Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону
Flexible molecular docking studies for 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridin-2-ones have been performed with the purpose to reveal their potency as enzymes involved in the arachidonic acid (AA) cascade inhibitors: both cyclooxygenase isoforms (COX-1 and COX-2), and microsomal prostaglan...
Gespeichert in:
| Datum: | 2014 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainian |
| Veröffentlicht: |
National University of Pharmacy
2014
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.14.768 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry |
Institution
Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry| id |
oai:ojs.journals.uran.ua:article-115975 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| institution |
Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry |
| baseUrl_str |
|
| datestamp_date |
2018-02-24T10:00:19Z |
| collection |
OJS |
| language |
Ukrainian |
| topic |
тіазоло[4 5-b]піридин-2-они фармакофори віртуальний скринінг докінг докінгові «відбитки пальців» УДК 615.012 547.789 547.642 |
| spellingShingle |
тіазоло[4 5-b]піридин-2-они фармакофори віртуальний скринінг докінг докінгові «відбитки пальців» УДК 615.012 547.789 547.642 Klenina, O. V. Chaban, T. I. Ogurtsov, V. V. Chaban, I. G. Golos, I. Ya. Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| topic_facet |
thiazolo[4 5-b]pyridines pharmacophores virtual screening docking protein-ligand interaction fingerprints UDC 615.012 547.789 547.642 тиазоло[4 5-b]пиридин-2-оны фармакофоры виртуальный скрининг докинг докинговые «отпечатки пальцев» УДК 615.012 547.789 547.642 тіазоло[4 5-b]піридин-2-они фармакофори віртуальний скринінг докінг докінгові «відбитки пальців» УДК 615.012 547.789 547.642 |
| format |
Article |
| author |
Klenina, O. V. Chaban, T. I. Ogurtsov, V. V. Chaban, I. G. Golos, I. Ya. |
| author_facet |
Klenina, O. V. Chaban, T. I. Ogurtsov, V. V. Chaban, I. G. Golos, I. Ya. |
| author_sort |
Klenina, O. V. |
| title |
Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_short |
Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_full |
Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_fullStr |
Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_full_unstemmed |
Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_sort |
моделювання 3d фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону |
| title_alt |
3D Pharmacophore modeling in the molecules of 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridine-2-one derivatives Моделирование 3D фармакофоров в молекулах производных 5,7-диметил-6-фенилазо-3Н-тиазоло[4,5-b]пиридин-2-она |
| description |
Flexible molecular docking studies for 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridin-2-ones have been performed with the purpose to reveal their potency as enzymes involved in the arachidonic acid (AA) cascade inhibitors: both cyclooxygenase isoforms (COX-1 and COX-2), and microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGES-1). The protein-ligand interaction fingerprint (PLIF) tool implemented in MOE software has been used for summarizing the interactions between ligands and the abovementioned enzymes. Receptor interaction fingerprints have been generated from the docked poses of the virtual screening hits with COX-1,2 and mPGES-1 active sites coordinates. 3D pharmacophore models containing two and three points queries as the combination of their structures steric and electronic parameters have been generated and it provides the affinity and inhibitory activity of the novel compounds towards multiply receptors. The analysis of the pharmacophore models obtained indicates the functionality of fused bicyclic thiazolopyridine scaffold which provides the steric placement of at least one of these heterocycles atoms in the respective pharmacophore centres. The fused thiazolo[4,5-b]pyridine-2-one system may be considered as a promosing scaffold for creating diverse combinatorial libraries of potential biologically active substances. The final conclusion has been confirmed by the results of the virtual screening procedures and pharmacophore centres modeling in molecules of novel thiazolo [4,5-b]pyridine-2-one. |
| publisher |
National University of Pharmacy |
| publishDate |
2014 |
| url |
https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.14.768 |
| work_keys_str_mv |
AT kleninaov 3dpharmacophoremodelinginthemoleculesof57dimethyl6phenylazo3hthiazolo45bpyridine2onederivatives AT chabanti 3dpharmacophoremodelinginthemoleculesof57dimethyl6phenylazo3hthiazolo45bpyridine2onederivatives AT ogurtsovvv 3dpharmacophoremodelinginthemoleculesof57dimethyl6phenylazo3hthiazolo45bpyridine2onederivatives AT chabanig 3dpharmacophoremodelinginthemoleculesof57dimethyl6phenylazo3hthiazolo45bpyridine2onederivatives AT golosiya 3dpharmacophoremodelinginthemoleculesof57dimethyl6phenylazo3hthiazolo45bpyridine2onederivatives AT kleninaov modelirovanie3dfarmakoforovvmolekulahproizvodnyh57dimetil6fenilazo3ntiazolo45bpiridin2ona AT chabanti modelirovanie3dfarmakoforovvmolekulahproizvodnyh57dimetil6fenilazo3ntiazolo45bpiridin2ona AT ogurtsovvv modelirovanie3dfarmakoforovvmolekulahproizvodnyh57dimetil6fenilazo3ntiazolo45bpiridin2ona AT chabanig modelirovanie3dfarmakoforovvmolekulahproizvodnyh57dimetil6fenilazo3ntiazolo45bpiridin2ona AT golosiya modelirovanie3dfarmakoforovvmolekulahproizvodnyh57dimetil6fenilazo3ntiazolo45bpiridin2ona AT kleninaov modelûvannâ3dfarmakoforívumolekulahpohídnih57dimetil6fenílazo3ntíazolo45bpíridin2onu AT chabanti modelûvannâ3dfarmakoforívumolekulahpohídnih57dimetil6fenílazo3ntíazolo45bpíridin2onu AT ogurtsovvv modelûvannâ3dfarmakoforívumolekulahpohídnih57dimetil6fenílazo3ntíazolo45bpíridin2onu AT chabanig modelûvannâ3dfarmakoforívumolekulahpohídnih57dimetil6fenílazo3ntíazolo45bpíridin2onu AT golosiya modelûvannâ3dfarmakoforívumolekulahpohídnih57dimetil6fenílazo3ntíazolo45bpíridin2onu |
| first_indexed |
2025-07-17T12:59:10Z |
| last_indexed |
2025-09-24T17:14:28Z |
| _version_ |
1850410984232976384 |
| spelling |
oai:ojs.journals.uran.ua:article-1159752018-02-24T10:00:19Z 3D Pharmacophore modeling in the molecules of 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridine-2-one derivatives Моделирование 3D фармакофоров в молекулах производных 5,7-диметил-6-фенилазо-3Н-тиазоло[4,5-b]пиридин-2-она Моделювання 3D фармакофорів у молекулах похідних 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону Klenina, O. V. Chaban, T. I. Ogurtsov, V. V. Chaban, I. G. Golos, I. Ya. thiazolo[4 5-b]pyridines pharmacophores virtual screening docking protein-ligand interaction fingerprints UDC 615.012 547.789 547.642 тиазоло[4 5-b]пиридин-2-оны фармакофоры виртуальный скрининг докинг докинговые «отпечатки пальцев» УДК 615.012 547.789 547.642 тіазоло[4 5-b]піридин-2-они фармакофори віртуальний скринінг докінг докінгові «відбитки пальців» УДК 615.012 547.789 547.642 Flexible molecular docking studies for 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridin-2-ones have been performed with the purpose to reveal their potency as enzymes involved in the arachidonic acid (AA) cascade inhibitors: both cyclooxygenase isoforms (COX-1 and COX-2), and microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGES-1). The protein-ligand interaction fingerprint (PLIF) tool implemented in MOE software has been used for summarizing the interactions between ligands and the abovementioned enzymes. Receptor interaction fingerprints have been generated from the docked poses of the virtual screening hits with COX-1,2 and mPGES-1 active sites coordinates. 3D pharmacophore models containing two and three points queries as the combination of their structures steric and electronic parameters have been generated and it provides the affinity and inhibitory activity of the novel compounds towards multiply receptors. The analysis of the pharmacophore models obtained indicates the functionality of fused bicyclic thiazolopyridine scaffold which provides the steric placement of at least one of these heterocycles atoms in the respective pharmacophore centres. The fused thiazolo[4,5-b]pyridine-2-one system may be considered as a promosing scaffold for creating diverse combinatorial libraries of potential biologically active substances. The final conclusion has been confirmed by the results of the virtual screening procedures and pharmacophore centres modeling in molecules of novel thiazolo [4,5-b]pyridine-2-one. Проведены докинговые исследования, целью которых было установить возможность ингибирования производными 5,7-диметил-6-фенилазо-3Н-тиазоло[4,5-b]пиридин-2-она активности ферментов, которые являются катализаторами разных стадий циклооксигеназного пути метаболизма арахидоновой кислоты: обеих изоформ циклооксигеназы (COX-1, COX-2) и микросомной простанландин Е синтазы-1 (mPGES-1). Осуществлено моделирование 3D фармакофоров в молекулах исследуемых соединений с использованием методологии «отпечатков пальцев» взаимодействий между рецептором и лигандом (Protein-Ligand Interaction Fingerprints – PLIF). Выявленные типы и локализация взаимодействий в комплексах синтезованных соединений с указанными рецепторами позволили построить трех- и двухцентровые 3D модели фармакофоров в молекулах этих веществ, которые объединяют стерические и электронные свойства их структур, необходимые для реализации оптимального связывания с биологическими мишенями. Анализ полученных фармакофорных моделей указывает на функциональность конденсированного бициклического скафолда, которая обеспечивается стерическим расположением атомов по меньшей мере одного из указанных гетероциклов в соответствующих фармакофорных центрах. Конденсированную тиазолопиридиновую гетероциклическую систему можно рассматривать как перспективный скафолд для создания комбинаторных библиотек потенциальных биологически активных веществ, подтверждением чему являются результаты проведенных процедур виртуального скрининга и моделирования фармакофорных центров в молекулах производных тиазоло[4,5 b]пиридин-2-ону. Проведені докінгові дослідження з метою встановлення можливості інгібування похідними 5,7-диметил-6-фенілазо-3Н-тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону активності ферментів, задіяних у різних стадіях циклооксигеназного шляху метаболізму арахідонової кислоти: двох ізоформ циклооксигенази (COX-1 і COX-2) та мікросомної простанландин Е синтази-1 (mPGES-1). Було проведено моделювання 3D фармакофорів у молекулах досліджуваних сполук із використанням методології «відбитків пальців» взаємодій між рецептором та лігандом (Protein-Ligand Interaction Fingerprints – PLIF). Встановлені типи і локалізація взаємодій у комплексах синтезованих сполук із зазначеними рецепторами дозволили побудувати три- та двоцентрові 3D моделі фармакофорів у молекулах цих речовин, які поєднують стеричні та електронні властивості їх структур, необхідні для забезпечення оптимального зв’язування з біологічними мішенями. Аналіз одержаних фармакофорних моделей вказує на функціональність конденсованого біциклічного тіазолопіридинового скафолда, яка забезпечується стеричним розміщенням атомів хоча б одного з цих гетероциклів у відповідних фармакофорних центрах. Конденсовану тіазолопіридинову гетероциклічну систему можна розглядати як перспективний скафолд для створення комбінаторних бібліотек потенційних біологічно активних речовин, що підтверджується результатами проведених процедур віртуального скринінгу та моделювання фармакофорних центрів у молекулах похідних тіазоло[4,5-b]піридин-2-ону. National University of Pharmacy 2014-03-06 Article Article application/pdf https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.14.768 10.24959/ophcj.14.768 Journal of Organic and Pharmaceutical Chemistry; Vol. 12 No. 1(45) (2014); 60-68 Журнал органической и фармацевтической химии; Том 12 № 1(45) (2014); 60-68 Журнал органічної та фармацевтичної хімії; Том 12 № 1(45) (2014); 60-68 2518-1548 2308-8303 uk https://ophcj.nuph.edu.ua/article/view/ophcj.14.768/110971 Copyright (c) 2014 National University of Pharmacy https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |