Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК
This article presented the results of investigations of the optical absorption (at 300 K) and steady-state and time-resolved luminescence (at 78 K) of (–)PBS and (+)PBS oligonucleotides. (–)PBS is the DNA form of the minus primer binding site (5′GTCCCTGTTCGGGCGCCA3′) of the human immunodeficiency vi...
Збережено в:
| Дата: | 2018 |
|---|---|
| Автори: | , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Publishing house "Academperiodika"
2018
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018168 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainian Journal of Physics |
Репозитарії
Ukrainian Journal of Physics| id |
ujp2-article-2018168 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| spelling |
ujp2-article-20181682018-11-03T14:29:03Z Spectral Properties of Single-Stranded Viral DNA Fragment Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК Kudrya, V. Yu. Yashchuk, V. M. Naumenko, A. P. Mely, Y. Udod, T. V. Kreminska, Yu. S. G-quadruplex primary binding site of HIV-1 genome DNA fluorescence phosphorescence singlet and triplet electronic excitations - This article presented the results of investigations of the optical absorption (at 300 K) and steady-state and time-resolved luminescence (at 78 K) of (–)PBS and (+)PBS oligonucleotides. (–)PBS is the DNA form of the minus primer binding site (5′GTCCCTGTTCGGGCGCCA3′) of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)genome, and (+)PBS (3′CAGGGACAAGCCCGCGGT5′) is its complementary sequence [1]. The optical absorption spectra of (–)PBS and (+)PBS do not coincide with the correspondent equimolar sums of the spectra of nucleotides that are in their composition. The difference between them at 295 nm is related to the existence of some stable complex between bases (possibly, G-complexes). The fluorescence spectral bands of (–)PBS and (+)PBS are close to each other and to the band of oligonucleotide investigated by us in [2]. In our opinion, the (–)PBS and (+)PBS bands are connected possibly with the fluorescence of some complexes that are manifested in the absorption. The phosphorescence spectral bands of (–)PBS and (+)PBS are close to each other and to the band of dAMP (in the wavelength interval 370–470 nm). The difference between the (–)PBS/(+)PBS and dAMP phosphorescence spectra (at 530 nm) is associated with an unknown center (possibly, G-complexes). Thus, the main centers of the triplet excitation capturing in (–)PBS and (+)PBS are A-bases and centers of an unknown nature. Представлено результати дослiджень оптичного поглинання (при 300 К), стацiонарної та роздiленої у часi люмiнесценцiї (при 78 К) олiгонуклеотидiв (–)PBS та (+)PBS. (–)PBS являє собою ДНК-форму дiлянки, що зв’язує праймiс мiнуса (5′GTCCCTGTTCGGGCGCCA3′) генома вiрусу iмунодефiциту людини 1 типу (ВIЛ-1) та (+)PBS (3′CAGGGACAAGCCCGCGGT5′) є його комплементарною послiдовнiстю [1]. Спектри оптичного поглинання (–)PBS та (+)PBS не збiгаються з вiдповiдними еквiмолярними сумами спектрiв нуклеотидiв, що входять до їх складу. Рiзниця мiж ними при 295 нм пов’язана з iснуванням деякого стабiльного комплексу мiж базами (можливо, G-комплексами). Смуги спектрiв флуоресценцiї (–)PBS та (+)PBS є близькими один до одного та до зони олiгону-клеотиду, дослiджуваного нами в [2]. На наш погляд, зони (–)PBS та (+)PBS зв’язанi, можливо, з флуоресценцiєю деяких комплексiв, якi проявляються в поглинаннi. Зони спектра фосфоресценцiї (–)PBS та (+)PBS є близькими один до одного та до смуги dAMP (в дiапазонi довжин хвиль 370–470 нм). Рiзниця мiж (–)PBS/(+)PBS та спектром фосфоресценцiї dAMP (при 530 нм) асоцiюється з невiдомим центром (можливо, G-комплексами). Таким чином, основнiцентри триплетного збудження, що захоплюють (–)PBS та (+)PBS, є А-базами та центрами невiдомої природи. Publishing house "Academperiodika" 2018-10-31 Article Article Original Research Article (peer-reviewed) Оригінальна дослідницька стаття (з незалежним рецензуванням) application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018168 10.15407/ujpe63.10.912 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 63 No. 10 (2018); 912 Український фізичний журнал; Том 63 № 10 (2018); 912 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe63.10 en https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018168/646 Copyright (c) 2018 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine |
| institution |
Ukrainian Journal of Physics |
| collection |
OJS |
| language |
English |
| topic |
G-quadruplex primary binding site of HIV-1 genome DNA fluorescence phosphorescence singlet and triplet electronic excitations - |
| spellingShingle |
G-quadruplex primary binding site of HIV-1 genome DNA fluorescence phosphorescence singlet and triplet electronic excitations - Kudrya, V. Yu. Yashchuk, V. M. Naumenko, A. P. Mely, Y. Udod, T. V. Kreminska, Yu. S. Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| topic_facet |
G-quadruplex primary binding site of HIV-1 genome DNA fluorescence phosphorescence singlet and triplet electronic excitations - |
| format |
Article |
| author |
Kudrya, V. Yu. Yashchuk, V. M. Naumenko, A. P. Mely, Y. Udod, T. V. Kreminska, Yu. S. |
| author_facet |
Kudrya, V. Yu. Yashchuk, V. M. Naumenko, A. P. Mely, Y. Udod, T. V. Kreminska, Yu. S. |
| author_sort |
Kudrya, V. Yu. |
| title |
Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| title_short |
Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| title_full |
Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| title_fullStr |
Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| title_full_unstemmed |
Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК |
| title_sort |
спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної днк |
| title_alt |
Spectral Properties of Single-Stranded Viral DNA Fragment |
| description |
This article presented the results of investigations of the optical absorption (at 300 K) and steady-state and time-resolved luminescence (at 78 K) of (–)PBS and (+)PBS oligonucleotides. (–)PBS is the DNA form of the minus primer binding site (5′GTCCCTGTTCGGGCGCCA3′) of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)genome, and (+)PBS (3′CAGGGACAAGCCCGCGGT5′) is its complementary sequence [1]. The optical absorption spectra of (–)PBS and (+)PBS do not coincide with the correspondent equimolar sums of the spectra of nucleotides that are in their composition. The difference between them at 295 nm is related to the existence of some stable complex between bases (possibly, G-complexes). The fluorescence spectral bands of (–)PBS and (+)PBS are close to each other and to the band of oligonucleotide investigated by us in [2]. In our opinion, the (–)PBS and (+)PBS bands are connected possibly with the fluorescence of some complexes that are manifested in the absorption. The phosphorescence spectral bands of (–)PBS and (+)PBS are close to each other and to the band of dAMP (in the wavelength interval 370–470 nm). The difference between the (–)PBS/(+)PBS and dAMP phosphorescence spectra (at 530 nm) is associated with an unknown center (possibly, G-complexes). Thus, the main centers of the triplet excitation capturing in (–)PBS and (+)PBS are A-bases and centers of an unknown nature. |
| publisher |
Publishing house "Academperiodika" |
| publishDate |
2018 |
| url |
https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018168 |
| work_keys_str_mv |
AT kudryavyu spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT yashchukvm spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT naumenkoap spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT melyy spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT udodtv spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT kreminskayus spectralpropertiesofsinglestrandedviraldnafragment AT kudryavyu spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk AT yashchukvm spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk AT naumenkoap spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk AT melyy spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk AT udodtv spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk AT kreminskayus spektralʹnívlastivostíodnolancûgovihfragmentívvírusnoídnk |
| first_indexed |
2023-03-24T08:55:00Z |
| last_indexed |
2023-03-24T08:55:00Z |
| _version_ |
1795757598259019776 |