АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ
Background: Collagens, which are the major components of the extracellular matrix involved in the regulation of tumor microenvironment, could be differentially expressed in breast cancer (BC) with different transcriptome profiling. Aim: To analyze the transcript level expression of COL1A1, COL5A1, C...
Gespeichert in:
| Datum: | 2023 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | English |
| Veröffentlicht: |
PH Akademperiodyka
2023
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-1-3 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Experimental Oncology |
Institution
Experimental Oncology| id |
oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-298 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| institution |
Experimental Oncology |
| baseUrl_str |
|
| datestamp_date |
2023-06-26T15:07:28Z |
| collection |
OJS |
| language |
English |
| topic |
рак грудної залози екстрацелюлярний матрикс надекспресія знижена експресія колагени |
| spellingShingle |
рак грудної залози екстрацелюлярний матрикс надекспресія знижена експресія колагени Malvia, Shreshtha Chintamani, Chintamani Sarin, Ramesh Dubey, Uma S Saxena, Sunita Bagadi, Sarangadhara Appala Raju АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| topic_facet |
рак грудної залози екстрацелюлярний матрикс надекспресія знижена експресія колагени breast cancer collagens down-regulation extracellular matrix overexpression |
| format |
Article |
| author |
Malvia, Shreshtha Chintamani, Chintamani Sarin, Ramesh Dubey, Uma S Saxena, Sunita Bagadi, Sarangadhara Appala Raju |
| author_facet |
Malvia, Shreshtha Chintamani, Chintamani Sarin, Ramesh Dubey, Uma S Saxena, Sunita Bagadi, Sarangadhara Appala Raju |
| author_sort |
Malvia, Shreshtha |
| title |
АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| title_short |
АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| title_full |
АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| title_fullStr |
АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| title_full_unstemmed |
АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ |
| title_sort |
аберантна експресія генів col14a1, celrs3 таcthrc1в клітинах раку грудної залози |
| title_alt |
ABERRANT EXPRESSION OF COL14A1, CELRS3, and CTHRC1 IN BREAST CANCER СELLS |
| description |
Background: Collagens, which are the major components of the extracellular matrix involved in the regulation of tumor microenvironment, could be differentially expressed in breast cancer (BC) with different transcriptome profiling. Aim: To analyze the transcript level expression of COL1A1, COL5A1, COL10A1, COL11A1, COL12A1, COL14A1, CTHRC1, and CELRS3 genes and the clinical relevance of their differential expression in BC. Materials and Methods: The transcript level expression of the genes was analyzed using the quantitative real-time PCR (qPCR) in tumor tissue of 60 BC patients. Results: Overexpression of COL1A1, COL5A1, COL10A1, COL11A1, COL12A1, CTHRC, and CELRS3 anddown-regulated expression of COL14A1 were observed. COL14A1 down-regulation was associated with aggressive, basal, and Her-2/neu BC subtypes (p = 0.031). Overexpression of CELSR3 was found to be associated with the older age of the patients (> 55 years, p = 0.049). Further analysis with the TCGA BC data set has shown a concordance in the differential expression of the above genes. Furthermore, overexpression of CTHRC1 was associated with poor overall survival (OS), particularly with poor prognosis (p = 0.00042) for the luminal BC subtype. On the other hand, CELSR3 overexpression was associated with mucinous tumors and poor prognosis in post-menopausal women. In silicotarget prediction identified several BC-associated miRNAs and members of miR-154, -515, and -10 families to perform a likely regulatory role in the above ECM genes. Conclusion: The present study shows that the expression of COL14A1 and CTHRC1 may serve as potential biological markers for the detection of basal BC and the prognosis of survival for patients with the luminal subtype of BC. |
| publisher |
PH Akademperiodyka |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-1-3 |
| work_keys_str_mv |
AT malviashreshtha aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT chintamanichintamani aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT sarinramesh aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT dubeyumas aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT saxenasunita aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT bagadisarangadharaappalaraju aberrantexpressionofcol14a1celrs3andcthrc1inbreastcancersells AT malviashreshtha aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi AT chintamanichintamani aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi AT sarinramesh aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi AT dubeyumas aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi AT saxenasunita aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi AT bagadisarangadharaappalaraju aberantnaekspresíâgenívcol14a1celrs3tacthrc1vklítinahrakugrudnoízalozi |
| first_indexed |
2025-07-17T12:17:30Z |
| last_indexed |
2025-07-17T12:17:30Z |
| _version_ |
1850411416205393920 |
| spelling |
oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-2982023-06-26T15:07:28Z ABERRANT EXPRESSION OF COL14A1, CELRS3, and CTHRC1 IN BREAST CANCER СELLS АБЕРАНТНА ЕКСПРЕСІЯ ГЕНІВ COL14A1, CELRS3 ТАCTHRC1В КЛІТИНАХ РАКУ ГРУДНОЇ ЗАЛОЗИ Malvia, Shreshtha Chintamani, Chintamani Sarin, Ramesh Dubey, Uma S Saxena, Sunita Bagadi, Sarangadhara Appala Raju рак грудної залози, екстрацелюлярний матрикс, надекспресія, знижена експресія, колагени breast cancer, collagens, down-regulation, extracellular matrix, overexpression Background: Collagens, which are the major components of the extracellular matrix involved in the regulation of tumor microenvironment, could be differentially expressed in breast cancer (BC) with different transcriptome profiling. Aim: To analyze the transcript level expression of COL1A1, COL5A1, COL10A1, COL11A1, COL12A1, COL14A1, CTHRC1, and CELRS3 genes and the clinical relevance of their differential expression in BC. Materials and Methods: The transcript level expression of the genes was analyzed using the quantitative real-time PCR (qPCR) in tumor tissue of 60 BC patients. Results: Overexpression of COL1A1, COL5A1, COL10A1, COL11A1, COL12A1, CTHRC, and CELRS3 anddown-regulated expression of COL14A1 were observed. COL14A1 down-regulation was associated with aggressive, basal, and Her-2/neu BC subtypes (p = 0.031). Overexpression of CELSR3 was found to be associated with the older age of the patients (> 55 years, p = 0.049). Further analysis with the TCGA BC data set has shown a concordance in the differential expression of the above genes. Furthermore, overexpression of CTHRC1 was associated with poor overall survival (OS), particularly with poor prognosis (p = 0.00042) for the luminal BC subtype. On the other hand, CELSR3 overexpression was associated with mucinous tumors and poor prognosis in post-menopausal women. In silicotarget prediction identified several BC-associated miRNAs and members of miR-154, -515, and -10 families to perform a likely regulatory role in the above ECM genes. Conclusion: The present study shows that the expression of COL14A1 and CTHRC1 may serve as potential biological markers for the detection of basal BC and the prognosis of survival for patients with the luminal subtype of BC. Стан питання: Колагени становлять основний компонент екстрацелюлярного матрикса і залучені до регуляції пухлинного мікрооточення. Вони можуть диференційно експресуватися в клітинах раку грудної залози з різним транскриптомним профілем. Мета: Проаналізувати експресію генів COL1A1,COL5A1,COL10A1,COL11A1,COL12A1, COL14A1,CTHRC1 таCELRS3 на рівні mРНК та можливе клінічне значення такої диференційної експресії при раку грудної залози. Матеріали та методи: Рівень транскрипції визначали в пухлинній тканині 60 хворих на рак грудної залози методом кількісної ПЛР в реальному часі. Результати: Продемонстровано надекспресію COL1A1,COL5A1,COL10A1,COL11A1,COL12A1,CTHRC1 та CELRS3 і знижену експресіюCOL14A1. Зниження експресіїCOL14A1 асоціювалось із більш агресивними базальним та Her-2/neu підтипами раку грудної залози (p = 0,031). Надекспресія CELSR3відзначалась у хворих старшого віку (понад 55 років, p = 0,049). Аналіз даних з бази атласу ракового геному підтвердив зазначений характер диференційної експресії досліджуваних генів. Надекспресія CTHRC1 асоціюється з гіршою загальною виживаністю та поганим прогнозом люмінального підтипу раку грудної залози. Надекспресія CELSR3асоціюється з муцинозними пухлинами та несприятливим прогнозом у постменопаузних жінок. Insilicoбуло визначено мішені деяких мікроРНК, асоційованих із раком грудної залози. Виявилось, що мікроРНК родин miR-154, -515 та -10 відіграють певну регуляторну роль відноснодосліджених колагенових генів. Висновки: Експресія генів COL14A1 та CTHRC1 може розглядатись як потенційний біологічний маркер для виявлення базального раку грудної залози та прогнозування виживаності у хворих на рак грудної залози люмінального підтипу. PH Akademperiodyka 2023-06-26 Article Article application/pdf https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-1-3 10.15407/exp-oncology.2023.01.028 Experimental Oncology; Vol. 45 No. 1 (2023): Experimental Oncology; 28-43 Експериментальна онкологія; Том 45 № 1 (2023): Експериментальна онкологія; 28-43 2312-8852 1812-9269 10.15407/exp-oncology.2023.01 en https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/2023-1-3/2023-1-3 Copyright (c) 2023 Experimental Oncology https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |