Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Пока...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Datum: | 2014 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainian |
| Veröffentlicht: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2014
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-87830 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Микуляк, В.В. Корнелюк, О.І. 2015-10-26T17:44:51Z 2015-10-26T17:44:51Z 2014 Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830 577.32 Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Показано, що iнгiбiтор зв’язується в активному центрi ферменту, взаємодiючи з дiлянкою зв’язування тирозину та фосфатної групи. SB-219383 не взаємодiє з каталiтичною петлею KMSKS. Ингибитор SB-219383 и его аналоги являются классом потенциальных ингибиторов бактериальных тирозил-тРНК синтетаз. Для исследования динамических фармакофорных признаков проведено моделирование молекулярной динамики тирозил-тРНК синтетазы эубактерии Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383. Показано, что ингибитор связывается в активном центре фермента, взаимодействуя с участком связывания тирозина и фосфатной группы. SB-219383 не взаимодействует с каталитической петлей KMSKS. Inhibitor SB-219383 and its analogues are a class of potential inhibitors of bacterial tyrosyl-tRNA synthetases. To study the dynamic pharmacophore features, we have performed molecular dynamics simulations of M. tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor. The inhibitor binds to the active center of the enzyme interacting with the region of binding of tyrosine and a phosphate group. SB-219383 does not interact with the catalytic KMSKS loop. Робота пiдтримана грантом № 15/2013 Державної цiльової науково-технiчної програми впровадження i застосування грiд-технологiй на 2009–2013 рр. та грантом № 49/2013 Програми наукових дослiджень НАН України “Розробка iнтелектуальних суперкомп’ютерних систем сiмейства СКIТ, забезпечення їх ефективного функцiонування та створення iнформацiйних технологiй, сучасного математичного, програмно-технiчного забезпечення для розв’язання складних та надскладних науково-практичних задач (Iнтелект)” на 2013–2015 рр. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 Структура и динамика тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 |
| spellingShingle |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 Микуляк, В.В. Корнелюк, О.І. Біофізика |
| title_short |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 |
| title_full |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 |
| title_fullStr |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 |
| title_full_unstemmed |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 |
| title_sort |
структура і динаміка тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383 |
| author |
Микуляк, В.В. Корнелюк, О.І. |
| author_facet |
Микуляк, В.В. Корнелюк, О.І. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2014 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Структура и динамика тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor |
| description |
Iнгiбiтор SB-219383 та його аналоги є класом потенцiйних iнгiбiторiв бактерiальних
тирозил-тРНК синтетаз. Для дослiдження динамiчних фармакофорних ознак проведено моделювання молекулярної динамiки тирозил-тРНК синтетази еубактерiї Mycobacterium tuberculosis у комплексi з iнгiбiтором SB-219383. Показано, що iнгiбiтор зв’язується в активному центрi ферменту, взаємодiючи з дiлянкою зв’язування тирозину
та фосфатної групи. SB-219383 не взаємодiє з каталiтичною петлею KMSKS.
Ингибитор SB-219383 и его аналоги являются классом потенциальных ингибиторов бактериальных тирозил-тРНК синтетаз. Для исследования динамических фармакофорных
признаков проведено моделирование молекулярной динамики тирозил-тРНК синтетазы
эубактерии Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383. Показано, что
ингибитор связывается в активном центре фермента, взаимодействуя с участком связывания тирозина и фосфатной группы. SB-219383 не взаимодействует с каталитической петлей KMSKS.
Inhibitor SB-219383 and its analogues are a class of potential inhibitors of bacterial tyrosyl-tRNA
synthetases. To study the dynamic pharmacophore features, we have performed molecular dynamics
simulations of M. tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor. The
inhibitor binds to the active center of the enzyme interacting with the region of binding of tyrosine
and a phosphate group. SB-219383 does not interact with the catalytic KMSKS loop.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87830 |
| citation_txt |
Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 / В.В. Микуляк, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 6. — С. 156-159. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT mikulâkvv strukturaídinamíkatiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383 AT kornelûkoí strukturaídinamíkatiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383 AT mikulâkvv strukturaidinamikatiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383 AT kornelûkoí strukturaidinamikatiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383 AT mikulâkvv structureanddynamicsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitor AT kornelûkoí structureanddynamicsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitor |
| first_indexed |
2025-12-02T00:15:07Z |
| last_indexed |
2025-12-02T00:15:07Z |
| _version_ |
1850861173649440768 |