Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383

• Veröffentlicht in: Доповіді НАН України
• Datum: 2014
• Hauptverfasser: Микуляк, В.В., Корнелюк, О.І.
• Format: Artikel
• Sprache: Ukrainisch
• Veröffentlicht: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2014
• Schlagworte: Біофізика
• Online Zugang: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Zitieren: Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.

Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних
 тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Показано, що iнгiбiтор зв’язується в активному центрi ферменту, взаємодiючи з дiлянкою зв’язування тирозину
 та фосфатної групи. SB-219383 не взаємодiє з каталiтичною петлею KMSKS. Ингибитор SB-219383 и его аналоги являются классом потенциальных ингибиторов бактериальных тирозил-тРНК синтетаз. Для исследования динамических фармакофорных
 признаков проведено моделирование молекулярной динамики тирозил-тРНК синтетазы
 эубактерии Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383. Показано, что
 ингибитор связывается в активном центре фермента, взаимодействуя с участком связывания тирозина и фосфатной группы. SB-219383 не взаимодействует с каталитической петлей KMSKS. Inhibitor SB-219383 and its analogues are a class of potential inhibitors of bacterial tyrosyl-tRNA
 synthetases. To study the dynamic pharmacophore features, we have performed molecular dynamics
 simulations of M. tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor. The
 inhibitor binds to the active center of the enzyme interacting with the region of binding of tyrosine
 and a phosphate group. SB-219383 does not interact with the catalytic KMSKS loop.