Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep.
Дiлянки геному, що кодують 5S рРНК (5S рДНК), присутнi у всiх еукарiотичних органiзмiв i являють собою привабливу модель для дослiдження механiзмiв молекулярної
 еволюцiї тандемно органiзованих повторюваних послiдовностей у рiзних таксономiчних
 групах. З метою з’ясування особливосте...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2014 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87715 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 5. — С. 143-148. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862572948742733824 |
|---|---|
| author | Тинкевич, Ю.О. Волков, Р.А. |
| author_facet | Тинкевич, Ю.О. Волков, Р.А. |
| citation_txt | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 5. — С. 143-148. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | Дiлянки геному, що кодують 5S рРНК (5S рДНК), присутнi у всiх еукарiотичних органiзмiв i являють собою привабливу модель для дослiдження механiзмiв молекулярної
еволюцiї тандемно органiзованих повторюваних послiдовностей у рiзних таксономiчних
групах. З метою з’ясування особливостей молекулярної еволюцiї 5S рДНК у родi Rosa
кiлька повторюваних одиниць рДНК диплоїдного виду R. wichurana (секцiя Synstylae)
було клоновано, сиквеновано та порiвняно з рДНК iнших диплоїдiв: R. nitida (секцiя
Carolinae), R. rugosa (секцiя Cinnamomeae), R. sericea (секцiя Pimpinellifoliae). Показано,
що в геномi R. wichurana наявний лише один варiант 5S рДНК, який мiстить iнтактнi елементи промотору в мiжгенному спейсерi (МГС) та, iмовiрно, є транскрипцiйно
активним. Неочiкувано низький рiвень подiбностi (вiд 52,8 до 57,6%) мiж послiдовностями МГС R. wichurana та трьох iнших диплоїдних видiв свiдчить про те, що для представникiв секцiї Synstylae є характерним новий структурний варiант 5S рДНК i вказує на прискорений темп молекулярної еволюцiї рДНК у цiй секцiї.
Участки генома, кодирующие 5S рРНК (5S рДНК), присутствуют во всех эукариотических
организмах и представляют собой интересную модель для исследования механизмов молекулярной эволюции тандемно организованных повторяющихся последовательностей в различных таксономических группах. С целью уточнения особенностей молекулярной эволюции 5S рДНК в роде Rosa несколько повторяющихся единиц рДНК диплоидного вида R. wichurana (секция Synstylae) были клонированы, сиквенированны и сопоставлены с рДНК других диплоидов: R. nitida (секция Carolinae), R. rugosa (секция Cinnamomeae) и R. sericea (секция Pimpinellifoliae). Показано, что в геноме R. wichurana присутствует только один вариант 5S рДНК, который содержит интактные элементы промотора в межгенном спейсере
(МГС) и, вероятно, является транскрипционно активным. Неожиданно низкий уровень
сходства (от 52,8 до 57,6%) между последовательностями МГС R. wichurana и трех других диплоидных видов свидетельствует о том, что для представителей секции Synstylae
характерен новый структурный вариант 5S рДНК, и указывает на ускоренный темп молекулярной эволюции рДНК в этой секции.
Genomic region encoding 5S rRNA (5S rDNA) is present in all eukaryotic organisms and represents
an attractive model for investigating the mechanisms of molecular evolution of tandem arranged
repeated sequences in various taxonomic groups. In order to clarify the molecular evolution of 5S
rDNA in genus Rosa, several rDNA repeated units of diploid species R. wichurana (sect. Synstylae)
were cloned, sequenced, and compared with rDNA sequences of other diploids: R. nitida (sect.
Carolinae), R. rugosa (sect. Cinnamomeae), and R. sericea (sect. Pimpinellifoliae). It has been
revealed that only one variant of 5S rDNA, which contains intact promoter elements in the intergenic spacer region (IGS) and appears to be transcriptionally active is present in the genome R.
wichurana. A level of sequence similarity (from 52.8 to 57.6%) between the IGS of R. wichurana
and three other diploid species is unusually low, demonstrating that a novel structural variant of 5S
rDNA is characteristic of representatives of sect. Synstylae and suggesting the accelerated rate of rDNA molecular evolution in the section.
|
| first_indexed | 2025-11-26T06:09:17Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-87715 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-26T06:09:17Z |
| publishDate | 2014 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Тинкевич, Ю.О. Волков, Р.А. 2015-10-23T19:14:46Z 2015-10-23T19:14:46Z 2014 Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 5. — С. 143-148. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87715 577.212.3:595.789 Дiлянки геному, що кодують 5S рРНК (5S рДНК), присутнi у всiх еукарiотичних органiзмiв i являють собою привабливу модель для дослiдження механiзмiв молекулярної
 еволюцiї тандемно органiзованих повторюваних послiдовностей у рiзних таксономiчних
 групах. З метою з’ясування особливостей молекулярної еволюцiї 5S рДНК у родi Rosa
 кiлька повторюваних одиниць рДНК диплоїдного виду R. wichurana (секцiя Synstylae)
 було клоновано, сиквеновано та порiвняно з рДНК iнших диплоїдiв: R. nitida (секцiя
 Carolinae), R. rugosa (секцiя Cinnamomeae), R. sericea (секцiя Pimpinellifoliae). Показано,
 що в геномi R. wichurana наявний лише один варiант 5S рДНК, який мiстить iнтактнi елементи промотору в мiжгенному спейсерi (МГС) та, iмовiрно, є транскрипцiйно
 активним. Неочiкувано низький рiвень подiбностi (вiд 52,8 до 57,6%) мiж послiдовностями МГС R. wichurana та трьох iнших диплоїдних видiв свiдчить про те, що для представникiв секцiї Synstylae є характерним новий структурний варiант 5S рДНК i вказує на прискорений темп молекулярної еволюцiї рДНК у цiй секцiї. Участки генома, кодирующие 5S рРНК (5S рДНК), присутствуют во всех эукариотических
 организмах и представляют собой интересную модель для исследования механизмов молекулярной эволюции тандемно организованных повторяющихся последовательностей в различных таксономических группах. С целью уточнения особенностей молекулярной эволюции 5S рДНК в роде Rosa несколько повторяющихся единиц рДНК диплоидного вида R. wichurana (секция Synstylae) были клонированы, сиквенированны и сопоставлены с рДНК других диплоидов: R. nitida (секция Carolinae), R. rugosa (секция Cinnamomeae) и R. sericea (секция Pimpinellifoliae). Показано, что в геноме R. wichurana присутствует только один вариант 5S рДНК, который содержит интактные элементы промотора в межгенном спейсере
 (МГС) и, вероятно, является транскрипционно активным. Неожиданно низкий уровень
 сходства (от 52,8 до 57,6%) между последовательностями МГС R. wichurana и трех других диплоидных видов свидетельствует о том, что для представителей секции Synstylae
 характерен новый структурный вариант 5S рДНК, и указывает на ускоренный темп молекулярной эволюции рДНК в этой секции. Genomic region encoding 5S rRNA (5S rDNA) is present in all eukaryotic organisms and represents
 an attractive model for investigating the mechanisms of molecular evolution of tandem arranged
 repeated sequences in various taxonomic groups. In order to clarify the molecular evolution of 5S
 rDNA in genus Rosa, several rDNA repeated units of diploid species R. wichurana (sect. Synstylae)
 were cloned, sequenced, and compared with rDNA sequences of other diploids: R. nitida (sect.
 Carolinae), R. rugosa (sect. Cinnamomeae), and R. sericea (sect. Pimpinellifoliae). It has been
 revealed that only one variant of 5S rDNA, which contains intact promoter elements in the intergenic spacer region (IGS) and appears to be transcriptionally active is present in the genome R.
 wichurana. A level of sequence similarity (from 52.8 to 57.6%) between the IGS of R. wichurana
 and three other diploid species is unusually low, demonstrating that a novel structural variant of 5S
 rDNA is characteristic of representatives of sect. Synstylae and suggesting the accelerated rate of rDNA molecular evolution in the section. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біологія Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. Новый структурный клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. Novel structural class of 5S rDNA of Rosa wichurana Crep. Article published earlier |
| spellingShingle | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. Тинкевич, Ю.О. Волков, Р.А. Біологія |
| title | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. |
| title_alt | Новый структурный клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. Novel structural class of 5S rDNA of Rosa wichurana Crep. |
| title_full | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. |
| title_fullStr | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. |
| title_full_unstemmed | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. |
| title_short | Новий структурний клас 5S рДНК Rosa wichurana Crep. |
| title_sort | новий структурний клас 5s рднк rosa wichurana crep. |
| topic | Біологія |
| topic_facet | Біологія |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87715 |
| work_keys_str_mv | AT tinkevičûo noviistrukturniiklas5srdnkrosawichuranacrep AT volkovra noviistrukturniiklas5srdnkrosawichuranacrep AT tinkevičûo novyistrukturnyiklas5srdnkrosawichuranacrep AT volkovra novyistrukturnyiklas5srdnkrosawichuranacrep AT tinkevičûo novelstructuralclassof5srdnaofrosawichuranacrep AT volkovra novelstructuralclassof5srdnaofrosawichuranacrep |