Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration r...
Збережено в:
| Дата: | 2018 |
|---|---|
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська Українська |
| Опубліковано: |
Publishing house "Academperiodika"
2018
|
| Онлайн доступ: | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainian Journal of Physics |
Репозитарії
Ukrainian Journal of Physics| _version_ | 1863131138820669440 |
|---|---|
| author | Kutovyy, S. Yu. Savchuk, R. S. Bashmakova, N. V. Hovorun, D. M. Zaika, L. A. |
| author_facet | Kutovyy, S. Yu. Savchuk, R. S. Bashmakova, N. V. Hovorun, D. M. Zaika, L. A. |
| author_sort | Kutovyy, S. Yu. |
| baseUrl_str | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/oai |
| collection | OJS |
| datestamp_date | 2018-09-28T07:52:35Z |
| description | The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration ratio N/c between the DNA base pairs and the ligand molecules is plotted. Using the system of modified Scatchard and McGhee–von Hippel equations, the parameters of the binding of amitozinoberamid to DNA are determined. A comparative analysis of the DNA interaction with amitozinoberamid, on the one hand, and berberine and sanguinarine alkaloids, on the other hand, is carried out. The structure and the spectra of electron absorption of thiotepa, berberine, and amitozinoberamid molecules are calculated in the framework of the density functional theory at the DFT B3LYP/6-31G(d,p) level. |
| doi_str_mv | 10.15407/ujpe63.8.709 |
| first_indexed | 2025-10-02T01:13:58Z |
| format | Article |
| id | ujp2-article-2018119 |
| institution | Ukrainian Journal of Physics |
| keywords_txt_mv | keywords |
| language | English Ukrainian |
| last_indexed | 2025-10-02T01:13:58Z |
| publishDate | 2018 |
| publisher | Publishing house "Academperiodika" |
| record_format | ojs |
| spelling | ujp2-article-20181192018-09-28T07:52:35Z Mechanisms and Parameters of the Binding of Amitozinoberamid to DNA in the Aqueous Solution Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині Kutovyy, S. Yu. Savchuk, R. S. Bashmakova, N. V. Hovorun, D. M. Zaika, L. A. The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration ratio N/c between the DNA base pairs and the ligand molecules is plotted. Using the system of modified Scatchard and McGhee–von Hippel equations, the parameters of the binding of amitozinoberamid to DNA are determined. A comparative analysis of the DNA interaction with amitozinoberamid, on the one hand, and berberine and sanguinarine alkaloids, on the other hand, is carried out. The structure and the spectra of electron absorption of thiotepa, berberine, and amitozinoberamid molecules are calculated in the framework of the density functional theory at the DFT B3LYP/6-31G(d,p) level. Методами оптичної спектроскопiї – електронного поглинання та флюоресценцiї дослiджено процеси взаємодiї препарату амiтозиноберамiду (алкiлований тiотефом берберин) з макромолекулою ДНК, у водному розчинi. На основi отриманих результатiв побудовано залежностi спектральних характеристик вiд N/c – вiдношення концентрацiї пар основ ДНК до концентрацiї молекул лiганду. Користуючись системою модифiкованих рiвнянь Скетчарда та МакГi-фон Хiппеля, визначено параметри зв’язування амiтозиноберамiду з ДНК. Проведено порiвняльний аналiз ефективностi взаємодiї з ДНК амiтозиноберамiду та алкалоїдiв берберину i сангвiнарину. Методом функцiонала густини на рiвнi теорiї DFT B3LYP/6-31G(d,p) розраховано структуру та спектри електронного поглинання молекул тiотефу, берберину та амiтозиноберамiду. Publishing house "Academperiodika" 2018-09-07 Article Article Original Research Article (peer-reviewed) Оригінальна дослідницька стаття (з незалежним рецензуванням) application/pdf application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119 10.15407/ujpe63.8.709 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 63 No. 8 (2018); 709 Український фізичний журнал; Том 63 № 8 (2018); 709 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe63.8 en uk https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119/145 https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119/146 Copyright (c) 2018 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine |
| spellingShingle | Kutovyy, S. Yu. Savchuk, R. S. Bashmakova, N. V. Hovorun, D. M. Zaika, L. A. Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title | Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title_alt | Mechanisms and Parameters of the Binding of Amitozinoberamid to DNA in the Aqueous Solution |
| title_full | Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title_fullStr | Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title_full_unstemmed | Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title_short | Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині |
| title_sort | механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з днк у водному розчині |
| url | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119 |
| work_keys_str_mv | AT kutovyysyu mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution AT savchukrs mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution AT bashmakovanv mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution AT hovorundm mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution AT zaikala mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution AT kutovyysyu mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní AT savchukrs mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní AT bashmakovanv mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní AT hovorundm mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní AT zaikala mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní |