In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans
The previously established in vitro high antimicrobial activity of triphenylphosphonium salts (TPPs) against bacterial (Staphylococcus aureus ATCC 25923 and multi-drug resistant (MDR)) and fungal (Candida albicans ATCC 10231 and MDR) strains made it possible to propose a molecular mechanism of actio...
Збережено в:
| Дата: | 2021 |
|---|---|
| Автори: | , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
V.P. Kukhar Institute of Bioorganic Chemistry and Petrochemistry of the National Academy of Sciences of Ukraine
2021
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://bioorganica.com.ua/index.php/journal/article/view/45 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainica Bioorganica Acta |
Репозитарії
Ukrainica Bioorganica Acta| id |
oai:ojs2.bioorganica.com.ua:article-45 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| institution |
Ukrainica Bioorganica Acta |
| collection |
OJS |
| language |
English |
| topic |
transglycosylase triphenylphosphonium salts 1,3-oxazole Candida albicans Staphylococcus aureus трансглікозилаза трифенілфосфонієві солі 1,3-оксазол Candida albicans Staphylococcus aureus |
| spellingShingle |
transglycosylase triphenylphosphonium salts 1,3-oxazole Candida albicans Staphylococcus aureus трансглікозилаза трифенілфосфонієві солі 1,3-оксазол Candida albicans Staphylococcus aureus Semenyuta, Ivan V. Trush, Maria M. Hodyna, Diana M. Kachaeva, Maryna V. Metelytsia, Larysa O. Brovarets, Volodymyr S. In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| topic_facet |
transglycosylase triphenylphosphonium salts 1,3-oxazole Candida albicans Staphylococcus aureus трансглікозилаза трифенілфосфонієві солі 1,3-оксазол Candida albicans Staphylococcus aureus |
| format |
Article |
| author |
Semenyuta, Ivan V. Trush, Maria M. Hodyna, Diana M. Kachaeva, Maryna V. Metelytsia, Larysa O. Brovarets, Volodymyr S. |
| author_facet |
Semenyuta, Ivan V. Trush, Maria M. Hodyna, Diana M. Kachaeva, Maryna V. Metelytsia, Larysa O. Brovarets, Volodymyr S. |
| author_sort |
Semenyuta, Ivan V. |
| title |
In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| title_short |
In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| title_full |
In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| title_fullStr |
In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| title_full_unstemmed |
In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans |
| title_sort |
in vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази candida albicans |
| title_alt |
In vitro and in silico study of 1,3-oxazol-4-yltriphenylphosphonium salts as potential inhibitors of Candida albicans transglycosylase |
| description |
The previously established in vitro high antimicrobial activity of triphenylphosphonium salts (TPPs) against bacterial (Staphylococcus aureus ATCC 25923 and multi-drug resistant (MDR)) and fungal (Candida albicans ATCC 10231 and MDR) strains made it possible to propose a molecular mechanism of action of these compounds associated with transglycosylase (TG) activity. The hypothesis was based on the well-known literature data on TPPs as inhibitors of S. aureus TG. The created homology model of TG C. albicans is optimal in terms of quality indicators such as GMQE (0.61), ERRAT (overall quality factor 95.904) and Ramachandran plot analysis (90% amino acid residues in the favored regions). The modeling of molecular docking of the most active ligands 1a-d, 3c into the active center of the created homology C. albicans TG model demonstrated the formation of stable ligand-protein complexes with calculated binding energies from -8.9 to -9.7 kcal/mol due to the various types of interactions. An important role in complex formation belongs to amino acid residues TYR307, TYR107, GLU275, ALA108 and PRO136. The presented qualitative homologous model of C. albicans TG can be used to search and create new agents with a dual mechanism of antimicrobial action. 1,3-oxazol-4-yltriphenylphosphonium salts 1a-d, 3c are the perspective objects for further study as antimicrobials against infectious MDR pathogens |
| publisher |
V.P. Kukhar Institute of Bioorganic Chemistry and Petrochemistry of the National Academy of Sciences of Ukraine |
| publishDate |
2021 |
| url |
https://bioorganica.com.ua/index.php/journal/article/view/45 |
| work_keys_str_mv |
AT semenyutaivanv invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT trushmariam invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT hodynadianam invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT kachaevamarynav invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT metelytsialarysao invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT brovaretsvolodymyrs invitroandinsilicostudyof13oxazol4yltriphenylphosphoniumsaltsaspotentialinhibitorsofcandidaalbicanstransglycosylase AT semenyutaivanv invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans AT trushmariam invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans AT hodynadianam invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans AT kachaevamarynav invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans AT metelytsialarysao invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans AT brovaretsvolodymyrs invitrotainsilicodoslídžennâ13oksazol4íltrifenílfosfoníêvihsolejâkpotencíjnihíngíbítorívtransglíkozilazicandidaalbicans |
| first_indexed |
2024-09-01T17:42:58Z |
| last_indexed |
2024-09-01T17:42:58Z |
| _version_ |
1809016504968019968 |
| spelling |
oai:ojs2.bioorganica.com.ua:article-452023-04-12T20:41:36Z In vitro and in silico study of 1,3-oxazol-4-yltriphenylphosphonium salts as potential inhibitors of Candida albicans transglycosylase In vitro та in silico дослідження 1,3-оксазол-4- ілтрифенілфосфонієвих солей як потенційних інгібіторів трансглікозилази Candida albicans Semenyuta, Ivan V. Trush, Maria M. Hodyna, Diana M. Kachaeva, Maryna V. Metelytsia, Larysa O. Brovarets, Volodymyr S. transglycosylase triphenylphosphonium salts 1,3-oxazole Candida albicans Staphylococcus aureus трансглікозилаза трифенілфосфонієві солі 1,3-оксазол Candida albicans Staphylococcus aureus The previously established in vitro high antimicrobial activity of triphenylphosphonium salts (TPPs) against bacterial (Staphylococcus aureus ATCC 25923 and multi-drug resistant (MDR)) and fungal (Candida albicans ATCC 10231 and MDR) strains made it possible to propose a molecular mechanism of action of these compounds associated with transglycosylase (TG) activity. The hypothesis was based on the well-known literature data on TPPs as inhibitors of S. aureus TG. The created homology model of TG C. albicans is optimal in terms of quality indicators such as GMQE (0.61), ERRAT (overall quality factor 95.904) and Ramachandran plot analysis (90% amino acid residues in the favored regions). The modeling of molecular docking of the most active ligands 1a-d, 3c into the active center of the created homology C. albicans TG model demonstrated the formation of stable ligand-protein complexes with calculated binding energies from -8.9 to -9.7 kcal/mol due to the various types of interactions. An important role in complex formation belongs to amino acid residues TYR307, TYR107, GLU275, ALA108 and PRO136. The presented qualitative homologous model of C. albicans TG can be used to search and create new agents with a dual mechanism of antimicrobial action. 1,3-oxazol-4-yltriphenylphosphonium salts 1a-d, 3c are the perspective objects for further study as antimicrobials against infectious MDR pathogens У роботі запропоновано новий потенційний молекулярний механізм дії 1,3-оксазол-4-ілтрифенілфосфонієвих солей як інгібіторів трансглікозилази. За результатами біологічних досліджень встановлено високий антимікробний потенціал досліджених солей трифенілфосфонію як проти бактеріальних (Staphylococcus aureus ATCC 25923 та мультирезистентний), так і проти грибкових (Candida albicans ATCC 10231 та мультирезистентний) штамів. Отримані експериментальні дані щодо їх антимікробної активності дозволили запропонувати молекулярний механізм дії цих сполук, пов'язаний з трансглікозилазною активністю. В основу гіпотези було покладено результати аналізу «структура-активність» солей трифосфонію в онлайн хімічній базі ChEMBL, а також за відомими літературниими джерелами щодо антимікробної активності солей як інгібіторів трансглікозилази S. aureus. Створена гомологічна модель трансглікозилази C. albicans продемонструвала високі показники якості та була використана для молекулярного докінгу. Молекулярний докінг найбільш активних лігандів 1a-d, 3с в активний центр створеної гомологічної моделі C. albicans засвідчив утворення стабільних ліганд-білкових комплексів з ∆G в діапазоні від -8,9 до -9,7 ккал/моль шляхом формування різних типів взаємодій. Представлена якісна гомологічна модель трансглікозилази C. albicans може бути використана для пошуку та створення нових агентів з подвійним механізмом антимікробної дії. Солі 1,3-оксазол-4-ілтріфенілфосфонію 1a-d, 3с є перспективними об’єктами для подальшого вивчення в якості антимікробних засобів проти мультирезистентних інфекційних збудників V.P. Kukhar Institute of Bioorganic Chemistry and Petrochemistry of the National Academy of Sciences of Ukraine 2021-06-30 Article Article application/pdf https://bioorganica.com.ua/index.php/journal/article/view/45 10.15407/bioorganica2021.01.025 Ukrainica Bioorganica Acta; Vol. 16 No. 1 (2021): Ukrainica Bioorganica Acta; 25-33 Ukrainica Bioorganica Acta; Том 16 № 1 (2021): Ukrainica Bioorganica Acta; 25-33 1814-9766 1814-9758 10.15407/bioorganica2021.01 en https://bioorganica.com.ua/index.php/journal/article/view/45/45 http://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |