Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині

Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині

The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration r...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2018
Автори: Kutovyy, S. Yu., Savchuk, R. S., Bashmakova, N. V., Hovorun, D. M., Zaika, L. A.
Формат: Стаття
Мова:English
Ukrainian
Опубліковано: Publishing house "Academperiodika" 2018
Онлайн доступ:https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Ukrainian Journal of Physics

Репозитарії

Ukrainian Journal of Physics
id ujp2-article-2018119
record_format ojs
spelling ujp2-article-20181192018-09-28T07:52:35Z Mechanisms and Parameters of the Binding of Amitozinoberamid to DNA in the Aqueous Solution Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині Kutovyy, S. Yu. Savchuk, R. S. Bashmakova, N. V. Hovorun, D. M. Zaika, L. A. The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration ratio N/c between the DNA base pairs and the ligand molecules is plotted. Using the system of modified Scatchard and McGhee–von Hippel equations, the parameters of the binding of amitozinoberamid to DNA are determined. A comparative analysis of the DNA interaction with amitozinoberamid, on the one hand, and berberine and sanguinarine alkaloids, on the other hand, is carried out. The structure and the spectra of electron absorption of thiotepa, berberine, and amitozinoberamid molecules are calculated in the framework of the density functional theory at the DFT B3LYP/6-31G(d,p) level. Методами оптичної спектроскопiї – електронного поглинання та флюоресценцiї дослiджено процеси взаємодiї препарату амiтозиноберамiду (алкiлований тiотефом берберин) з макромолекулою ДНК, у водному розчинi. На основi отриманих результатiв побудовано залежностi спектральних характеристик вiд N/c – вiдношення концентрацiї пар основ ДНК до концентрацiї молекул лiганду. Користуючись системою модифiкованих рiвнянь Скетчарда та МакГi-фон Хiппеля, визначено параметри зв’язування амiтозиноберамiду з ДНК. Проведено порiвняльний аналiз ефективностi взаємодiї з ДНК амiтозиноберамiду та алкалоїдiв берберину i сангвiнарину. Методом функцiонала густини на рiвнi теорiї DFT B3LYP/6-31G(d,p) розраховано структуру та спектри електронного поглинання молекул тiотефу, берберину та амiтозиноберамiду. Publishing house "Academperiodika" 2018-09-07 Article Article Original Research Article (peer-reviewed) Оригінальна дослідницька стаття (з незалежним рецензуванням) application/pdf application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119 10.15407/ujpe63.8.709 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 63 No. 8 (2018); 709 Український фізичний журнал; Том 63 № 8 (2018); 709 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe63.8 en uk https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119/145 https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119/146 Copyright (c) 2018 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine
institution Ukrainian Journal of Physics
collection OJS
language English
Ukrainian
format Article
author Kutovyy, S. Yu.
Savchuk, R. S.
Bashmakova, N. V.
Hovorun, D. M.
Zaika, L. A.
spellingShingle Kutovyy, S. Yu.
Savchuk, R. S.
Bashmakova, N. V.
Hovorun, D. M.
Zaika, L. A.
Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
author_facet Kutovyy, S. Yu.
Savchuk, R. S.
Bashmakova, N. V.
Hovorun, D. M.
Zaika, L. A.
author_sort Kutovyy, S. Yu.
title Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
title_short Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
title_full Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
title_fullStr Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
title_full_unstemmed Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
title_sort механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з днк у водному розчині
title_alt Mechanisms and Parameters of the Binding of Amitozinoberamid to DNA in the Aqueous Solution
description The interaction between the amitozinoberamid preparation (thiotepa-alkylated berberine) and a DNA macromolecule in the aqueous solution has been studied, by using the optical spectroscopy methods: electron absorption and fluorescence. The dependence of spectral characteristics on the concentration ratio N/c between the DNA base pairs and the ligand molecules is plotted. Using the system of modified Scatchard and McGhee–von Hippel equations, the parameters of the binding of amitozinoberamid to DNA are determined. A comparative analysis of the DNA interaction with amitozinoberamid, on the one hand, and berberine and sanguinarine alkaloids, on the other hand, is carried out. The structure and the spectra of electron absorption of thiotepa, berberine, and amitozinoberamid molecules are calculated in the framework of the density functional theory at the DFT B3LYP/6-31G(d,p) level.
publisher Publishing house "Academperiodika"
publishDate 2018
url https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018119
work_keys_str_mv AT kutovyysyu mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution
AT savchukrs mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution
AT bashmakovanv mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution
AT hovorundm mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution
AT zaikala mechanismsandparametersofthebindingofamitozinoberamidtodnaintheaqueoussolution
AT kutovyysyu mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní
AT savchukrs mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní
AT bashmakovanv mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní
AT hovorundm mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní
AT zaikala mehanízmitaparametrizvâzuvannâamítozinoberamíduzdnkuvodnomurozčiní
first_indexed 2023-03-24T08:54:50Z
last_indexed 2023-03-24T08:54:50Z
_version_ 1795757593756434432

Схожі ресурси