ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ

Summary. Background: The loop domain organization of chromatin, which plays an important role in transcription regulation, may depend on the cell functional state. The aim of this work was to investigate DNA loop reorganization upon functional transitions in two cell lines ‒ glioblastoma mu...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Datum:	2023
Hauptverfasser:	Svyrydova, K., Vasylieva, V., Kropyvko, S., Afanasieva, K., Sivolob, A.
Format:	Artikel
Sprache:	English
Veröffentlicht:	PH Akademperiodyka 2023
Schlagworte:	петлі ДНК кометний електрофорез функціональний стан клітин гліобластома клітинна лінія T98G клітинна лінія U373.
Online Zugang:	https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2021-4-13
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:	Experimental Oncology

Institution

Experimental Oncology

id	oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-136
record_format	ojs
spelling	oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-1362023-10-11T16:44:59Z Comparative characteristics of DNA loop domains rearrangement in glioblastoma multiforme T98G and glioblastoma astrocytoma U373 cell lines under different culture conditions ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ Svyrydova, K. Vasylieva, V. Kropyvko, S. Afanasieva, K. Sivolob, A. петлі ДНК, кометний електрофорез, функціональний стан клітин, гліобластома, клітинна лінія T98G, клітинна лінія U373. cell functional state, comet assay, DNA loops, glioblastoma, T98G cell line, U373 cell line Summary. Background: The loop domain organization of chromatin, which plays an important role in transcription regulation, may depend on the cell functional state. The aim of this work was to investigate DNA loop reorganization upon functional transitions in two cell lines ‒ glioblastoma multiforme T98G and glioblastoma astrocytoma U373. Materials and Methods: Single cell gel electrophoresis (the comet assay) was used to analyze the kinetics of the DNA loop migration from the nucleoids obtained from the lysed cells. Results: The DNA fraction in the surface loops and the size of these loops were found to be similar in two glioblastoma cell lines. When synthetic processes were inhibited, the migration of a small portion of inner loops was observed in T98G but not U373 cells. In T98G cells, stimulation of cell proliferation and transcription was accompanied by an increase in DNA fraction in the inner loops and an essential increase in the size of these loops. The effect of stimulation was practically absent in U373 cells. However, the linear density of the loops resolved by the comet assay was found to decrease upon stimulation of proliferation in both cell lines. Conclusion: A decrease in the loop density appears to be associated with an intensification of the synthetic processes in cells upon their stimulation. Резюме. Вступ: Петельна організація хроматину, яка відіграє важливу роль у регуляції транскрипції, може залежати від функціонального стану клітин. Мета цієї роботи полягала у дослідженні реорганізації петель ДНК під час зміни функціонального стану клітин двох ліній — мультиформної гліобластоми T98G та гліобластоми астроцитоми U373. Матеріали та методи: Електрофорез ДНК ізольованих клітин (кометний електрофорез) було використано для аналізу кінетики міграції петельних доменів ДНК з нуклеоїдів, отриманих шляхом лізису клітин. Результати: Частка ДНК, яка припадає на поверхневі петлі, та розміри цих петель були схожими для двох ліній клітин гліобластоми. За умови інгібування синтетичних процесів міграція невеликої фракції внутрішніх петель спостерігалася лише для клітин лінії T98G. Для цих же клітин стимулювання клітинної проліферації та транскрипції супроводжувалося збільшенням частки внутрішніх петель і суттєвим збільшенням їх розмірів. Подібні ефекти стимулювання були майже повністю відсутні у клітин лінії U373. Проте лінійна щільність петель ДНК, які детектуються за допомогою кометного електрофорезу, знижувалася при стимулюванні проліферації в обох типах клітин. Висновок: Зниження щільності петель ДНК асоційоване з підвищенням інтенсивності синтетичних процесів у клітинах при їх стимуляції до поділу. PH Akademperiodyka 2023-05-26 Article Article application/pdf https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2021-4-13 10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-43-no-4.17080 Experimental Oncology; Vol. 43 No. 4 (2021): Experimental Oncology; 306-311 Експериментальна онкологія; Том 43 № 4 (2021): Експериментальна онкологія; 306-311 2312-8852 1812-9269 10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-43-no-4 en https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2021-4-13/2021-4-13 Copyright (c) 2023 Experimental Oncology https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
institution	Experimental Oncology
baseUrl_str
datestamp_date	2023-10-11T16:44:59Z
collection	OJS
language	English
topic	петлі ДНК кометний електрофорез функціональний стан клітин гліобластома клітинна лінія T98G клітинна лінія U373.
spellingShingle	петлі ДНК кометний електрофорез функціональний стан клітин гліобластома клітинна лінія T98G клітинна лінія U373. Svyrydova, K. Vasylieva, V. Kropyvko, S. Afanasieva, K. Sivolob, A. ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
topic_facet	петлі ДНК кометний електрофорез функціональний стан клітин гліобластома клітинна лінія T98G клітинна лінія U373. cell functional state comet assay DNA loops glioblastoma T98G cell line U373 cell line
format	Article
author	Svyrydova, K. Vasylieva, V. Kropyvko, S. Afanasieva, K. Sivolob, A.
author_facet	Svyrydova, K. Vasylieva, V. Kropyvko, S. Afanasieva, K. Sivolob, A.
author_sort	Svyrydova, K.
title	ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
title_short	ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
title_full	ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
title_fullStr	ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
title_full_unstemmed	ПОРІВНЯЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РЕОРГАНІЗАЦІЇ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК В КЛІТИННИХ ЛІНІЯХ МУЛЬТИФОРМНОЇ ГЛІОБЛАСТОМИ T98G ТА ГЛІОБЛАСТОМИ АСТРОЦИТОМИ U373 ЗА РІЗНИХ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ
title_sort	порівняльна характеристика реорганізації петельних доменів днк в клітинних лініях мультиформної гліобластоми t98g та гліобластоми астроцитоми u373 за різних умов культивування
title_alt	Comparative characteristics of DNA loop domains rearrangement in glioblastoma multiforme T98G and glioblastoma astrocytoma U373 cell lines under different culture conditions
description	Summary. Background: The loop domain organization of chromatin, which plays an important role in transcription regulation, may depend on the cell functional state. The aim of this work was to investigate DNA loop reorganization upon functional transitions in two cell lines ‒ glioblastoma multiforme T98G and glioblastoma astrocytoma U373. Materials and Methods: Single cell gel electrophoresis (the comet assay) was used to analyze the kinetics of the DNA loop migration from the nucleoids obtained from the lysed cells. Results: The DNA fraction in the surface loops and the size of these loops were found to be similar in two glioblastoma cell lines. When synthetic processes were inhibited, the migration of a small portion of inner loops was observed in T98G but not U373 cells. In T98G cells, stimulation of cell proliferation and transcription was accompanied by an increase in DNA fraction in the inner loops and an essential increase in the size of these loops. The effect of stimulation was practically absent in U373 cells. However, the linear density of the loops resolved by the comet assay was found to decrease upon stimulation of proliferation in both cell lines. Conclusion: A decrease in the loop density appears to be associated with an intensification of the synthetic processes in cells upon their stimulation.
publisher	PH Akademperiodyka
publishDate	2023
url	https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2021-4-13
work_keys_str_mv	AT svyrydovak comparativecharacteristicsofdnaloopdomainsrearrangementinglioblastomamultiformet98gandglioblastomaastrocytomau373celllinesunderdifferentcultureconditions AT vasylievav comparativecharacteristicsofdnaloopdomainsrearrangementinglioblastomamultiformet98gandglioblastomaastrocytomau373celllinesunderdifferentcultureconditions AT kropyvkos comparativecharacteristicsofdnaloopdomainsrearrangementinglioblastomamultiformet98gandglioblastomaastrocytomau373celllinesunderdifferentcultureconditions AT afanasievak comparativecharacteristicsofdnaloopdomainsrearrangementinglioblastomamultiformet98gandglioblastomaastrocytomau373celllinesunderdifferentcultureconditions AT sivoloba comparativecharacteristicsofdnaloopdomainsrearrangementinglioblastomamultiformet98gandglioblastomaastrocytomau373celllinesunderdifferentcultureconditions AT svyrydovak porívnâlʹnaharakteristikareorganízacíípetelʹnihdomenívdnkvklítinnihlíníâhmulʹtiformnoíglíoblastomit98gtaglíoblastomiastrocitomiu373zaríznihumovkulʹtivuvannâ AT vasylievav porívnâlʹnaharakteristikareorganízacíípetelʹnihdomenívdnkvklítinnihlíníâhmulʹtiformnoíglíoblastomit98gtaglíoblastomiastrocitomiu373zaríznihumovkulʹtivuvannâ AT kropyvkos porívnâlʹnaharakteristikareorganízacíípetelʹnihdomenívdnkvklítinnihlíníâhmulʹtiformnoíglíoblastomit98gtaglíoblastomiastrocitomiu373zaríznihumovkulʹtivuvannâ AT afanasievak porívnâlʹnaharakteristikareorganízacíípetelʹnihdomenívdnkvklítinnihlíníâhmulʹtiformnoíglíoblastomit98gtaglíoblastomiastrocitomiu373zaríznihumovkulʹtivuvannâ AT sivoloba porívnâlʹnaharakteristikareorganízacíípetelʹnihdomenívdnkvklítinnihlíníâhmulʹtiformnoíglíoblastomit98gtaglíoblastomiastrocitomiu373zaríznihumovkulʹtivuvannâ
first_indexed	2025-07-17T12:15:43Z
last_indexed	2025-07-17T12:15:43Z
_version_	1850410986352148480

Institution

Ähnliche Einträge