Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК

The energy analysis of a dimerization in aqueous solutions of seven biologically active lexitropsins, which are different by structure, was carried out with the use of the molecular simulation method. The main stabilization of dimers was shown to take place owing to hydrophobic and intermolecular va...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2018
Автори:	Kostjukov, V. V., Miloserdova, Yu. G., Shram, O. A., Rubinson, M. A., Evstigneev, M. P.
Формат:	Стаття
Мова:	English Ukrainian
Опубліковано:	Publishing house "Academperiodika" 2018
Теми:	lexitropsins dimer peptide group aromatic ring energy contributions лекситропсины димер пептидная группа ароматическое кольцо энергетические вклады
Онлайн доступ:	https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018471
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Ukrainian Journal of Physics

Репозитарії

Ukrainian Journal of Physics

id	ujp2-article-2018471
record_format	ojs
spelling	ujp2-article-20184712019-03-29T09:30:31Z Dimerization Energetics of DNA Minor Groove Binders Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК Kostjukov, V. V. Miloserdova, Yu. G. Shram, O. A. Rubinson, M. A. Evstigneev, M. P. lexitropsins dimer peptide group aromatic ring energy contributions лекситропсины димер пептидная группа ароматическое кольцо энергетические вклады The energy analysis of a dimerization in aqueous solutions of seven biologically active lexitropsins, which are different by structure, was carried out with the use of the molecular simulation method. The main stabilization of dimers was shown to take place owing to hydrophobic and intermolecular van der Waals interactions. The latter are mainly associated with energy-favorable contacts between the aromatic rings of molecules and their peptide groups. Despite the significant dipole moments of the molecules concerned, the electrostatic interactions are relatively weak and destabilize the complexes because of the unfavorable relative arrangement of molecular dipoles. Entropic factors and the dehydration were shown to also hinder the dimerization. Методами молекулярного моделирования выполнен энергетический анализ димеризации в водном растворе семи различных по структуре биологически-активных лекситропсинов. Показано, что основная стабилизация димеров происходит за счет гидрофобных и межмолекулярных ван-дер-ваальсовских взаимодействий. Последние обусловлены в основном энергетически выгодными контактами между ароматическими кольцами молекул, а также колец с пептидными группами. Электростатические взаимодействия, несмотря на значительные дипольные моменты молекул, весьма слабы и дестабилизируют комплекс в силу невыгодного взаимного расположения молекулярных диполей. Энтропийные факторы и дегидратация также препятствуют димеризации. Publishing house "Academperiodika" 2018-10-23 Article Article application/pdf application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018471 10.15407/ujpe59.05.0461 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 59 No. 5 (2014); 461 Український фізичний журнал; Том 59 № 5 (2014); 461 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe59.05 en uk https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018471/478 https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018471/479 Copyright (c) 2018 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine
institution	Ukrainian Journal of Physics
collection	OJS
language	English Ukrainian
topic	lexitropsins dimer peptide group aromatic ring energy contributions лекситропсины димер пептидная группа ароматическое кольцо энергетические вклады
spellingShingle	lexitropsins dimer peptide group aromatic ring energy contributions лекситропсины димер пептидная группа ароматическое кольцо энергетические вклады Kostjukov, V. V. Miloserdova, Yu. G. Shram, O. A. Rubinson, M. A. Evstigneev, M. P. Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
topic_facet	lexitropsins dimer peptide group aromatic ring energy contributions лекситропсины димер пептидная группа ароматическое кольцо энергетические вклады
format	Article
author	Kostjukov, V. V. Miloserdova, Yu. G. Shram, O. A. Rubinson, M. A. Evstigneev, M. P.
author_facet	Kostjukov, V. V. Miloserdova, Yu. G. Shram, O. A. Rubinson, M. A. Evstigneev, M. P.
author_sort	Kostjukov, V. V.
title	Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
title_short	Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
title_full	Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
title_fullStr	Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
title_full_unstemmed	Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
title_sort	энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок днк
title_alt	Dimerization Energetics of DNA Minor Groove Binders
description	The energy analysis of a dimerization in aqueous solutions of seven biologically active lexitropsins, which are different by structure, was carried out with the use of the molecular simulation method. The main stabilization of dimers was shown to take place owing to hydrophobic and intermolecular van der Waals interactions. The latter are mainly associated with energy-favorable contacts between the aromatic rings of molecules and their peptide groups. Despite the significant dipole moments of the molecules concerned, the electrostatic interactions are relatively weak and destabilize the complexes because of the unfavorable relative arrangement of molecular dipoles. Entropic factors and the dehydration were shown to also hinder the dimerization.
publisher	Publishing house "Academperiodika"
publishDate	2018
url	https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2018471
work_keys_str_mv	AT kostjukovvv dimerizationenergeticsofdnaminorgroovebinders AT miloserdovayug dimerizationenergeticsofdnaminorgroovebinders AT shramoa dimerizationenergeticsofdnaminorgroovebinders AT rubinsonma dimerizationenergeticsofdnaminorgroovebinders AT evstigneevmp dimerizationenergeticsofdnaminorgroovebinders AT kostjukovvv énergetikadimerizaciiligandovsvâzyvaûŝihsâvmalyjželobokdnk AT miloserdovayug énergetikadimerizaciiligandovsvâzyvaûŝihsâvmalyjželobokdnk AT shramoa énergetikadimerizaciiligandovsvâzyvaûŝihsâvmalyjželobokdnk AT rubinsonma énergetikadimerizaciiligandovsvâzyvaûŝihsâvmalyjželobokdnk AT evstigneevmp énergetikadimerizaciiligandovsvâzyvaûŝihsâvmalyjželobokdnk
first_indexed	2023-03-24T08:55:53Z
last_indexed	2023-03-24T08:55:53Z
_version_	1795757624700960768

Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК

Репозитарії

Схожі ресурси