КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН
Objective. Arrangement of the collection of porcine enteroviruses (PEV) strains isolated on the territory of Ukraine in accordance with the requirements of the International Committee on Virus Taxonomy and supplementing it with new strains Teschovirus A (TV-A), Sapelovirus A (SV-A), Enterovirus G (E...
Збережено в:
| Дата: | 2021 |
|---|---|
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Ukrainian |
| Опубліковано: |
Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine
2021
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/459 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Agriciltural microbiology |
Репозитарії
Agriciltural microbiology| id |
oai:ojs2.smic.in.ua:article-459 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| institution |
Agriciltural microbiology |
| baseUrl_str |
|
| datestamp_date |
2022-06-27T13:33:31Z |
| collection |
OJS |
| language |
Ukrainian |
| topic |
Teschovirus A Sapelovirus A Enterovirus G колекція штамів вірусів таксономія номенклатура |
| spellingShingle |
Teschovirus A Sapelovirus A Enterovirus G колекція штамів вірусів таксономія номенклатура С. В. , Дерев’янко КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| topic_facet |
Teschovirus A Sapelovirus A Enterovirus G collection of viral strains taxonomy nomenclature Teschovirus A Sapelovirus A Enterovirus G колекція штамів вірусів таксономія номенклатура |
| format |
Article |
| author |
С. В. , Дерев’янко |
| author_facet |
С. В. , Дерев’янко |
| author_sort |
С. В. , Дерев’янко |
| title |
КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| title_short |
КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| title_full |
КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| title_fullStr |
КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| title_full_unstemmed |
КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН |
| title_sort |
колекція штамів teschovirus a, sapelovirus a, enterovirus g інституту сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва наан |
| title_alt |
COLLECTION OF THE STRAINS TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G OF THE INSTITUTE OF AGRICULTURAL MICROBIOLOGY AND AGROINDUSTRIAL MANUFACTURE OF THE NAAS |
| description |
Objective. Arrangement of the collection of porcine enteroviruses (PEV) strains isolated on the territory of Ukraine in accordance with the requirements of the International Committee on Virus Taxonomy and supplementing it with new strains Teschovirus A (TV-A), Sapelovirus A (SV-A), Enterovirus G (EV-G). Methods. Virological, serological, molecular genetic, instrumental and statistical. Isolation, cultivation of viruses and determination of their biological activity were performed in passaged culture of porcine embryonic kidney cells (СНЕВ). The viral titre was calculated by the method of Reed and Muench. The typical affiliation of viruses was determined in the virus neutralization reaction in СНЕВ cell culture. Species affiliation was determined by reverse transcription polymerase chain reaction (RT PCR) using species-specific primers for TV-A, SV-A and EV-G, developed by us. Electron microscopy of viruses was performed on a transmission electron microscope by negative contrast enhancement method. Statistical processing was performed in Microsoft Office Excel and StatSoft STATISTICA 12. Results. As a result of the epizootic survey during 2002– 2019, 1,216 samples for virological testing were selected. Successive passages of СНЕВ cell culture resulted in obtaining 274 viral isolates. According to the results of studying physicochemical, morphological, biological properties of these isolated, they are classified as PEV. In connection with the change of taxonomy and nomenclature of PEV, serological and genetic reclassification of 30 strains of viruses isolated in Ukraine, including 14 reference strains according to the classification of V. P. Romanenko, 7 production strains, 9 strains with polyantigenic properties and 4 strains that did not have antigenic affinity with viruses of known PEV serotypes according to the classification of V. P. Romanenko was performed. It has been established that the reference strains of PEV according to the trivial classification of V. P. Romanenko belong to the species TV-A of the genus Teschovirus. As a result of conducted serological testing, PEV-10 M 2323, PEV-12 K 22, PEV-13 L 90, PEV-14 M 116, PEV-16 G 95, PEV-17 V 111, PEV-18 Ch 184, PEV-19 D 227, PEV-20 I 249, PEV-23 I 393 were classified as TV-A1; PEV-11 K 9, PEV-15 Ch 73 — as TV-A3, PEV-22 V 151 — as TV-A6. PEV-21 P 142 did not have antigen affinity with reference strains TV-A, SV-A and EV-G and belongs to a new serotype. Production strains of PEV-1 Perechynskyi 642, Bereznianskyi 652, Chernihivskyi 2372 were reclassified as TV-A1. PEV strains with polyantigenic properties such as G 31 and L 2661 have intertypic antigens with TV-A 1, 10, 11 and TV-A 3, 6, 10 serotypes, respectively. PEV strain of a new serotype Ch 881 was reclassified as SV-A. PEV strains Т 3, Ch 863, Ch 878 are the new serotypes of TV-A. Conclusion. As a result of studies, 274 viral isolates were isolated from 1,216 samples of material. The collection was supplemented with 20 reference strains of Teschovirus A, Sapelovirus A and Enterovirus G. Genetic and serological reclassification of 30 PEV strains isolated in Ukraine was performed. The collection of viral strains has been arranged in accordance with modern taxonomy and nomenclature. Seven viral strains were deposited. The collection of viruses has been supplemented with 4 strains of new serotypes of Teschovirus A. |
| publisher |
Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine |
| publishDate |
2021 |
| url |
https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/459 |
| work_keys_str_mv |
AT svderevânko collectionofthestrainsteschovirusasapelovirusaenterovirusgoftheinstituteofagriculturalmicrobiologyandagroindustrialmanufactureofthenaas AT svderevânko kolekcíâštamívteschovirusasapelovirusaenterovirusgínstitutusílʹsʹkogospodarsʹkoímíkrobíologíítaagropromislovogovirobnictvanaan |
| first_indexed |
2025-07-17T12:26:29Z |
| last_indexed |
2025-07-17T12:26:29Z |
| _version_ |
1850411644405940224 |
| spelling |
oai:ojs2.smic.in.ua:article-4592022-06-27T13:33:31Z COLLECTION OF THE STRAINS TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G OF THE INSTITUTE OF AGRICULTURAL MICROBIOLOGY AND AGROINDUSTRIAL MANUFACTURE OF THE NAAS КОЛЕКЦІЯ ШТАМІВ TESCHOVIRUS A, SAPELOVIRUS A, ENTEROVIRUS G ІНСТИТУТУ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКОЇ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА АГРОПРОМИСЛОВОГО ВИРОБНИЦТВА НААН С. В. , Дерев’янко Teschovirus A, Sapelovirus A, Enterovirus G, collection of viral strains, taxonomy, nomenclature Teschovirus A, Sapelovirus A, Enterovirus G, колекція штамів вірусів, таксономія, номенклатура Objective. Arrangement of the collection of porcine enteroviruses (PEV) strains isolated on the territory of Ukraine in accordance with the requirements of the International Committee on Virus Taxonomy and supplementing it with new strains Teschovirus A (TV-A), Sapelovirus A (SV-A), Enterovirus G (EV-G). Methods. Virological, serological, molecular genetic, instrumental and statistical. Isolation, cultivation of viruses and determination of their biological activity were performed in passaged culture of porcine embryonic kidney cells (СНЕВ). The viral titre was calculated by the method of Reed and Muench. The typical affiliation of viruses was determined in the virus neutralization reaction in СНЕВ cell culture. Species affiliation was determined by reverse transcription polymerase chain reaction (RT PCR) using species-specific primers for TV-A, SV-A and EV-G, developed by us. Electron microscopy of viruses was performed on a transmission electron microscope by negative contrast enhancement method. Statistical processing was performed in Microsoft Office Excel and StatSoft STATISTICA 12. Results. As a result of the epizootic survey during 2002– 2019, 1,216 samples for virological testing were selected. Successive passages of СНЕВ cell culture resulted in obtaining 274 viral isolates. According to the results of studying physicochemical, morphological, biological properties of these isolated, they are classified as PEV. In connection with the change of taxonomy and nomenclature of PEV, serological and genetic reclassification of 30 strains of viruses isolated in Ukraine, including 14 reference strains according to the classification of V. P. Romanenko, 7 production strains, 9 strains with polyantigenic properties and 4 strains that did not have antigenic affinity with viruses of known PEV serotypes according to the classification of V. P. Romanenko was performed. It has been established that the reference strains of PEV according to the trivial classification of V. P. Romanenko belong to the species TV-A of the genus Teschovirus. As a result of conducted serological testing, PEV-10 M 2323, PEV-12 K 22, PEV-13 L 90, PEV-14 M 116, PEV-16 G 95, PEV-17 V 111, PEV-18 Ch 184, PEV-19 D 227, PEV-20 I 249, PEV-23 I 393 were classified as TV-A1; PEV-11 K 9, PEV-15 Ch 73 — as TV-A3, PEV-22 V 151 — as TV-A6. PEV-21 P 142 did not have antigen affinity with reference strains TV-A, SV-A and EV-G and belongs to a new serotype. Production strains of PEV-1 Perechynskyi 642, Bereznianskyi 652, Chernihivskyi 2372 were reclassified as TV-A1. PEV strains with polyantigenic properties such as G 31 and L 2661 have intertypic antigens with TV-A 1, 10, 11 and TV-A 3, 6, 10 serotypes, respectively. PEV strain of a new serotype Ch 881 was reclassified as SV-A. PEV strains Т 3, Ch 863, Ch 878 are the new serotypes of TV-A. Conclusion. As a result of studies, 274 viral isolates were isolated from 1,216 samples of material. The collection was supplemented with 20 reference strains of Teschovirus A, Sapelovirus A and Enterovirus G. Genetic and serological reclassification of 30 PEV strains isolated in Ukraine was performed. The collection of viral strains has been arranged in accordance with modern taxonomy and nomenclature. Seven viral strains were deposited. The collection of viruses has been supplemented with 4 strains of new serotypes of Teschovirus A. Мета. Упорядкування колекції штамів ентеровірусів свиней (ЕВС), виділених на території України, відповідно до вимог Міжнародного комітету з таксономії вірусів і доповнення її новими штамами Teschovirus A (TV-A), Sapelovirus A (SV-A), Enterovirus G (EV-G). Методи. Вірусологічні, серологічні, молекулярно-генетичні, інструментальні та статистичні. Виділення, культивування вірусів та визначення їхньої біологічної активності проводили у перещеплюваній культурі клітин нирки ембріону свині (СНЕВ). Титр вірусу розраховували за методом Ріда і Менча. Типову належність вірусів визначали в реакції нейтралізації вірусу в культурі клітин СНЕВ. Видову належність — у полімеразній ланцюговій реакції зі зворотною транскрипцією (ЗТ ПЛР) за використання видоспецифічних праймерів до TV-A, SV-A та EV-G, розроблених нами. Електронну мікроскопію вірусів проводили на трансмісійному електронному мікроскопі методом негативного контрастування. Статистичну обробку проводили в програмах Microsoft Office Excel та StatSoft STATISTICA 12. Результати. У підсумку епізоотичного обстеження впродовж 2002–2019 років відібрано 1216 зразків матеріалів для вірусологічних досліджень. Із застосуванням послідовних пасажів у культурі клітин СНЕВ виділено 274 ізоляти вірусів. За результатами вивчення їхніх фізико-хімічних, морфологічних, біологічних властивостей їх зараховано до ЕВС. У зв’язку зі зміною таксономії та номенклатури ЕВС проведено серологічну та генетичну рекласифікацію 30 штамів вірусів, виділених на території України, серед яких 14 еталонних штамів за класифікацією Романенка В. П., 7 виробничих штамів, 9 штамів з поліантигенними властивостями та 4 штами, які не мали антигенної спорідненості з вірусами відомих серотипів ЕВС за класифікацією Романенка В. П. Встановлено, що еталонні штами ЕВС за тривіальною класифікацією Романенка В. П. належать до виду TV-A роду Teschovirus. У підсумку проведених серологічних досліджень ЕВС-10 M 2323, ЕВС-12 K 22, ЕВС-13 Л 90, ЕВС-14 M 116, ЕВС-16 Г 95, ЕВС-17 B 111, ЕВС-18 Ч 184, ЕВС-19 Д 227, ЕВС-20 И 249, ЕВС-23 И 393 зараховано до TV-A1; ЕВС-11 K 9, ЕВС-15 Ч 73 — до TV-A3; ЕВС-22 B 151 — до TV-A6. ЕВС-21 П 142 не має антигенної спорідненості з еталонними штамами TV-A, SV-A та EV-G і належить до нового серотипу. Виробничі штами ЕВС-1 Перечинський 642, Березнянський 652, Чернігівський 2372 рекласифіковано як TV-A1. Штами ЕВС з поліантигенними властивостями Г 31 та Л 2661 мають міжтипові антигенні з TV-A 1, 10, 11-го та TV-A 3, 6, 10-го серотипів відповідно. Штам ЕВС нового серотипу Ч 881 рекласифіковано як SV-A. Штами ЕВС Т 3, Ч 863, Ч 878 є новими серотипами TV-A. Висновки. У підсумку проведених досліджень з 1216 проб матеріалу виділено 274 ізоляти вірусів. Доповнено колекцію 20 еталонними штамами Teschovirus A, Sapelovirus A та Enterovirus G. Проведено генетичну та серологічну рекласифікацію 30 штамів ЕВС, виділених в Україні. Упорядковано колекцію штамів вірусів відповідно до сучасної таксономії й номенклатури. Депоновано 7 штамів вірусів. Доповнено колекцію вірусів 4 штамами Teschovirus A нових серотипів. Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine 2021-11-11 Article Article Рецензована стаття application/pdf https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/459 10.35868/1997-3004.34.69-85 Agricultural microbiology; Vol. 34 (2021): Agriciltural microbiology; 69-85 Сільськогосподарська мікробіологія; Том 34 (2021): Сільськогосподарська мікробіологія; 69-85 1997-3004 10.35868/1997-3004.34 uk https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/459/538 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |