Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) є одним з ключових
 ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування повинно iстотно стримувати рiст патогенних бактерiй в органiзмi хазяїна. MtTyrRS та TyrRS людини не здатнi до перехресного розпiзнавання та ам...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Дата: | 2014 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2014
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/88453 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 / В.В. Микуляк, I.Я. Дубей, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 10. — С. 167-174. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862741033005088768 |
|---|---|
| author | Микуляк, В.В. Дубей, І.Я. Корнелюк, О.І. |
| author_facet | Микуляк, В.В. Дубей, І.Я. Корнелюк, О.І. |
| citation_txt | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 / В.В. Микуляк, I.Я. Дубей, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 10. — С. 167-174. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) є одним з ключових
ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування повинно iстотно стримувати рiст патогенних бактерiй в органiзмi хазяїна. MtTyrRS та TyrRS людини не здатнi до перехресного розпiзнавання та амiноацилування вiдповiдних тРНК^Tyr,
тому специфiчнi iнгiбiтори MtTyrRS повиннi бути не токсичними для людини. Взаємодiя iнгiбiтора з каталiтичною KMSKS-подiбною петлею MtTyrRS повинна значно
пiдвищити його афiннiсть до ферменту. З урахуванням цього проведено дизайн нових
iнгiбiторiв MtTyrRS на основi структури вiдомого iнгiбiтора SB-219383. Модифiкацiя
здiйснювалася таким чином, щоб забезпечити взаємодiю iнгiбiторiв iз каталiтичною петлею ферменту. Показано, що змодельованi нами iнгiбiтори взаємодiють з каталiтичною петлею протягом усього часу динамiки MtTyrRS (100 нс).
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) является одним из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование должно существенно сдерживать рост патогенных бактерий в организме хозяина. MtTyrRS
и TyrRS человека не способны к перекрестному распознаванию и аминоацилированию соответствующих тРНК^Tyr, поэтому специфические ингибиторы MtTyrRS должны быть не
токсичными для человека. Взаимодействие ингибитора с каталитической KMSKS-подобной петлей MtTyrRS должно существенно повысить его аффинность к ферменту. С учетом этого проведен дизайн новых ингибиторов MtTyrRS на основе структуры известного
ингибитора SB-219383. Модификация осуществлялась таким образом, чтобы обеспечить
взаимодействие ингибиторов с каталитической петлей фермента. Показано, что смоделированные нами ингибиторы взаимодействуют с каталитической петлей на протяжении всего времени динамики MtTyrRS (100 нс).
Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the
pre-ribosomal protein synthesis step and its inhibition should significantly suppress the growth of
pathogenic bacteria in the host body. MtTyrRS and human TyrRS are not able to cross-recognition
and aminoacylation of cognate tRNA^Tyr, therefore the specific inhibitors of MtTyrRS should not
be toxic to human body. Interactions between the inhibitor and the KMSKS-like catalytic loop of
MtTyrRS should significantly increase its affinity to the enzyme. We have performed the design of
new inhibitors of MtTyrRS based on the structure of the known SB-219383 inhibitor. We modified
the inhibitor in order to allow its interactions with the catalytic loop of MtTyrRS. The 100-ns
dynamics of MtTyrRS reveals that the proposed inhibitors interact with the catalytic loop during
the simulation.
|
| first_indexed | 2025-12-07T20:17:20Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-88453 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T20:17:20Z |
| publishDate | 2014 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Микуляк, В.В. Дубей, І.Я. Корнелюк, О.І. 2015-11-14T15:54:04Z 2015-11-14T15:54:04Z 2014 Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 / В.В. Микуляк, I.Я. Дубей, О.I. Корнелюк // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2014. — № 10. — С. 167-174. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/88453 577.32 Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) є одним з ключових
 ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування повинно iстотно стримувати рiст патогенних бактерiй в органiзмi хазяїна. MtTyrRS та TyrRS людини не здатнi до перехресного розпiзнавання та амiноацилування вiдповiдних тРНК^Tyr,
 тому специфiчнi iнгiбiтори MtTyrRS повиннi бути не токсичними для людини. Взаємодiя iнгiбiтора з каталiтичною KMSKS-подiбною петлею MtTyrRS повинна значно
 пiдвищити його афiннiсть до ферменту. З урахуванням цього проведено дизайн нових
 iнгiбiторiв MtTyrRS на основi структури вiдомого iнгiбiтора SB-219383. Модифiкацiя
 здiйснювалася таким чином, щоб забезпечити взаємодiю iнгiбiторiв iз каталiтичною петлею ферменту. Показано, що змодельованi нами iнгiбiтори взаємодiють з каталiтичною петлею протягом усього часу динамiки MtTyrRS (100 нс). Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) является одним из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование должно существенно сдерживать рост патогенных бактерий в организме хозяина. MtTyrRS
 и TyrRS человека не способны к перекрестному распознаванию и аминоацилированию соответствующих тРНК^Tyr, поэтому специфические ингибиторы MtTyrRS должны быть не
 токсичными для человека. Взаимодействие ингибитора с каталитической KMSKS-подобной петлей MtTyrRS должно существенно повысить его аффинность к ферменту. С учетом этого проведен дизайн новых ингибиторов MtTyrRS на основе структуры известного
 ингибитора SB-219383. Модификация осуществлялась таким образом, чтобы обеспечить
 взаимодействие ингибиторов с каталитической петлей фермента. Показано, что смоделированные нами ингибиторы взаимодействуют с каталитической петлей на протяжении всего времени динамики MtTyrRS (100 нс). Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the
 pre-ribosomal protein synthesis step and its inhibition should significantly suppress the growth of
 pathogenic bacteria in the host body. MtTyrRS and human TyrRS are not able to cross-recognition
 and aminoacylation of cognate tRNA^Tyr, therefore the specific inhibitors of MtTyrRS should not
 be toxic to human body. Interactions between the inhibitor and the KMSKS-like catalytic loop of
 MtTyrRS should significantly increase its affinity to the enzyme. We have performed the design of
 new inhibitors of MtTyrRS based on the structure of the known SB-219383 inhibitor. We modified
 the inhibitor in order to allow its interactions with the catalytic loop of MtTyrRS. The 100-ns
 dynamics of MtTyrRS reveals that the proposed inhibitors interact with the catalytic loop during
 the simulation. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 Дизайн ингибиторов активного центра тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis на основе ингибитора SB-219383 The design of active site inhibitors of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase based on SB-219383 inhibitor Article published earlier |
| spellingShingle | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 Микуляк, В.В. Дубей, І.Я. Корнелюк, О.І. Біофізика |
| title | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 |
| title_alt | Дизайн ингибиторов активного центра тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis на основе ингибитора SB-219383 The design of active site inhibitors of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase based on SB-219383 inhibitor |
| title_full | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 |
| title_fullStr | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 |
| title_full_unstemmed | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 |
| title_short | Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383 |
| title_sort | дизайн інгібіторів активного центру тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора sb-219383 |
| topic | Біофізика |
| topic_facet | Біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/88453 |
| work_keys_str_mv | AT mikulâkvv dizainíngíbítorívaktivnogocentrutiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisnaosnovííngíbítorasb219383 AT dubeiíâ dizainíngíbítorívaktivnogocentrutiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisnaosnovííngíbítorasb219383 AT kornelûkoí dizainíngíbítorívaktivnogocentrutiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisnaosnovííngíbítorasb219383 AT mikulâkvv dizainingibitorovaktivnogocentratiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisnaosnoveingibitorasb219383 AT dubeiíâ dizainingibitorovaktivnogocentratiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisnaosnoveingibitorasb219383 AT kornelûkoí dizainingibitorovaktivnogocentratiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisnaosnoveingibitorasb219383 AT mikulâkvv thedesignofactivesiteinhibitorsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetasebasedonsb219383inhibitor AT dubeiíâ thedesignofactivesiteinhibitorsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetasebasedonsb219383inhibitor AT kornelûkoí thedesignofactivesiteinhibitorsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetasebasedonsb219383inhibitor |