Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження
Вперше на рiвнi квантово-механiчної теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) у вакуумному наближеннi отримано повне сiмейство H-зв’язаних гомоасоцiатiв m⁹Gua·m⁹Gua, яке складається з 57 структур, вiдносна енергiя Гiббса яких знаходиться в дiапазонi 0–17,69 ккал/моль за нормальних умов. Гомоа...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2016 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2016
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/99071 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження / А.М. Глушенков, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2016. — № 3. — С. 98-106. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-99071 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Глушенков, А.М. Говорун, Д.М. 2016-04-22T18:36:16Z 2016-04-22T18:36:16Z 2016 Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження / А.М. Глушенков, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2016. — № 3. — С. 98-106. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/99071 577.332 Вперше на рiвнi квантово-механiчної теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) у вакуумному наближеннi отримано повне сiмейство H-зв’язаних гомоасоцiатiв m⁹Gua·m⁹Gua, яке складається з 57 структур, вiдносна енергiя Гiббса яких знаходиться в дiапазонi 0–17,69 ккал/моль за нормальних умов. Гомоасоцiати стабiлiзуються класичними (NH…N, NH…O, OH…N, OH...O), слабкими (CH...N, CH...O) H-зв’язками, а також ван-дер-ваальсовими контактами. Iз зафiксованих гомоасоцiатiв 11 структур є плоскосиметричними (3 з яких центросиметричнi), 7 структур U-подiбнi, 12 структур мають Г-подiбну неканонiчну геометрiю, 2 структури мають Т-подiбну геометрiю, 20 структур спiралеподiбнi, 3 структури хрестоподiбнi та 2 iстотно непланарнi. Доведено, що метильна група m⁹Gua є донором Н-зв’язування та впливає на енергетичний розподiл гомоасоцiатiв. Показано, що при самоасоцiацiї m⁹Gua його амiногрупа може бути одночасно як донором, так i акцептором H-зв’язку. Встановлено лiнiйну залежнiсть мiж енергiєю H-зв’язкiв CH...O=N та значенням електронної густини у вiдповiдних критичних точках. Впервые на уровне квантово-механической теории MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311+ +G(d,p) в вакуумном приближении получено полное семейство H-связанных гомоассоциатов m⁹Gua·m⁹Gua, состоящее из 57 структур, относительная энергия Гиббса которых находится в диапазоне 0–17,69 ккал/моль при нормальных условиях. Гомоассоциаты стабилизируются классическими (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O), слабыми (CH...N, CH...O) H-связями, а также ван-дер-ваальсовыми контактами. Из зафиксированных гомоассоциа- тов 11 структур являются плоскосимметричными (3 из которых центросимметричны), 7 структур U-образные, 12 структур имеют Г-образную неканоническую геометрию, 2 структуры обладают Т-образной геометрией, 20 структур винтовые, 3 структуры крестообразные и 2 структуры существенно непланарные. Доказано, что метильная группа m⁹Gua является донором H-связывания и влияет на энергетическое распределение гомоассоциатов. Показано, что при самоассоциации m⁹Gua аминогруппа может быть одновременно как донором, так и акцептором H-связи. Установлена линейная зависимость между энергией CH...O=N H-связей и значением электронной плотности в соответствующих критических точках. For the first time on the MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) theory level, the complete family of m⁹Gua·m⁹Gua homoassociates in vacuum, which consists of 57 structures the interval 0–17.69 kcal/mol of relative Gibbs free energies under standard conditions, is obtained. Homoassociates are stabilized through classical (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O) and weak (CH...N, CH...O) H-bonds, and van-der-Waals contacts. The structures of 11 m9Gua·m9Gua homoassociates are planar (3 of them are centrosymmetric), 7 structures are U-shaped, 12 structures have L-shaped noncanonical geometry, 2 structures have T-shaped geometry, 20 structures — spiral, 3 — cross shaped, 2 — significantly non-planar. It is proved that the methyl group of m⁹Gua in position 9 is a donor of H-bonding and influences the energy distribution of homoassociates. It is demonstrated that, during the self-association of m⁹Gua, its amino-group can be simultaneously a donor and an acceptor of an H-bond. A linear relation between the energy of CH...O=N H-bonds and their electron density in corresponding critical bonds is established. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження Полное множество Н-связанных гомоассоциатов 9-метилгуанина с участием мутагенных таутомеров: квантово-механическое исследование Complete set of H-bonded homoassociates of 9-methylguanine with participation of mutagenic tautomers: quantum-mechanical study Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| spellingShingle |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження Глушенков, А.М. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title_short |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| title_full |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| title_fullStr |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| title_full_unstemmed |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| title_sort |
повна множина н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження |
| author |
Глушенков, А.М. Говорун, Д.М. |
| author_facet |
Глушенков, А.М. Говорун, Д.М. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2016 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Полное множество Н-связанных гомоассоциатов 9-метилгуанина с участием мутагенных таутомеров: квантово-механическое исследование Complete set of H-bonded homoassociates of 9-methylguanine with participation of mutagenic tautomers: quantum-mechanical study |
| description |
Вперше на рiвнi квантово-механiчної теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) у вакуумному наближеннi отримано повне сiмейство H-зв’язаних гомоасоцiатiв m⁹Gua·m⁹Gua, яке складається з 57 структур, вiдносна енергiя Гiббса яких знаходиться в дiапазонi 0–17,69 ккал/моль за нормальних умов. Гомоасоцiати стабiлiзуються класичними (NH…N, NH…O, OH…N, OH...O), слабкими (CH...N, CH...O)
H-зв’язками, а також ван-дер-ваальсовими контактами. Iз зафiксованих гомоасоцiатiв 11 структур є плоскосиметричними (3 з яких центросиметричнi), 7 структур U-подiбнi, 12 структур мають Г-подiбну неканонiчну геометрiю, 2 структури мають
Т-подiбну геометрiю, 20 структур спiралеподiбнi, 3 структури хрестоподiбнi та 2 iстотно непланарнi. Доведено, що метильна група m⁹Gua є донором Н-зв’язування та впливає на енергетичний розподiл гомоасоцiатiв. Показано, що при самоасоцiацiї m⁹Gua його амiногрупа може бути одночасно як донором, так i акцептором H-зв’язку. Встановлено лiнiйну залежнiсть мiж енергiєю H-зв’язкiв CH...O=N та значенням електронної густини у вiдповiдних критичних точках.
Впервые на уровне квантово-механической теории MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311+
+G(d,p) в вакуумном приближении получено полное семейство H-связанных гомоассоциатов m⁹Gua·m⁹Gua, состоящее из 57 структур, относительная энергия Гиббса которых
находится в диапазоне 0–17,69 ккал/моль при нормальных условиях. Гомоассоциаты стабилизируются классическими (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O), слабыми (CH...N, CH...O)
H-связями, а также ван-дер-ваальсовыми контактами. Из зафиксированных гомоассоциа-
тов 11 структур являются плоскосимметричными (3 из которых центросимметричны), 7
структур U-образные, 12 структур имеют Г-образную неканоническую геометрию, 2 структуры обладают Т-образной геометрией, 20 структур винтовые, 3 структуры крестообразные и 2 структуры существенно непланарные. Доказано, что метильная группа m⁹Gua является донором H-связывания и влияет на энергетическое распределение гомоассоциатов.
Показано, что при самоассоциации m⁹Gua аминогруппа может быть одновременно как донором, так и акцептором H-связи. Установлена линейная зависимость между энергией
CH...O=N H-связей и значением электронной плотности в соответствующих критических точках.
For the first time on the MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) theory level, the complete
family of m⁹Gua·m⁹Gua homoassociates in vacuum, which consists of 57 structures the interval
0–17.69 kcal/mol of relative Gibbs free energies under standard conditions, is obtained. Homoassociates
are stabilized through classical (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O) and weak (CH...N,
CH...O) H-bonds, and van-der-Waals contacts. The structures of 11 m9Gua·m9Gua homoassociates
are planar (3 of them are centrosymmetric), 7 structures are U-shaped, 12 structures have
L-shaped noncanonical geometry, 2 structures have T-shaped geometry, 20 structures — spiral,
3 — cross shaped, 2 — significantly non-planar. It is proved that the methyl group of m⁹Gua in
position 9 is a donor of H-bonding and influences the energy distribution of homoassociates. It is
demonstrated that, during the self-association of m⁹Gua, its amino-group can be simultaneously a
donor and an acceptor of an H-bond. A linear relation between the energy of CH...O=N H-bonds
and their electron density in corresponding critical bonds is established.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/99071 |
| citation_txt |
Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження / А.М. Глушенков, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2016. — № 3. — С. 98-106. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT glušenkovam povnamnožinanzvâzanihgomoasociativ9metilguaninuzaučastûmutagennihtautomerivkvantovomehaničnedoslidžennâ AT govorundm povnamnožinanzvâzanihgomoasociativ9metilguaninuzaučastûmutagennihtautomerivkvantovomehaničnedoslidžennâ AT glušenkovam polnoemnožestvonsvâzannyhgomoassociatov9metilguaninasučastiemmutagennyhtautomerovkvantovomehaničeskoeissledovanie AT govorundm polnoemnožestvonsvâzannyhgomoassociatov9metilguaninasučastiemmutagennyhtautomerovkvantovomehaničeskoeissledovanie AT glušenkovam completesetofhbondedhomoassociatesof9methylguaninewithparticipationofmutagenictautomersquantummechanicalstudy AT govorundm completesetofhbondedhomoassociatesof9methylguaninewithparticipationofmutagenictautomersquantummechanicalstudy |
| first_indexed |
2025-12-07T15:31:28Z |
| last_indexed |
2025-12-07T15:31:28Z |
| _version_ |
1850864029676863488 |