MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach

MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2016
Автори:	V. V. Mykuliak, I. S. Voiteshenko, O. I. Korneliuk
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	2016
Назва видання:	Reports of the National Academy of Sciences of Ukraine
Онлайн доступ:	http://jnas.nbuv.gov.ua/article/UJRN-0000461009
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Library portal of National Academy of Sciences of Ukraine \| LibNAS

Репозитарії

Library portal of National Academy of Sciences of Ukraine | LibNAS

Схожі ресурси

Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
за авторством: Микуляк, В.В., та інші
Опубліковано: (2016)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Grom, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

Molecular cloning, sequencing and sequence analysis of Thermus thermophilus tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2004)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Yu. Grom, та інші
Опубліковано: (2015)

Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2006)

Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Kornelyuk, A., та інші
Опубліковано: (1999)

Homology modeling of structure of NH₂-terminal module of mammalian (Bos taurus) tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Odynets, K.A., та інші
Опубліковано: (2002)

Computational modeling of molecular dynamics of G41R mutant form of human tyrosyl-tRNA synthetase, assosiated with Charcot-Marie-Tooth neuropathy
за авторством: O. V. Savytskyi, та інші
Опубліковано: (2015)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNA Pro
за авторством: A. D. Yaremchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: N. A. Pydiura, та інші
Опубліковано: (2012)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Структура і динаміка тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383
за авторством: Микуляк, В.В., та інші
Опубліковано: (2014)

Дизайн інгібіторів активного центру тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis на основі інгібітора SB-219383
за авторством: Микуляк, В.В., та інші
Опубліковано: (2014)

The immunochemical cross-reactivity between cytoplasmic and mitochondrial mammalian lysyl-tRNA synthetases
за авторством: Sidorik, L.L., та інші
Опубліковано: (2000)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: Tukalo, M.A., та інші
Опубліковано: (2013)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: M. A. Tukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

Leucyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus. Purification and some properties of the crystallizing enzyme
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2001)

Expression and purification of full-length Alanyl-tRNA-synthetase from Thermus thermophilus HB27
за авторством: Rybak, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2018)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNAPro
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2012)

Association of mitochondrial lysyl-tRNA synthetase with HIV-1 GagPol involves catalytic domain of the synthetase and transframe and integrase domains of Pol
за авторством: Kobbi, L., та інші
Опубліковано: (2011)

Prediction of chemoresistant pulmonary tuberculosis severity depending on Mycobacterium Tuberculosis genotypes
за авторством: A. V. Rogozhin
Опубліковано: (2018)

Clusters of Mycobacterium tuberculosis genotypes in Odesa region
за авторством: P. B. Antonenko, та інші
Опубліковано: (2016)

In silico determination of T-epitopes of Mycobacterium tuberculosis proteins
за авторством: O. I. Krynina, та інші
Опубліковано: (2014)

Molecular technologies in detecting sensitive and isoniazidresistant mycobacterium tuberculosis
за авторством: Yu. Lymanska, та інші
Опубліковано: (2011)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: Rayevsky, A.V., та інші
Опубліковано: (2016)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: A. V. Rayevsky, та інші
Опубліковано: (2016)

Identification of modern and ancient Beijing strain sublineages in Kyiv's population of Mycobacterium tuberculosis
за авторством: Yu. O. Cherednyk, та інші
Опубліковано: (2015)

Realistic interatomic potential for MD simulations
за авторством: Eremeichenkova, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2003)

Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis
за авторством: Чередник, Ю.О., та інші
Опубліковано: (2015)

Obtaining of transgenic carrot (Daucus carota L.) plants expressing the genes of secretory Mycobacterium tuberculosis proteins
за авторством: Ju. S. Luchakivskaja, та інші
Опубліковано: (2011)

Микст−инфекция Mycobacterium tuberculosis, Epstein−Barr virus, Herpes human virus VI у детей
за авторством: Нелюбин, В.Н., та інші
Опубліковано: (2005)

Recognition of Mycobacterium tuberculosis antigens MPT63 and MPT83 by murine polyclonal and scFv antibodies
за авторством: A. A. Siromolot, та інші
Опубліковано: (2018)

Immunogenicity assay of KatG protein from Mycobacterium tuberculosis in mice: preliminary screening of TB vaccine
за авторством: P. Purkan, та інші
Опубліковано: (2018)

Mycobacterium tuberculosis antigens MPT63 and MPT83 increase phagocytic activity of murine peritoneal macrophages
за авторством: A. A. Siromolot, та інші
Опубліковано: (2016)

Mutation of katG in a clinical isolate of Mycobacterium tuberculosis: effects on catalase-peroxidase for isoniazid activation
за авторством: Purkan, та інші
Опубліковано: (2016)

Nucleotide sequences of tRNA-methionine genes of streptomyces globisporus 1912-2, identified in silico
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2016)