МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН
Objective. To determine the possibilities of using the RT-PCR method for monitoring viral infectious processes in plants. Methods. Extraction of nucleic acids from tobacco and wheat plants using the STAV protocol and real-time polymerase chain reaction with reverse transcription stage (RT-PCR). Resu...
Saved in:
| Date: | 2025 |
|---|---|
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine
2025
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/551 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Agriciltural microbiology |
Institution
Agriciltural microbiology| _version_ | 1860144480530726912 |
|---|---|
| author | Щукін, Ю. С. Коваленко, О. Г. |
| author_facet | Щукін, Ю. С. Коваленко, О. Г. |
| author_sort | Щукін, Ю. С. |
| baseUrl_str | |
| collection | OJS |
| datestamp_date | 2026-03-19T14:52:43Z |
| description | Objective. To determine the possibilities of using the RT-PCR method for monitoring viral infectious processes in plants. Methods. Extraction of nucleic acids from tobacco and wheat plants using the STAV protocol and real-time polymerase chain reaction with reverse transcription stage (RT-PCR). Results. A real-time PCR method for monitoring viral processes in plants has been created and tested. The study presents optimized protocols for isolation, primers, and fluorescent probes, as well as buffer composition and a selected amplification protocol. The data obtained indicate the sensitivity, specificity, and linearity of the real-time PCR test systems, which allows them to be optimized for quantitative determination for further use in monitoring the viral infection process in plants. Conclusions. The example of TMV and WSMV viruses demonstrates the fundamental possibility of using RT-PCR systems for quantitative assessment of the viral infection course in plants. The results obtained can be used to study other DNA- and RNA-containing viruses. The proposed method has obvious advantages over the methods of detection and monitoring of viral infections in plants (sensitivity, specificity, the possibility of quantitative determination of virus-specific products) that are currently used. However, the peculiarity of its practical implementation is the need for expensive equipment and reagents, as well as the availability of trained, qualified personnel. The practical value of the method will increase after its adaptation to the monitoring of economically important viruses of agricultural crops that reproduce vegetatively (potatoes, strawberries, fruit crops). |
| first_indexed | 2026-03-18T02:00:08Z |
| format | Article |
| id | oai:ojs2.smic.in.ua:article-551 |
| institution | Agriciltural microbiology |
| keywords_txt_mv | keywords |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2026-03-20T02:00:08Z |
| publishDate | 2025 |
| publisher | Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine |
| record_format | ojs |
| spelling | oai:ojs2.smic.in.ua:article-5512026-03-19T14:52:43Z POSSIBILITIES OF USING THE RT-PCR METHOD FOR MONITORING VIRAL INFECTION PROCESSES IN PLANTS МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН Щукін, Ю. С. Коваленко, О. Г. plant viruses, monitoring of viral infectious processes in plants, tobacco mosaic virus (Tobacco mosaic virus, TMV), wheat streak mosaic virus (Wheat Streak Mosaic Virus, WSMV), real-time polymerase chain reaction with reverse transcription (RT-PCR), extraction of nucleic acids from plant material віруси рослин, моніторинг вірусного інфекційного процесу у рослин, вірус тютюнової мозаїки (Tobacco mosaic virus, TMV), вірус смугастої мозаїки пшениці (Wheat Streak Mosaic Virus, WSMV), полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі зі стадією зворотної транскрипції (ЗТ-ПЛР), екстракція нуклеїнових кислот з рослинного матеріалу Objective. To determine the possibilities of using the RT-PCR method for monitoring viral infectious processes in plants. Methods. Extraction of nucleic acids from tobacco and wheat plants using the STAV protocol and real-time polymerase chain reaction with reverse transcription stage (RT-PCR). Results. A real-time PCR method for monitoring viral processes in plants has been created and tested. The study presents optimized protocols for isolation, primers, and fluorescent probes, as well as buffer composition and a selected amplification protocol. The data obtained indicate the sensitivity, specificity, and linearity of the real-time PCR test systems, which allows them to be optimized for quantitative determination for further use in monitoring the viral infection process in plants. Conclusions. The example of TMV and WSMV viruses demonstrates the fundamental possibility of using RT-PCR systems for quantitative assessment of the viral infection course in plants. The results obtained can be used to study other DNA- and RNA-containing viruses. The proposed method has obvious advantages over the methods of detection and monitoring of viral infections in plants (sensitivity, specificity, the possibility of quantitative determination of virus-specific products) that are currently used. However, the peculiarity of its practical implementation is the need for expensive equipment and reagents, as well as the availability of trained, qualified personnel. The practical value of the method will increase after its adaptation to the monitoring of economically important viruses of agricultural crops that reproduce vegetatively (potatoes, strawberries, fruit crops). Мета. З’ясувати можливості використання методу ЗТ-ПЛР для моніторингу вірусного інфекційного процесу у рослин. Методи. Екстракція нуклеїнових кислот із рослин тютюну та пшениці за CTAB-протоколом і метод полімеразної ланцюгової реакції у реальному часі зі стадією зворотної транскрипції (ЗТ-ПЛР). Результати. Створено й відпрацьовано методику ПЛР у реальному часі для моніторингу вірусного процесу у рослин. У роботі наведені оптимізовані протоколи виділення, праймера та флуоресцентні проби, а також склад буферу й підібраний протокол ампліфікації. Отримані дані свідчать про чутливість, специфічність та лінійність отриманих ПЛР-тест-систем у реальному часі, що дає змогу оптимізувати їх для кількісного визначення для подальшого використання в моніторингу вірусного інфекційного процесу у рослин. Висновки. На прикладі вірусів TMV та WSMV показана принципова можливість використання ЗТ-ПЛР-систем для кількісної оцінки перебігу вірусного інфекційного процесу у рослин. Отримані результати можуть бути використані для вивчення інших як ДНК-, так і РНК-вмісних вірусів. Пропонований метод має очевидні переваги перед методами виявлення й моніторингу вірусних інфекцій у рослин (чутливість, специфічність, можливість кількісного визначення віpусоспецифічниx продуктів), які використовуються на сьогодні. Проте особливість його практичної реалізації полягає в необхідності вартісного обладнання й реактивів, а також в наявності підготовленого, кваліфікованого персоналу. Практична цінність методу зросте після його адаптації до моніторингу економічно важливих вірусів сільськогосподарських культур, які розмножуються вегетативно (картопля, полуниця, плодові культури). Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine 2025-12-29 Article Article Рецензована стаття application/pdf https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/551 10.35868/1997-3004.42.110-116 Agricultural microbiology; Vol. 42 (2025): Agriciltural microbiology; 110-116 Сільськогосподарська мікробіологія; Том 42 (2025): Сільськогосподарська мікробіологія; 110-116 1997-3004 10.35868/1997-3004.42 uk https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/551/619 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
| spellingShingle | віруси рослин моніторинг вірусного інфекційного процесу у рослин вірус тютюнової мозаїки (Tobacco mosaic virus TMV) вірус смугастої мозаїки пшениці (Wheat Streak Mosaic Virus WSMV) полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі зі стадією зворотної транскрипції (ЗТ-ПЛР) екстракція нуклеїнових кислот з рослинного матеріалу Щукін, Ю. С. Коваленко, О. Г. МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title | МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title_alt | POSSIBILITIES OF USING THE RT-PCR METHOD FOR MONITORING VIRAL INFECTION PROCESSES IN PLANTS |
| title_full | МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title_fullStr | МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title_full_unstemmed | МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title_short | МОЖЛИВОСТІ ВИКОРИСТАННЯ МЕТОДУ ЗТ-ПЛР ДЛЯ МОНІТОРИНГУ ВІРУСНОГО ІНФЕКЦІЙНОГО ПРОЦЕСУ У РОСЛИН |
| title_sort | можливості використання методу зт-плр для моніторингу вірусного інфекційного процесу у рослин |
| topic | віруси рослин моніторинг вірусного інфекційного процесу у рослин вірус тютюнової мозаїки (Tobacco mosaic virus TMV) вірус смугастої мозаїки пшениці (Wheat Streak Mosaic Virus WSMV) полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі зі стадією зворотної транскрипції (ЗТ-ПЛР) екстракція нуклеїнових кислот з рослинного матеріалу |
| topic_facet | plant viruses monitoring of viral infectious processes in plants tobacco mosaic virus (Tobacco mosaic virus TMV) wheat streak mosaic virus (Wheat Streak Mosaic Virus WSMV) real-time polymerase chain reaction with reverse transcription (RT-PCR) extraction of nucleic acids from plant material віруси рослин моніторинг вірусного інфекційного процесу у рослин вірус тютюнової мозаїки (Tobacco mosaic virus TMV) вірус смугастої мозаїки пшениці (Wheat Streak Mosaic Virus WSMV) полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі зі стадією зворотної транскрипції (ЗТ-ПЛР) екстракція нуклеїнових кислот з рослинного матеріалу |
| url | https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/551 |
| work_keys_str_mv | AT ŝukínûs possibilitiesofusingthertpcrmethodformonitoringviralinfectionprocessesinplants AT kovalenkoog possibilitiesofusingthertpcrmethodformonitoringviralinfectionprocessesinplants AT ŝukínûs možlivostívikoristannâmetoduztplrdlâmonítoringuvírusnogoínfekcíjnogoprocesuuroslin AT kovalenkoog možlivostívikoristannâmetoduztplrdlâmonítoringuvírusnogoínfekcíjnogoprocesuuroslin |