Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade
Вперше квантово-хiмiчними методами на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/ 6-311++G(d,p) отримано повне сiмейство воднево-зв’язаних пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade, метильованих за глiкозидним атомом азоту, яке нараховує 32 структури. Встановлено, що хугстинiвська пара вiдповiдає глобальному мiнiму...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2014 |
| Main Authors: | , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87965 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade / Д.П. Плоднiк, I.С. Войтешенко, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 7. — С. 158-164. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-87965 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Плоднік, Д.П. Войтешенко, І.С. Говорун, Д.М. 2015-11-01T19:43:36Z 2015-11-01T19:43:36Z 2014 Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade / Д.П. Плоднiк, I.С. Войтешенко, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 7. — С. 158-164. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87965 577.3 Вперше квантово-хiмiчними методами на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/ 6-311++G(d,p) отримано повне сiмейство воднево-зв’язаних пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade, метильованих за глiкозидним атомом азоту, яке нараховує 32 структури. Встановлено, що хугстинiвська пара вiдповiдає глобальному мiнiмуму вiльної енергiї Гiббса, поруч з яким у дiапазонi енергiй 0–1,20 ккал/моль знаходяться ще три локальних мiнiмуми обернена хугстинiвська, вотсон-крикiвська та обернена вотсон-крикiвська пара. Їхня сумарна заселенiсть за нормальних умов становить 99,9%. Впервые квантово-химическими методами на уровне теории MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) получено полное семейство водородно-связанных пар оснований ДНК m¹Thy · m⁹Ade, метилированных по гликозидному атому азота, насчитывающее 32 структуры. Установлено, что хугстиновская пара соответствует глобальному минимуму свободной энергии Гиббса, рядом с которым в диапазоне энергий 0–1,20 ккал/моль располагаются еще три локальных минимума обратная хугстиновская, вотсон-криковская и обратная вотсон-криковская пара. Их суммарная заселенность при нормальных условиях составляет 99,9%. The complete family of hydrogen-bound base pairs of DNA m¹Thy · m⁹Ade methylated by glycosidic linkages is obtained by quantum-chemical methods on MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311 ++G(d,p) levels of theory for the first time. The total number is 32 different structures. It is first found that the Hoogsten pair corresponds to the global minimum of the Gibbs free energy, near which three couples (reverse Hoogsten, Watson–Crick, and reverse Watson–Crick ones) in the energy interval 0–1.20 kcal/mol are located. Their combined occupancy under normal conditions is 99.9%. Автори висловлюють щиру вдячнiсть канд. фiз.-мат. наук О.О. Броварець (Iнститут молекулярної бiологiї i генетики НАН України) за увагу до роботи. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade Квантово-химический анализ всех возможных пар оснований ДНК m¹Thy · m⁹Ade Quantum-chemical analysis of all possible m¹Thy · m⁹Ade pairs of DNA bases Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade |
| spellingShingle |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade Плоднік, Д.П. Войтешенко, І.С. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title_short |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade |
| title_full |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade |
| title_fullStr |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade |
| title_full_unstemmed |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade |
| title_sort |
квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ днк m¹thy · m⁹ade |
| author |
Плоднік, Д.П. Войтешенко, І.С. Говорун, Д.М. |
| author_facet |
Плоднік, Д.П. Войтешенко, І.С. Говорун, Д.М. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2014 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Квантово-химический анализ всех возможных пар оснований ДНК m¹Thy · m⁹Ade Quantum-chemical analysis of all possible m¹Thy · m⁹Ade pairs of DNA bases |
| description |
Вперше квантово-хiмiчними методами на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/ 6-311++G(d,p) отримано повне сiмейство воднево-зв’язаних пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade, метильованих за глiкозидним атомом азоту, яке нараховує 32 структури. Встановлено, що хугстинiвська пара вiдповiдає глобальному мiнiмуму вiльної енергiї Гiббса, поруч з яким у дiапазонi енергiй 0–1,20 ккал/моль знаходяться ще три локальних мiнiмуми обернена хугстинiвська, вотсон-крикiвська та обернена вотсон-крикiвська пара. Їхня сумарна заселенiсть за нормальних умов становить 99,9%.
Впервые квантово-химическими методами на уровне теории MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) получено полное семейство водородно-связанных пар оснований ДНК m¹Thy · m⁹Ade, метилированных по гликозидному атому азота, насчитывающее 32 структуры. Установлено, что хугстиновская пара соответствует глобальному минимуму свободной энергии Гиббса, рядом с которым в диапазоне энергий 0–1,20 ккал/моль располагаются еще три локальных минимума обратная хугстиновская, вотсон-криковская и обратная вотсон-криковская пара. Их суммарная заселенность при нормальных условиях составляет 99,9%.
The complete family of hydrogen-bound base pairs of DNA m¹Thy · m⁹Ade methylated by glycosidic linkages is obtained by quantum-chemical methods on MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311 ++G(d,p) levels of theory for the first time. The total number is 32 different structures. It is first found that the Hoogsten pair corresponds to the global minimum of the Gibbs free energy, near which three couples (reverse Hoogsten, Watson–Crick, and reverse Watson–Crick ones) in the energy interval 0–1.20 kcal/mol are located. Their combined occupancy under normal conditions is 99.9%.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/87965 |
| citation_txt |
Квантово-хімічний аналіз усіх можливих пар основ ДНК m¹Thy · m⁹Ade / Д.П. Плоднiк, I.С. Войтешенко, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 7. — С. 158-164. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT plodníkdp kvantovohímíčniianalízusíhmožlivihparosnovdnkm1thym9ade AT voitešenkoís kvantovohímíčniianalízusíhmožlivihparosnovdnkm1thym9ade AT govorundm kvantovohímíčniianalízusíhmožlivihparosnovdnkm1thym9ade AT plodníkdp kvantovohimičeskiianalizvsehvozmožnyhparosnovaniidnkm1thym9ade AT voitešenkoís kvantovohimičeskiianalizvsehvozmožnyhparosnovaniidnkm1thym9ade AT govorundm kvantovohimičeskiianalizvsehvozmožnyhparosnovaniidnkm1thym9ade AT plodníkdp quantumchemicalanalysisofallpossiblem1thym9adepairsofdnabases AT voitešenkoís quantumchemicalanalysisofallpossiblem1thym9adepairsofdnabases AT govorundm quantumchemicalanalysisofallpossiblem1thym9adepairsofdnabases |
| first_indexed |
2025-12-07T15:15:28Z |
| last_indexed |
2025-12-07T15:15:28Z |
| _version_ |
1850863023163441152 |