The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam

The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam

The red alga Eucheuma denticulatum is an economically important food species extensively cultivated in Vietnam. In this study, complementary DNA (cDNA) cloning based on the rapid amplification of cDNA ends (RACE) methods elucidated the full-length sequence of a new lectin-like protein (named EDL)fro...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Datum:2025
Hauptverfasser: Le, Dinh Hung, Vo, Thi Dieu Trang, Hoang, Thi Trang Nguyen, Dinh, Thanh Trung, Ngo, Thi Duy Ngoc, Phan, Thi Hoai Trinh
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: M.G. Kholodny Institute of Botany, NAS of Ukraine 2025
Online Zugang:https://algologia.co.ua/journal/article/view/35.3.194
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Algologia

Institution

Algologia
id oai:algologia.co.ua:article-104
record_format ojs
spelling oai:algologia.co.ua:article-1042025-10-05T12:57:57Z The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam Новий член родини лектинів OAAH з культивованої у В'єтнамі червоної водорості Eucheuma denticulatum Le, Dinh Hung Vo, Thi Dieu Trang Hoang, Thi Trang Nguyen Dinh, Thanh Trung Ngo, Thi Duy Ngoc Phan, Thi Hoai Trinh amino acid sequence carrageenophytes cDNA of lectin-like protein EDL Eucheuma denticulatum амінокислотна послідовність карагенофіти кДНК лектиноподібного білка EDL Eucheuma denticulatum The red alga Eucheuma denticulatum is an economically important food species extensively cultivated in Vietnam. In this study, complementary DNA (cDNA) cloning based on the rapid amplification of cDNA ends (RACE) methods elucidated the full-length sequence of a new lectin-like protein (named EDL)from this alga. The cDNA cloning of thelectin-like protein encoded a polypeptide of 268 amino acids including an initiating methionine. The deduced amino acid sequence of lectin-like protein composed of four tandem repeated domains of about 67 amino acids and sharing 45% sequence identity.The primary structure of the lectin-like protein, EDL, highly resemble with those of the anti-virus and anti-cancer high-mannose N-glycan specific lectins in lower organisms including Oscillatoria agardhii NIES-240 (OAA) from cyanobacterium, Burkholderia oklahomensis EO147 (BOA), Myxococcus xanthus (MBHA) and Pseudomonas fluorescens Pf0-1 (PFL) from proteobacteria, Eucheuma serra (ESA-2), Eucheuma denticulatum (EDA-2), Kappaphycus striatus (KSA-1 and KSA-2), Kappaphycus alvarezii (KAA-1 and KAA-2) and Solieria filiformis (SfL-1 and SfL-2) from carrageenophyte red algae. The high resemblance in structure with anti-virus and anti-cancer lectins suggests that the cultivated red alga E. denticulatum could also be a good source of functional protein (lectin) for application. Червона водорість Eucheuma denticulatum є економічно важливим харчовим продуктом, що широко культивується у В'єтнамі. У цьому дослідженні комплементарне клонування ДНК (кДНК) на основі методів швидкої ампліфікації кінців кДНК (RACE) дозволило з'ясувати повнорозмірну послідовність нового лектиноподібного білка (названого EDL) з цієї водорості. Клонування кДНК лектиноподібного білка кодувало поліпептид з 268 амінокислот, включаючи ініціюючий метіонін. Встановлена амінокислотна послідовність лектиноподібного білка, що складається з чотирьох тандемних повторюваних доменів приблизно з 67 амінокислот і має 45% ідентичності послідовності. Первинна структура лектиноподібного білка EDL дуже схожа на структуру антивірусних і протиракових лектинів з високим вмістом манози N-глікану в нижчих організмах, включаючи Oscillatoria agardhii NIES-240 (OAA) з ціанобактерій, Burkholderia oklahomensis EO147 (BOA), Myxococcus xanthus (MBHA) і Pseudomonas fluorescens Pf0-1 (PFL) з протеобактерій, Eucheuma serra (ESA-2), E. denticulatum (EDA-2), Kappaphycus striatus (KSA-1 і KSA-2), K. alvarezii (KAA-1 і KAA-2) і Solieria filiformis (SfL-1 і SfL-2) з карагенофітових червоних водоростей. Висока схожість у структурі з антивірусними та протираковими лектинами свідчить про те, що культивована червона водорість E. denticulatum також може стати хорошим джерелом функціонального білка (лектину) для медичного застосування. M.G. Kholodny Institute of Botany, NAS of Ukraine 2025-09-20 Article Article application/pdf https://algologia.co.ua/journal/article/view/35.3.194 10.15407/alg35.03.194 Algologia; Vol. 35 No. 3 (2025); 194-209 Альгологiя; Том 35 № 3 (2025); 194-209 Альгология; Том 35 № 3 (2025); 194-209 2413-5984 0868-8540 10.15407/alg35.03 uk https://algologia.co.ua/journal/article/view/35.3.194/116 Copyright (c) 2025 Dinh Hung Le, Thi Dieu Trang Vo, Thi Trang Nguyen Hoang, Thanh Trung Dinh, Thi Duy Ngoc Ngo, Thi Hoai Trinh Phan (Author) https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
institution Algologia
baseUrl_str
datestamp_date 2025-10-05T12:57:57Z
collection OJS
language Ukrainian
topic_facet amino acid sequence
carrageenophytes
cDNA of lectin-like protein
EDL
Eucheuma denticulatum
амінокислотна послідовність
карагенофіти
кДНК лектиноподібного білка
EDL
Eucheuma denticulatum
format Article
author Le, Dinh Hung
Vo, Thi Dieu Trang
Hoang, Thi Trang Nguyen
Dinh, Thanh Trung
Ngo, Thi Duy Ngoc
Phan, Thi Hoai Trinh
spellingShingle Le, Dinh Hung
Vo, Thi Dieu Trang
Hoang, Thi Trang Nguyen
Dinh, Thanh Trung
Ngo, Thi Duy Ngoc
Phan, Thi Hoai Trinh
The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
author_facet Le, Dinh Hung
Vo, Thi Dieu Trang
Hoang, Thi Trang Nguyen
Dinh, Thanh Trung
Ngo, Thi Duy Ngoc
Phan, Thi Hoai Trinh
author_sort Le, Dinh Hung
title The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
title_short The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
title_full The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
title_fullStr The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
title_full_unstemmed The new member of OAAH-family lectins from the cultivated red alga Eucheuma denticulatum in Vietnam
title_sort new member of oaah-family lectins from the cultivated red alga eucheuma denticulatum in vietnam
title_alt Новий член родини лектинів OAAH з культивованої у В'єтнамі червоної водорості Eucheuma denticulatum
description The red alga Eucheuma denticulatum is an economically important food species extensively cultivated in Vietnam. In this study, complementary DNA (cDNA) cloning based on the rapid amplification of cDNA ends (RACE) methods elucidated the full-length sequence of a new lectin-like protein (named EDL)from this alga. The cDNA cloning of thelectin-like protein encoded a polypeptide of 268 amino acids including an initiating methionine. The deduced amino acid sequence of lectin-like protein composed of four tandem repeated domains of about 67 amino acids and sharing 45% sequence identity.The primary structure of the lectin-like protein, EDL, highly resemble with those of the anti-virus and anti-cancer high-mannose N-glycan specific lectins in lower organisms including Oscillatoria agardhii NIES-240 (OAA) from cyanobacterium, Burkholderia oklahomensis EO147 (BOA), Myxococcus xanthus (MBHA) and Pseudomonas fluorescens Pf0-1 (PFL) from proteobacteria, Eucheuma serra (ESA-2), Eucheuma denticulatum (EDA-2), Kappaphycus striatus (KSA-1 and KSA-2), Kappaphycus alvarezii (KAA-1 and KAA-2) and Solieria filiformis (SfL-1 and SfL-2) from carrageenophyte red algae. The high resemblance in structure with anti-virus and anti-cancer lectins suggests that the cultivated red alga E. denticulatum could also be a good source of functional protein (lectin) for application.
publisher M.G. Kholodny Institute of Botany, NAS of Ukraine
publishDate 2025
url https://algologia.co.ua/journal/article/view/35.3.194
work_keys_str_mv AT ledinhhung thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT vothidieutrang thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT hoangthitrangnguyen thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT dinhthanhtrung thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT ngothiduyngoc thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT phanthihoaitrinh thenewmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT ledinhhung novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT vothidieutrang novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT hoangthitrangnguyen novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT dinhthanhtrung novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT ngothiduyngoc novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT phanthihoaitrinh novijčlenrodinilektinívoaahzkulʹtivovanoíuvêtnamíčervonoívodorostíeucheumadenticulatum
AT ledinhhung newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT vothidieutrang newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT hoangthitrangnguyen newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT dinhthanhtrung newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT ngothiduyngoc newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
AT phanthihoaitrinh newmemberofoaahfamilylectinsfromthecultivatedredalgaeucheumadenticulatuminvietnam
first_indexed 2025-09-21T01:06:44Z
last_indexed 2025-10-06T01:16:50Z
_version_ 1850423971279798272

Ähnliche Einträge