Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених
 iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Дата: | 2016 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2016
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862737921312817152 |
|---|---|
| author | Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. |
| author_facet | Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. |
| citation_txt | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених
iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню
їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв.
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации
водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров.
Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at
the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the
development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors
is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and
MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention
has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters.
|
| first_indexed | 2025-12-07T20:02:25Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-98145 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T20:02:25Z |
| publishDate | 2016 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. 2016-04-09T11:49:22Z 2016-04-09T11:49:22Z 2016 Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145 577.32 Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених
 iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню
 їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв. Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации
 водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров. Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at
 the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the
 development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors
 is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and
 MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention
 has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу Моделирование динамики тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 с использованием QM/MM подхода MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach Article published earlier |
| spellingShingle | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. Біофізика |
| title | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
| title_alt | Моделирование динамики тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis в комплексе с ингибитором SB-219383 с использованием QM/MM подхода MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach |
| title_full | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
| title_fullStr | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
| title_full_unstemmed | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
| title_short | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
| title_sort | моделювання динаміки тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383 з використанням qm/mm підходу |
| topic | Біофізика |
| topic_facet | Біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/98145 |
| work_keys_str_mv | AT mikulâkvv modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu AT voitešenkoís modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu AT kornelûkoí modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu AT mikulâkvv modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda AT voitešenkoís modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda AT kornelûkoí modelirovaniedinamikitiroziltrnksintetazymycobacteriumtuberculosisvkompleksesingibitoromsb219383sispolʹzovaniemqmmmpodhoda AT mikulâkvv mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach AT voitešenkoís mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach AT kornelûkoí mdsimulationsofmycobacteriumtuberculosistyrosyltrnasynthetaseincomplexwithsb219383inhibitorusingqmmmapproach |