Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383

Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Пока...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Доповіді НАН України
Datum:2014
Hauptverfasser: Микуляк, В.В., Корнелюк, О.І.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-87830
record_format dspace
spelling Микуляк, В.В.
Корнелюк, О.І.
2015-10-26T17:44:51Z
2015-10-26T17:44:51Z
2014
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
1025-6415
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830
577.32
Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Показано, що iнгiбiтор зв’язується в активному центрi ферменту, взаємодiючи з дiлянкою зв’язування тирозину та фосфатної групи. SB-219383 не взаємодiє з каталiтичною петлею KMSKS.
Ингибитор SB-219383 и его аналоги являются классом потенциальных ингибиторов бактериальных тирозил-тРНК синтетаз. Для исследования динамических фармакофорных признаков проведено моделирование молекулярной динамики тирозил-тРНК синтетазы эубактерии Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383. Показано, что ингибитор связывается в активном центре фермента, взаимодействуя с участком связывания тирозина и фосфатной группы. SB-219383 не взаимодействует с каталитической петлей KMSKS.
Inhibitor SB-219383 and its analogues are a class of potential inhibitors of bacterial tyrosyl-tRNA synthetases. To study the dynamic pharmacophore features, we have performed molecular dynamics simulations of M. tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor. The inhibitor binds to the active center of the enzyme interacting with the region of binding of tyrosine and a phosphate group. SB-219383 does not interact with the catalytic KMSKS loop.
Робота пiдтримана грантом № 15/2013 Державної цiльової науково-технiчної програми впровадження i застосування грiд-технологiй на 2009–2013 рр. та грантом № 49/2013 Програми наукових дослiджень НАН України “Розробка iнтелектуальних суперкомп’ютерних систем сiмейства СКIТ, забезпечення їх ефективного функцiонування та створення iнформацiйних технологiй, сучасного математичного, програмно-технiчного забезпечення для розв’язання складних та надскладних науково-практичних задач (Iнтелект)” на 2013–2015 рр.
uk
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Доповіді НАН України
Біофізика
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
Структура и динамика тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383
Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
spellingShingle Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
Микуляк, В.В.
Корнелюк, О.І.
Біофізика
title_short Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
title_full Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
title_fullStr Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
title_full_unstemmed Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
title_sort структура і динаміка тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383
author Микуляк, В.В.
Корнелюк, О.І.
author_facet Микуляк, В.В.
Корнелюк, О.І.
topic Біофізика
topic_facet Біофізика
publishDate 2014
language Ukrainian
container_title Доповіді НАН України
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
format Article
title_alt Структура и динамика тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383
Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
description Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Показано, що iнгiбiтор зв’язується в активному центрi ферменту, взаємодiючи з дiлянкою зв’язування тирозину та фосфатної групи. SB-219383 не взаємодiє з каталiтичною петлею KMSKS. Ингибитор SB-219383 и его аналоги являются классом потенциальных ингибиторов бактериальных тирозил-тРНК синтетаз. Для исследования динамических фармакофорных признаков проведено моделирование молекулярной динамики тирозил-тРНК синтетазы эубактерии Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383. Показано, что ингибитор связывается в активном центре фермента, взаимодействуя с участком связывания тирозина и фосфатной группы. SB-219383 не взаимодействует с каталитической петлей KMSKS. Inhibitor SB-219383 and its analogues are a class of potential inhibitors of bacterial tyrosyl-tRNA synthetases. To study the dynamic pharmacophore features, we have performed molecular dynamics simulations of M. tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor. The inhibitor binds to the active center of the enzyme interacting with the region of binding of tyrosine and a phosphate group. SB-219383 does not interact with the catalytic KMSKS loop.
issn 1025-6415
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830
citation_txt Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT mikulâkvv strukturaídinamíkatiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383
AT kornelûkoí strukturaídinamíkatiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383
AT mikulâkvv strukturaidinamikatiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383
AT kornelûkoí strukturaidinamikatiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383
AT mikulâkvv structureanddynamicsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitor
AT kornelûkoí structureanddynamicsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitor
first_indexed 2025-12-02T00:15:07Z
last_indexed 2025-12-02T00:15:07Z
_version_ 1850861173649440768