ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT

Background. Telomerase is a ribonucleoprotein (RNP) reverse transcriptase that replicates the ends of chromosomes, thereby maintaining genome integrity, and its inhibition may be envisioned to prevent carcinogenesis or treat cancer patients. Various approaches have been used to target hTERT, and one...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Date:2025
Main Authors: Ansari, Maham, Rafiullah, Rafiullah, Wali, Abdul, Tareen, Afrasiab Khan, Sultan, Imrana Niaz, Yasinzai, Muhammad Mushtaq
Format: Article
Language:English
Published: PH Akademperiodyka 2025
Subjects:
Online Access:https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/497
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Experimental Oncology

Institution

Experimental Oncology
id oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-497
record_format ojs
institution Experimental Oncology
baseUrl_str
datestamp_date 2025-10-07T11:11:00Z
collection OJS
language English
topic мікроРНК
hTERT
злоякісні новоутворення
hsa-miR-6796-5p
hsa-miR-4651
орієнтація зв’язуван- ня
афінність
проліферація клітин
spellingShingle мікроРНК
hTERT
злоякісні новоутворення
hsa-miR-6796-5p
hsa-miR-4651
орієнтація зв’язуван- ня
афінність
проліферація клітин
Ansari, Maham
Rafiullah, Rafiullah
Wali, Abdul
Tareen, Afrasiab Khan
Sultan, Imrana Niaz
Yasinzai, Muhammad Mushtaq
ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
topic_facet мікроРНК
hTERT
злоякісні новоутворення
hsa-miR-6796-5p
hsa-miR-4651
орієнтація зв’язуван- ня
афінність
проліферація клітин
microRNA
hTERT
cancer
hsa-miR-6796-5p
hsa-miR-4651
binding orientation
affinity
cell proliferation
format Article
author Ansari, Maham
Rafiullah, Rafiullah
Wali, Abdul
Tareen, Afrasiab Khan
Sultan, Imrana Niaz
Yasinzai, Muhammad Mushtaq
author_facet Ansari, Maham
Rafiullah, Rafiullah
Wali, Abdul
Tareen, Afrasiab Khan
Sultan, Imrana Niaz
Yasinzai, Muhammad Mushtaq
author_sort Ansari, Maham
title ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
title_short ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
title_full ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
title_fullStr ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
title_full_unstemmed ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT
title_sort ідентифікація та функціональна характеристика мікрорнк, що регулюють htert
title_alt IDENTIFICATION AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF MICRORNAS REGULATING HTERT
description Background. Telomerase is a ribonucleoprotein (RNP) reverse transcriptase that replicates the ends of chromosomes, thereby maintaining genome integrity, and its inhibition may be envisioned to prevent carcinogenesis or treat cancer patients. Various approaches have been used to target hTERT, and one of the promising strategies is the use of hTERT-targeting microRNAs (miRNAs). Aim. To investigate the interaction of miRNAs with hTERT, describing the strength, affinity, preferred binding orientation, and in vitro verification of miRNA on hTERT expression in cancer. Materials and Methods. The miRWalk, TargetScan, and miRDB databases were used for screening. Consistently, five top-hit miRNAs were found in all three databases that could interact with hTERT mRNA, namely, hsa-miR-4651, hsa-miR-608, hsa-miR-6796-5p, hsa-miR-6752-5p, and hsa-miR-6791-5p. We applied stringent in silico tools to firstly model the structures of lead miRNA and hTERT mRNA. Then docking was performed, and finally stability of miRNA-mRNA complexes was analyzed using MD simulations. Results. The expression of the selected miRNAs was inhibited in the MCF-7 breast cancer cell line. The inhibition of hsa-miR-6796-5p was enhanced, while hsa-miR-4651 significantly reduced the expression of hTERT protein. Moreover, the inhibition of hsa-miR-4651 expression led to a reduction in melanoma and breast cancer cell proliferation. Conclusion. The current study provided a detailed procedure for identifying and verifying miRNAs against mRNAs, as well as highlighting the differential regulation of hTERT by specific miRNAs. It demonstrated that miRNA inhibition can modulate hTERT expression and cell proliferation, with potential implications for targeted cancer therapies. The strategy used in this study could also be applied to other genes for screening potential miRNAs.
publisher PH Akademperiodyka
publishDate 2025
url https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/497
work_keys_str_mv AT ansarimaham identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT rafiullahrafiullah identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT waliabdul identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT tareenafrasiabkhan identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT sultanimrananiaz identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT yasinzaimuhammadmushtaq identificationandfunctionalcharacterizationofmicrornasregulatinghtert
AT ansarimaham ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
AT rafiullahrafiullah ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
AT waliabdul ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
AT tareenafrasiabkhan ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
AT sultanimrananiaz ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
AT yasinzaimuhammadmushtaq ídentifíkacíâtafunkcíonalʹnaharakteristikamíkrornkŝoregulûûtʹhtert
first_indexed 2025-10-08T01:12:30Z
last_indexed 2025-10-08T01:12:30Z
_version_ 1845374990137950208
spelling oai:ojs2.ex.aqua-time.com.ua:article-4972025-10-07T11:11:00Z IDENTIFICATION AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF MICRORNAS REGULATING HTERT ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА ФУНКЦІОНАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА МІКРОРНК, ЩО РЕГУЛЮЮТЬ hTERT Ansari, Maham Rafiullah, Rafiullah Wali, Abdul Tareen, Afrasiab Khan Sultan, Imrana Niaz Yasinzai, Muhammad Mushtaq мікроРНК, hTERT, злоякісні новоутворення, hsa-miR-6796-5p, hsa-miR-4651, орієнтація зв’язуван- ня, афінність, проліферація клітин microRNA, hTERT, cancer, hsa-miR-6796-5p, hsa-miR-4651, binding orientation, affinity, cell proliferation Background. Telomerase is a ribonucleoprotein (RNP) reverse transcriptase that replicates the ends of chromosomes, thereby maintaining genome integrity, and its inhibition may be envisioned to prevent carcinogenesis or treat cancer patients. Various approaches have been used to target hTERT, and one of the promising strategies is the use of hTERT-targeting microRNAs (miRNAs). Aim. To investigate the interaction of miRNAs with hTERT, describing the strength, affinity, preferred binding orientation, and in vitro verification of miRNA on hTERT expression in cancer. Materials and Methods. The miRWalk, TargetScan, and miRDB databases were used for screening. Consistently, five top-hit miRNAs were found in all three databases that could interact with hTERT mRNA, namely, hsa-miR-4651, hsa-miR-608, hsa-miR-6796-5p, hsa-miR-6752-5p, and hsa-miR-6791-5p. We applied stringent in silico tools to firstly model the structures of lead miRNA and hTERT mRNA. Then docking was performed, and finally stability of miRNA-mRNA complexes was analyzed using MD simulations. Results. The expression of the selected miRNAs was inhibited in the MCF-7 breast cancer cell line. The inhibition of hsa-miR-6796-5p was enhanced, while hsa-miR-4651 significantly reduced the expression of hTERT protein. Moreover, the inhibition of hsa-miR-4651 expression led to a reduction in melanoma and breast cancer cell proliferation. Conclusion. The current study provided a detailed procedure for identifying and verifying miRNAs against mRNAs, as well as highlighting the differential regulation of hTERT by specific miRNAs. It demonstrated that miRNA inhibition can modulate hTERT expression and cell proliferation, with potential implications for targeted cancer therapies. The strategy used in this study could also be applied to other genes for screening potential miRNAs. Стан питання. Теломераза — це зворотна транскриптаза, яка реплікує кінці хромосом, тим самим підтримуючи цілісність геному. Її інгібування може сприяти запобіганню злоякісній трансформації клітин. Для таргетного впливу на hTERT застосовувалися різні підходи, і однією з перспективних стратегій є використання мікроРНК (міРНК). Мета роботи полягала у дослідженні взаємодії мікроРНК з hTERT із урахуванням афінності та оптимальної конформації взаємодії, а також вивченні впливу мікроРНК на експресію hTERT in vitro. Матеріали та методи. Для скринінгу використовувалися бази даних miRWalk, TargetScan та miRDB. У всіх трьох базах даних було виявлено п’ять мікроРНК з найвищим ступенем хітування, які могли взаємодіяти з мРНК hTERT, а саме hsa-miR-4651, hsa-miR-608, hsa-miR-6796-5p, hsa-miR-6752-5p та hsa-miR-6791-5p. Застосовували алгоритми та інструменти in silico, щоб змоделювати структури взаємодіючої мікроРНК та мРНК hTERT. Потім було проведено докінг і проаналізовано стабільність комплексів мікроРНК-мРНК за допомоги молекулярно- динамічної симуляції. Результати. Експресія вибраних мікроРНК була пригнічена в лінії клітин раку молочної залози MCF-7. Пригнічення hsa-miR-6796-5p посилювало, тоді як hsa-miR-4651 значно знижувало експресію білка hTERT. Більше того, пригнічення експресії hsa-miR-4651 привело до зниження швидкості проліферації клітин меланоми та раку молочної залози. Висновки. Запропоновано детальну процедуру ідентифікації та перевірки мікроРНК відносно їх взаємодії з мРНК. Пригнічення певних мікроРНК може модулювати експресію hTERT та впливати таким чином на проліферацію клітин, що може бути одним з підходів для цільової терапії раку. Ця стратегія може бути застосована і до інших генів з метою скринінгу потенційних мікроРНК, які впливають на експресію відповідних мРНК. PH Akademperiodyka 2025-10-07 Article Article application/pdf https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/497 10.15407/exp-oncology.2025.02.167 Experimental Oncology; Vol. 47 No. 2 (2025): Experimental Oncology; 167-180 Експериментальна онкологія; Том 47 № 2 (2025): Експериментальна онкологія; 167-180 2312-8852 1812-9269 10.15407/exp-oncology.2025.02 en https://exp-oncology.com.ua/index.php/Exp/article/view/497/418 Copyright (c) 2025 Experimental Oncology https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/