Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective

One of the major clinical problems regarding β-lactam antibiotics resistance is attributed to metallo-beta-lactamases (MβL), which are a group of enzymes that is a subset of beta- lactamases belonging to group B of the Ambler classification, which causes hydrolysis of carbapenems. The study was cond...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2023
Автори: Akereuke, U.E., Onwuezobe, I.A., Ekuma, A.E., Edem, E.N., Uko, N.S., Okon, R.S., Bawonda, E.O., Ekpenyong, E.N., Акереуке, У.Є., Онвуезобе, І.А., Екума, А.Е., Едем, Е.Н., Уко, Н.С., Окон, Р.С., Бавонда, Е.О., Екпенйонг, Е.Н.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: PH "Akademperiodyka" of the NAS of Ukraine 2023
Теми:
Онлайн доступ:https://ojs.microbiolj.org.ua/index.php/mj/article/view/118
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Microbiological Journal

Репозитарії

Microbiological Journal
id oai:ojs2.ojs.microbiolj.org.ua:article-118
record_format ojs
institution Microbiological Journal
collection OJS
language English
topic carbapenem
efflux pump
multiple drug resistance (MDR)
metallo-beta-lactamases (MβL)
antibiotic susceptibility
карбапенем
ефлюксна помпа
множинна лікарська стійкість (МЛС)
метало-бета-лактамази (MβL)
чутливість до антибіотиків
spellingShingle carbapenem
efflux pump
multiple drug resistance (MDR)
metallo-beta-lactamases (MβL)
antibiotic susceptibility
карбапенем
ефлюксна помпа
множинна лікарська стійкість (МЛС)
метало-бета-лактамази (MβL)
чутливість до антибіотиків
Akereuke, U.E.
Onwuezobe, I.A.
Ekuma, A.E.
Edem, E.N.
Uko, N.S.
Okon, R.S.
Bawonda, E.O.
Ekpenyong, E.N.
Акереуке, У.Є.
Онвуезобе, І.А.
Екума, А.Е.
Едем, Е.Н.
Уко, Н.С.
Окон, Р.С.
Бавонда, Е.О.
Екпенйонг, Е.Н.
Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
topic_facet carbapenem
efflux pump
multiple drug resistance (MDR)
metallo-beta-lactamases (MβL)
antibiotic susceptibility
карбапенем
ефлюксна помпа
множинна лікарська стійкість (МЛС)
метало-бета-лактамази (MβL)
чутливість до антибіотиків
format Article
author Akereuke, U.E.
Onwuezobe, I.A.
Ekuma, A.E.
Edem, E.N.
Uko, N.S.
Okon, R.S.
Bawonda, E.O.
Ekpenyong, E.N.
Акереуке, У.Є.
Онвуезобе, І.А.
Екума, А.Е.
Едем, Е.Н.
Уко, Н.С.
Окон, Р.С.
Бавонда, Е.О.
Екпенйонг, Е.Н.
author_facet Akereuke, U.E.
Onwuezobe, I.A.
Ekuma, A.E.
Edem, E.N.
Uko, N.S.
Okon, R.S.
Bawonda, E.O.
Ekpenyong, E.N.
Акереуке, У.Є.
Онвуезобе, І.А.
Екума, А.Е.
Едем, Е.Н.
Уко, Н.С.
Окон, Р.С.
Бавонда, Е.О.
Екпенйонг, Е.Н.
author_sort Akereuke, U.E.
title Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
title_short Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
title_full Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
title_fullStr Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
title_full_unstemmed Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective
title_sort molecular profile of metallo-β-lactamase producing bacterial isolates from clinical samples; south-south nigeria perspective
title_alt Молекулярний профіль бактеріальних ізолятів, що продукують метало-β-лактамазу з клінічних зразків; перспективи південної Нігерії
description One of the major clinical problems regarding β-lactam antibiotics resistance is attributed to metallo-beta-lactamases (MβL), which are a group of enzymes that is a subset of beta- lactamases belonging to group B of the Ambler classification, which causes hydrolysis of carbapenems. The study was conducted to check the prevalence of MβL and its genes (IMP, VIM, and NDM) among Gram-negative isolates. Methods. 312 clinical samples (urine and wound) were cultured, and antimicrobial susceptibility testing was performed using the conventional disk diffusion method. MβL-phenotypic detection was uncovered by standard bacteriological techniques, MβL genes were amplified using pre-determined conditions set on an AB19700 Applied Biosystem thermal cycler. Results. 157 (56.1%) Gram-negative and 123 (43.9%) Gram-positive were isolated. Escherichia coli 32 (11.4%) and Pseudomonas aeruginosa 32 (11.4%) were the most predominant. Providencia stuartii 3 (1.1%), Klebsiella ornitholytica 2 (0.7%), and Stenotrophomonas maltophilia 1 (0.4%) were some of the less predominant isolates. Imipenem and Ertapenem were the most sensitive, while Gentamicin, Amoxicillin-Clavulanate, and Ceftriaxone were the most resistant. Twelve species (7.6%) were identified as MβL producers. The VIM gene (12: 100%) was the predominant gene, followed by the NDM gene (6: 50%) and the IMP gene (2: 16.7%). Conclusions. The detection of blaVIM, blaNDM, and blaIMP genes in South-south Uyo is really worrisome, and proper infectious control measures should be taken in order to prevent outbreaks of MβL-producing Gram-negative bacteria isolated in Uyo, South South Nigeria.
publisher PH "Akademperiodyka" of the NAS of Ukraine
publishDate 2023
url https://ojs.microbiolj.org.ua/index.php/mj/article/view/118
work_keys_str_mv AT akereukeue molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT onwuezobeia molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ekumaae molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT edemen molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ukons molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT okonrs molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT bawondaeo molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ekpenyongen molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT akereukeuê molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT onvuezobeía molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ekumaae molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT edemen molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ukons molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT okonrs molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT bavondaeo molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT ekpenjongen molecularprofileofmetalloblactamaseproducingbacterialisolatesfromclinicalsamplessouthsouthnigeriaperspective
AT akereukeue molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT onwuezobeia molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ekumaae molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT edemen molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ukons molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT okonrs molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT bawondaeo molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ekpenyongen molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT akereukeuê molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT onvuezobeía molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ekumaae molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT edemen molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ukons molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT okonrs molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT bavondaeo molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
AT ekpenjongen molekulârnijprofílʹbakteríalʹnihízolâtívŝoprodukuûtʹmetaloblaktamazuzklíníčnihzrazkívperspektivipívdennoínígeríí
first_indexed 2024-09-01T17:43:19Z
last_indexed 2024-09-01T17:43:19Z
_version_ 1809016526973435904
spelling oai:ojs2.ojs.microbiolj.org.ua:article-1182023-12-21T18:21:15Z Molecular Profile of Metallo-β-Lactamase Producing Bacterial Isolates from Clinical Samples; South-South Nigeria Perspective Молекулярний профіль бактеріальних ізолятів, що продукують метало-β-лактамазу з клінічних зразків; перспективи південної Нігерії Akereuke, U.E. Onwuezobe, I.A. Ekuma, A.E. Edem, E.N. Uko, N.S. Okon, R.S. Bawonda, E.O. Ekpenyong, E.N. Акереуке, У.Є. Онвуезобе, І.А. Екума, А.Е. Едем, Е.Н. Уко, Н.С. Окон, Р.С. Бавонда, Е.О. Екпенйонг, Е.Н. carbapenem efflux pump multiple drug resistance (MDR) metallo-beta-lactamases (MβL) antibiotic susceptibility карбапенем ефлюксна помпа множинна лікарська стійкість (МЛС) метало-бета-лактамази (MβL) чутливість до антибіотиків One of the major clinical problems regarding β-lactam antibiotics resistance is attributed to metallo-beta-lactamases (MβL), which are a group of enzymes that is a subset of beta- lactamases belonging to group B of the Ambler classification, which causes hydrolysis of carbapenems. The study was conducted to check the prevalence of MβL and its genes (IMP, VIM, and NDM) among Gram-negative isolates. Methods. 312 clinical samples (urine and wound) were cultured, and antimicrobial susceptibility testing was performed using the conventional disk diffusion method. MβL-phenotypic detection was uncovered by standard bacteriological techniques, MβL genes were amplified using pre-determined conditions set on an AB19700 Applied Biosystem thermal cycler. Results. 157 (56.1%) Gram-negative and 123 (43.9%) Gram-positive were isolated. Escherichia coli 32 (11.4%) and Pseudomonas aeruginosa 32 (11.4%) were the most predominant. Providencia stuartii 3 (1.1%), Klebsiella ornitholytica 2 (0.7%), and Stenotrophomonas maltophilia 1 (0.4%) were some of the less predominant isolates. Imipenem and Ertapenem were the most sensitive, while Gentamicin, Amoxicillin-Clavulanate, and Ceftriaxone were the most resistant. Twelve species (7.6%) were identified as MβL producers. The VIM gene (12: 100%) was the predominant gene, followed by the NDM gene (6: 50%) and the IMP gene (2: 16.7%). Conclusions. The detection of blaVIM, blaNDM, and blaIMP genes in South-south Uyo is really worrisome, and proper infectious control measures should be taken in order to prevent outbreaks of MβL-producing Gram-negative bacteria isolated in Uyo, South South Nigeria. Однією з основних клінічних проблем резистентності до β-лактамних антибіотиків є метало-бета-лактамази (MβL) — група ферментів, що є підгрупою бета-лактамаз, які належать до групи В за класифікацією Амблера і спричиняють гідроліз карбапенемів. Дослідження було проведено з метою перевірки поширеності метало-β-лактамази (MβL) та її генів (IMP, VIM та NDM) серед грамнегативних ізолятів. Методи. 312 клінічних зразків (із сечі та ран) були культивовані; тестування чутливості до антибіотиків виконано з використанням звичайного методу дискової дифузії. Фенотипове виявлення MβL здійснювали за допомогою стандартних бактеріологічних методів, гени MβL ампліфікували з використанням попередньо визначених умов, встановлених на термоциклері AB19700 Applied Biosystem. Результати. Було виділено 157 (56.1  %) грамнегативних і 123 (43.9 %) грампозитивних мікроорганізмів. Найбільш поширеними були Escherichia coli 32 (11.4 %) та Pseudomonas aeruginosa 32 (11.4 %). Providencia stuartii 3 (1.1 %), Klebsiella ornitholytica 2 (0.7 %), Stenotrophomonas maltophilia 1 (0.4 %) були одними з менш поширених ізолятів. Штами були найбільш чутливими до іміпенему та ертапенему, а найбільш стійкими — до гентаміцину, амоксицилін-клавуланату та цефтріаксону. Дванадцять ізолятів (7.6 %) були ідентифіковані як продуценти MβL. Переважаючим геном був ген VIM (12: 100 %), за ним ішли ген NDM (6: 50%) та ген IMP (2: 16.7 %). Висновки. Виявлення генів blaVIM, blaNDM і blaIMP у місті Уйо викликає занепокоєння, і для запобігання спалахам інфекцій, викликаних MβL-продукуючими грамнегативними бактеріями, виділеними в Уйо (південна Нігерія), потрібно вжити належних заходів інфекційного контролю. PH "Akademperiodyka" of the NAS of Ukraine 2023-12-21 Article Article application/pdf https://ojs.microbiolj.org.ua/index.php/mj/article/view/118 10.15407/microbiolj85.06.015 Mikrobiolohichnyi Zhurnal; Vol. 85 No. 6 (2023): Mikrobiolohichnyi Zhurnal; 15-25 Мікробіологічний журнал; Том 85 № 6 (2023): Мікробіологічний журнал; 15-25 2616-9258 1028-0987 10.15407/microbiolj85.06 en https://ojs.microbiolj.org.ua/index.php/mj/article/view/118/38 Copyright (c) 2023 Mikrobiolohichnyi Zhurnal https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0