ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ

ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ

The method of rapid identification of fish flavobacteriosis using polymerase chain reaction (PCR) was developed. Specifity and efficiency of the selected oligonucleotide primers was confirmed. Nine Flavobacterium strains were isolated from clinically healthy and infected with Flavobacteriosis rainbo...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2014
Автор: Рудь, Ю. П.
Формат: Стаття
Мова:English
Ukrainian
Опубліковано: Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine 2014
Теми:
Flavobacteriosis
rainbow trout
PCR
флавобактеріоз
райдужна форель
ПЛР
Онлайн доступ:https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/190
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Agriciltural microbiology

Репозитарії

Agriciltural microbiology
id oai:ojs2.smic.in.ua:article-190
record_format ojs
spelling oai:ojs2.smic.in.ua:article-1902020-12-31T08:53:52Z RAPID DIAGNOSTIC OF FISH FLAVOBACTERIOSIS USING POLYMERASE CHAIN REACTION ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ Рудь, Ю. П. Flavobacteriosis, rainbow trout, PCR флавобактеріоз, райдужна форель, ПЛР The method of rapid identification of fish flavobacteriosis using polymerase chain reaction (PCR) was developed. Specifity and efficiency of the selected oligonucleotide primers was confirmed. Nine Flavobacterium strains were isolated from clinically healthy and infected with Flavobacteriosis rainbow trout Onchorhynchus mykiss. Flavobacterium columnare strain was identified using the developed rapid diagnosis method. Phylogenetic analysis had indicated the kinship of isolated strains to Flavobacterium genera. Neither F. psychrophylum or F. branchiophilum strains were identified in the isolated samples. The species identification capacity using the 16S rRNA gene restriction analysis was shown. The developed PCR method can be used for rapid identification of different fish flavobacteriosis forms in fish farms in Ukraine. Розроблено метод ідентифікації флавобактеріозу риб за використання полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Показано специфічність та ефективність підібраних олігонуклеотидних праймерів. Від клінічно здорової та хворої на флавобактеріоз райдужної форелі виділено дев’ять штамів флавобактерій. За допомогою розробленого методу ідентифіковано штам Flavobacterium columnare та шляхом філогенетичного аналізу встановлено його спорідненість з іншими представниками роду Flavobacterium. Інших збудників флавобактеріозу, таких як F. psychrophylum та F. branchiophilum не виявлено. Показана можливість видової ідентифікації флавобактерій методом рестрикційного аналізу гена 16S рРНК. Розроблений метод ПЛР може бути використаний для експрес-діагностики різних форм флавобактеріозу риб в рибогосподарських підприємствах України. Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine 2014-03-31 Article Article Рецензована стаття application/pdf application/pdf https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/190 10.35868/1997-3004.18.132-145 Agriciltural microbiology; Vol 18 (2014): Agriciltural microbiology; 132-145 Сільськогосподарська мікробіологія; Том 18 (2014): Сільськогосподарська мікробіологія; 132-145 1997-3004 10.35868/1997-3004.18 en uk https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/190/263 https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/190/264 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
institution Agriciltural microbiology
collection OJS
language English
Ukrainian
topic Flavobacteriosis
rainbow trout
PCR
флавобактеріоз
райдужна форель
ПЛР
spellingShingle Flavobacteriosis
rainbow trout
PCR
флавобактеріоз
райдужна форель
ПЛР
Рудь, Ю. П.
ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
topic_facet Flavobacteriosis
rainbow trout
PCR
флавобактеріоз
райдужна форель
ПЛР
format Article
author Рудь, Ю. П.
author_facet Рудь, Ю. П.
author_sort Рудь, Ю. П.
title ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
title_short ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
title_full ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
title_fullStr ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
title_full_unstemmed ЕКСПРЕС ДІАГНОСТИКА ФЛАВОБАКТЕРІОЗУ РИБ МЕТОДОМ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ
title_sort експрес діагностика флавобактеріозу риб методом полімеразної ланцюгової реакції
title_alt RAPID DIAGNOSTIC OF FISH FLAVOBACTERIOSIS USING POLYMERASE CHAIN REACTION
description The method of rapid identification of fish flavobacteriosis using polymerase chain reaction (PCR) was developed. Specifity and efficiency of the selected oligonucleotide primers was confirmed. Nine Flavobacterium strains were isolated from clinically healthy and infected with Flavobacteriosis rainbow trout Onchorhynchus mykiss. Flavobacterium columnare strain was identified using the developed rapid diagnosis method. Phylogenetic analysis had indicated the kinship of isolated strains to Flavobacterium genera. Neither F. psychrophylum or F. branchiophilum strains were identified in the isolated samples. The species identification capacity using the 16S rRNA gene restriction analysis was shown. The developed PCR method can be used for rapid identification of different fish flavobacteriosis forms in fish farms in Ukraine.
publisher Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine
publishDate 2014
url https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/190
work_keys_str_mv AT rudʹûp rapiddiagnosticoffishflavobacteriosisusingpolymerasechainreaction
AT rudʹûp ekspresdíagnostikaflavobakteríozuribmetodompolímeraznoílancûgovoíreakcíí
first_indexed 2024-09-01T17:54:44Z
last_indexed 2024-09-01T17:54:44Z
_version_ 1809017245023600640

Схожі ресурси