Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу

Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу

Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Автора...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Доповіді НАН України
Date:2016
Main Authors: Микуляк, В.В., Войтешенко, І.С., Корнелюк, О.І.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2016
Subjects:
Біофізика
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-98145
record_format dspace
spelling Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
2016-04-09T11:49:22Z
2016-04-09T11:49:22Z
2016
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
1025-6415
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145
577.32
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв.
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров.
Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters.
uk
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Доповіді НАН України
Біофізика
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
Моделирование динамики тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 с использованием QM/MM подхода
MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
spellingShingle Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
Біофізика
title_short Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_full Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_fullStr Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_full_unstemmed Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_sort моделювання динаміки тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383 з використанням qm/mm підходу
author Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
author_facet Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
topic Біофізика
topic_facet Біофізика
publishDate 2016
language Ukrainian
container_title Доповіді НАН України
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
format Article
title_alt Моделирование динамики тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 с использованием QM/MM подхода
MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach
description Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв. Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров. Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters.
issn 1025-6415
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145
citation_txt Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT mikulâkvv modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
AT voitešenkoís modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
AT kornelûkoí modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
AT mikulâkvv modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda
AT voitešenkoís modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda
AT kornelûkoí modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda
AT mikulâkvv mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach
AT voitešenkoís mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach
AT kornelûkoí mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach
first_indexed 2025-12-07T20:02:25Z
last_indexed 2025-12-07T20:02:25Z
_version_ 1850881076320272384

Similar Items