Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК
Infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) causes the severe disease of salmonid fishes (trout, salmon, etc.) The IPNV virion consists of a double-stranded viral RNA surrounded by a protein capsid. The aim of the work is to determine the role of IPNV virion constituents (capsid proteins and viral R...
Збережено в:
| Дата: | 2019 |
|---|---|
| Автори: | , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська |
| Опубліковано: |
Publishing house "Academperiodika"
2019
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018411 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainian Journal of Physics |
Репозитарії
Ukrainian Journal of Physics| _version_ | 1863131187434749952 |
|---|---|
| author | Kravchenko, V. M. Rud, Yu. P. Buchatski, L. P. Stepanenko, Ye. Yu. Gryn, D. V. Yashchuk, V. M. |
| author_facet | Kravchenko, V. M. Rud, Yu. P. Buchatski, L. P. Stepanenko, Ye. Yu. Gryn, D. V. Yashchuk, V. M. |
| author_sort | Kravchenko, V. M. |
| baseUrl_str | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/oai |
| collection | OJS |
| datestamp_date | 2019-02-27T07:38:39Z |
| description | Infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) causes the severe disease of salmonid fishes (trout, salmon, etc.) The IPNV virion consists of a double-stranded viral RNA surrounded by a protein capsid. The aim of the work is to determine the role of IPNV virion constituents (capsid proteins and viral RNA) in the formation of spectral properties of the whole IPNV virions. We have measured the UV-Vis absorption, fluorescence, fluorescence excitation, phosphorescence and phosphorescence excitation spectra of IPNV virions, major capsid protein (MCP), and viral RNA dissolved in different buffers. It is shown that the UV absorption of IPNV virions is caused by the absorption of both capsid proteins and viral RNA. The fluorescence of IPNV MCP and virions may be attributed to tyrosine and tyrosine + tryptophan, respectively. The low-temperature phosphorescence of virions can be attributed to that of capsid proteins, rather than viral RNA. The IPNV RNA phosphorescence spectrum exhibits the electronic-vibrational structure and may be due to the emission of adenine links. |
| doi_str_mv | 10.15407/ujpe64.2.120 |
| first_indexed | 2025-10-02T01:14:39Z |
| format | Article |
| id | ujp2-article-2018411 |
| institution | Ukrainian Journal of Physics |
| keywords_txt_mv | keywords |
| language | English |
| last_indexed | 2025-10-02T01:14:39Z |
| publishDate | 2019 |
| publisher | Publishing house "Academperiodika" |
| record_format | ojs |
| spelling | ujp2-article-20184112019-02-27T07:38:39Z Spectroscopic Studies of Infectious Pancreatic Necrosis Virus, Its Major Capsid Protein, and RNA Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК Kravchenko, V. M. Rud, Yu. P. Buchatski, L. P. Stepanenko, Ye. Yu. Gryn, D. V. Yashchuk, V. M. - - infectious pancreatic necrosis virus RNA capsid proteins aromatic amino acids spectroscopy absorption fluorescence phosphorescence - Infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) causes the severe disease of salmonid fishes (trout, salmon, etc.) The IPNV virion consists of a double-stranded viral RNA surrounded by a protein capsid. The aim of the work is to determine the role of IPNV virion constituents (capsid proteins and viral RNA) in the formation of spectral properties of the whole IPNV virions. We have measured the UV-Vis absorption, fluorescence, fluorescence excitation, phosphorescence and phosphorescence excitation spectra of IPNV virions, major capsid protein (MCP), and viral RNA dissolved in different buffers. It is shown that the UV absorption of IPNV virions is caused by the absorption of both capsid proteins and viral RNA. The fluorescence of IPNV MCP and virions may be attributed to tyrosine and tyrosine + tryptophan, respectively. The low-temperature phosphorescence of virions can be attributed to that of capsid proteins, rather than viral RNA. The IPNV RNA phosphorescence spectrum exhibits the electronic-vibrational structure and may be due to the emission of adenine links. Вiрус iнфекцiйного панкреатичного некрозу (ВIПН) викликає серйознi захворювання риб сiмейства лососевих (форелi, лосося тощо). Вiрiон ВIПН складається з дволанцюгової вiрусної РНК, оточеної бiлковим капсидом. Метою роботи було визначення ролi складових вiрiона ВIПН (капсидних бiлкiв та вiрусної РНК) у формуваннi спектральних властивостей цiлих вiрiонiв. В УФ та видимiй областях спектра було вимiряно спектри поглинання, флюоресценцiї, збудження флюоресценцiї, фосфоресценцiї та збудження фосфоресценцiї вiрiонiв ВIПН, головного капсидного бiлка та вiрусної РНК, розчинених у рiзних буферах. Показано, що поглинання вiрiонiв в УФ областi спектра зумовлене поглинанням як капсидних бiлкiв, так i вiрусної РНК. Флюресценцiя головного капсидного бiлка та цiлих вiрiонiв може бути зумовлена флюоресценцiєю тирозину та тирозину + триптофану вiдповiдно. Низькотемпературна фосфоресценцiя вiрiонiв зумовлена, скорiш за все, фосфоресценцiєю капсидних бiлкiв, а не вiрусної РНК. У спектрi фосфоресценцiї вiрусної РНК спостерiгається електронно-коливальна структура, яка може вiдповiдати аденiну. Publishing house "Academperiodika" 2019-02-21 Article Article Original Research Article (peer-reviewed) Оригінальна дослідницька стаття (з незалежним рецензуванням) application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018411 10.15407/ujpe64.2.120 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 64 No. 2 (2019); 120 Український фізичний журнал; Том 64 № 2 (2019); 120 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe64.2 en https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018411/1326 Copyright (c) 2019 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine |
| spellingShingle | - - Kravchenko, V. M. Rud, Yu. P. Buchatski, L. P. Stepanenko, Ye. Yu. Gryn, D. V. Yashchuk, V. M. Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title | Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title_alt | Spectroscopic Studies of Infectious Pancreatic Necrosis Virus, Its Major Capsid Protein, and RNA |
| title_full | Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title_fullStr | Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title_full_unstemmed | Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title_short | Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК |
| title_sort | спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та рнк |
| topic | - - |
| topic_facet | - - infectious pancreatic necrosis virus RNA capsid proteins aromatic amino acids spectroscopy absorption fluorescence phosphorescence - |
| url | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018411 |
| work_keys_str_mv | AT kravchenkovm spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT rudyup spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT buchatskilp spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT stepanenkoyeyu spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT gryndv spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT yashchukvm spectroscopicstudiesofinfectiouspancreaticnecrosisvirusitsmajorcapsidproteinandrna AT kravchenkovm spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk AT rudyup spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk AT buchatskilp spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk AT stepanenkoyeyu spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk AT gryndv spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk AT yashchukvm spektroskopíčnídoslídžennâvírusuínfekcíjnogopankreatičnogonekrozujogogolovnogokapsidnogobílkatarnk |