Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК
A possibility for hydrogen peroxide molecules to form stable complexes with atomic groups in the DNA backbone under the irradiation of the cell medium with high-energy ions has been studied. The energy of complexes is estimated, by taking the electrostatic and van der Waals interactions into account...
Збережено в:
| Дата: | 2019 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English Ukrainian |
| Опубліковано: |
Publishing house "Academperiodika"
2019
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2019102 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainian Journal of Physics |
Репозитарії
Ukrainian Journal of Physics| id |
ujp2-article-2019102 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| spelling |
ujp2-article-20191022019-04-16T20:20:52Z Formation of Complexes of Hydrogen Peroxide Molecules with DNA Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК Piatnytskyi, D. V. Zdorevsky, O. O. Perepelytsya, S. M. Volkov, S. N. DNA hydrogen peroxide Bragg peak ionic therapy - ДНК пероксид водню пiк Брегга iонна терапiя A possibility for hydrogen peroxide molecules to form stable complexes with atomic groups in the DNA backbone under the irradiation of the cell medium with high-energy ions has been studied. The energy of complexes is estimated, by taking the electrostatic and van der Waals interactions into account in the framework of the atom-atom potential function method. The interaction with metal counterions, which neutralize the surface charge of a macromolecule under natural conditions, is also taken into consideration. Stable configurations are determined for various complexes consisting of the atoms belonging to a DNA phosphate group, H2O2 and H2O molecules, and a Na+ metal ion. The complexes of hydrogen peroxide molecules with DNA phosphate groups and a counterion are shown to be not less stable than their complexes with water molecules. The attachment of an H2O2 molecule to a phosphate group of the double helix backbone can block the processes of DNA biological functioning and can deactivate the genetic mechanism of a cell. Дослiджено можливiсть утворення стабiльних комплексiв фосфатних груп ДНК з молекулами пероксиду водню пiд час опромiнення високоенергетичними iонами середовища бiологiчних клiтин. Енергiя комплексiв визначалася з урахуванням електростатичних i ван-дер-ваальсiвських взаємодiй за методом атом-атомних потенцiальних функцiй. Враховувалася взаємодiя з протиiонами металу, якi в природних умовах нейтралiзують заряд фосфатних груп ДНК. Визначено стабiльнi конфiгурацiї рiзних комплексiв, якi складаються з атомiв фосфатної групи остова ДНК, молекул H2O2 i H2O, та iона металу Na+. Показано, що комплекси молекул пероксиду водню з фосфатними групами ДНК i протиiоном є не менш стабiльними, нiж вiдповiднi комплекси з молекулами води. Приєднання молекули H2O2 до фосфатної групи остова подвiйної спiралi може блокувати процеси бiологiчного функцiонування ДНК i призводити до дезактивацiї генетичного апарату клiтини. Publishing house "Academperiodika" 2019-01-06 Article Article Peer-reviewed Рецензована стаття application/pdf application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2019102 10.15407/ujpe61.03.0219 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 61 No. 3 (2016); 219 Український фізичний журнал; Том 61 № 3 (2016); 219 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe61.03 en uk https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2019102/1002 https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2019102/1003 Copyright (c) 2019 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine |
| institution |
Ukrainian Journal of Physics |
| baseUrl_str |
|
| datestamp_date |
2019-04-16T20:20:52Z |
| collection |
OJS |
| language |
English Ukrainian |
| topic |
ДНК пероксид водню пiк Брегга iонна терапiя |
| spellingShingle |
ДНК пероксид водню пiк Брегга iонна терапiя Piatnytskyi, D. V. Zdorevsky, O. O. Perepelytsya, S. M. Volkov, S. N. Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| topic_facet |
DNA hydrogen peroxide Bragg peak ionic therapy - ДНК пероксид водню пiк Брегга iонна терапiя |
| format |
Article |
| author |
Piatnytskyi, D. V. Zdorevsky, O. O. Perepelytsya, S. M. Volkov, S. N. |
| author_facet |
Piatnytskyi, D. V. Zdorevsky, O. O. Perepelytsya, S. M. Volkov, S. N. |
| author_sort |
Piatnytskyi, D. V. |
| title |
Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| title_short |
Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| title_full |
Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| title_fullStr |
Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| title_full_unstemmed |
Утворення комплексiв молекул пероксиду водню з ДНК |
| title_sort |
утворення комплексiв молекул пероксиду водню з днк |
| title_alt |
Formation of Complexes of Hydrogen Peroxide Molecules with DNA |
| description |
A possibility for hydrogen peroxide molecules to form stable complexes with atomic groups in the DNA backbone under the irradiation of the cell medium with high-energy ions has been studied. The energy of complexes is estimated, by taking the electrostatic and van der Waals interactions into account in the framework of the atom-atom potential function method. The interaction with metal counterions, which neutralize the surface charge of a macromolecule under natural conditions, is also taken into consideration. Stable configurations are determined for various complexes consisting of the atoms belonging to a DNA phosphate group, H2O2 and H2O molecules, and a Na+ metal ion. The complexes of hydrogen peroxide molecules with DNA phosphate groups and a counterion are shown to be not less stable than their complexes with water molecules. The attachment of an H2O2 molecule to a phosphate group of the double helix backbone can block the processes of DNA biological functioning and can deactivate the genetic mechanism of a cell. |
| publisher |
Publishing house "Academperiodika" |
| publishDate |
2019 |
| url |
https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2019102 |
| work_keys_str_mv |
AT piatnytskyidv formationofcomplexesofhydrogenperoxidemoleculeswithdna AT zdorevskyoo formationofcomplexesofhydrogenperoxidemoleculeswithdna AT perepelytsyasm formationofcomplexesofhydrogenperoxidemoleculeswithdna AT volkovsn formationofcomplexesofhydrogenperoxidemoleculeswithdna AT piatnytskyidv utvorennâkompleksivmolekulperoksiduvodnûzdnk AT zdorevskyoo utvorennâkompleksivmolekulperoksiduvodnûzdnk AT perepelytsyasm utvorennâkompleksivmolekulperoksiduvodnûzdnk AT volkovsn utvorennâkompleksivmolekulperoksiduvodnûzdnk |
| first_indexed |
2025-10-02T01:15:50Z |
| last_indexed |
2025-10-02T01:15:50Z |
| _version_ |
1851765168403382272 |