макогоненко, М.О. Пидюра, І.М. Колєснікова, Н.Е. Луговська, Е.В. Луговськой, С.В. Комісаренко // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2013. — № 10. — С. 170–175. — Бібліогр.: 12 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/86204 547.962.4;612.115 Уточнено локалiзацiю неоантигенної детермiнанти фiбрину людини в межах його фрагмента Вβ118–134. Порiвняльний аналiз iнгiбiторної дiї пептидiв Вβ109–126 i Вβ121–138 на полiмеризацiю фiбрину та iмуноферментний аналiз зв’язування монАТ I-3с з фiбрином людини, бика, коня, щура та кроля вказали на локалiзацiю епiтопу у фрагментi Вβ126–135 фiбрину людини. На основi бiоiнформативного аналiзу молекул фiбриногену i фiбрину висловлено припущення, що експонування неоантигенної детермiнанти при переходi фiбриногену у фiбрин вiдбувається внаслiдок ослаблення взаємодiї мiж β-, α- та γ-ланцюгами у фрагментi суперспiралi, що включає Вβ73–138 дiлянку молекули фiбрину. Уточнена локализация неоантигенной детерминанты фибрина человека в пределах его фрагмента Вβ118–134. Сравнительный анализ ингибирующего действия пептидов Вβ109–126 и Вβ121–138 на полимеризацию фибрина и иммуноферментный анализ связывания монАТ I-3с с фибрином человека, быка, лошади, крысы и кролика указали на локализацию эпитопа во фрагменте Вβ126–135 фибрина человека. На основе биоинформативного анализа молекул фибриногена и фибрина высказано предположение, что экспонирование неоантигенной детерминанты при переходе фибриногена в фибрин происходит вследствие ослабления взаимодействия между β-, α- и γ-цепями во фрагменте суперспирали, который включает Вβ73–138 участок молекулы фибрина. Localization of the neoantigenic determinant within Вβ118–134 fragment of human fibrin has been clarified. Comparative analysis of the inhibitory influence of Bβ109–126 and Bβ121–138 peptides on fibrin polymerization, immuno-enzyme assay of mAb I-3c to human, bovine, horse, rat and rabbit fibrins binding indicated the location of epitope within Bβ126–135 part of Bβ118–138 fragment of a molecule. Based on the bioinformatic analysis of fibrinogen and fibrin molecules, we suggested that the neoantigenic determinant exposure at the fibrinogen-to-fibrin transition occured due to weakening the interaction between β-, α-, and γ-chains of the coiled-coil region, including Bβ73–138 fragment of a fibrin molecule. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біохімія Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини Локализация эпитопа фибринспецифического моноклонального антитела I-3с в Вβ118–134 фрагменте фибрина человека Localization of epitope of fibrin specific monoclonal antibody I-3c within Bβ118–134 fragment of human fibrin Article published earlier |
| spellingShingle | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини Урвант, Л.П. Макогоненко, Є.М. Пидюра, М.О. Колєснікова, І.М. Луговська, Н.Е. Луговськой, Е.В. Комісаренко, С.В. Біохімія |
| title | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| title_alt | Локализация эпитопа фибринспецифического моноклонального антитела I-3с в Вβ118–134 фрагменте фибрина человека Localization of epitope of fibrin specific monoclonal antibody I-3c within Bβ118–134 fragment of human fibrin |
| title_full | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| title_fullStr | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| title_full_unstemmed | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| title_short | Локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла І-3с у Вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| title_sort | локалізація епітопу фібринспецифічного моноклонального антитіла і-3с у вβ118–134 фрагменті фібрину людини |
| topic | Біохімія |
| topic_facet | Біохімія |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/86204 |
| work_keys_str_mv | AT urvantlp lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT makogonenkoêm lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT pidûramo lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT kolêsníkovaím lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT lugovsʹkane lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT lugovsʹkoiev lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT komísarenkosv lokalízacíâepítopufíbrinspecifíčnogomonoklonalʹnogoantitílaí3suvβ118134fragmentífíbrinulûdini AT urvantlp lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT makogonenkoêm lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT pidûramo lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT kolêsníkovaím lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT lugovsʹkane lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT lugovsʹkoiev lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT komísarenkosv lokalizaciâépitopafibrinspecifičeskogomonoklonalʹnogoantitelai3svvβ118134fragmentefibrinačeloveka AT urvantlp localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT makogonenkoêm localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT pidûramo localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT kolêsníkovaím localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT lugovsʹkane localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT lugovsʹkoiev localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin AT komísarenkosv localizationofepitopeoffibrinspecificmonoclonalantibodyi3cwithinbβ118134fragmentofhumanfibrin |