Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази
The minimal 3-state scheme of kinetic cooperativity of monomeric enzymes is subjected to a detailed analysis. The rigorous criteria of the positive cooperativity and its sigmoidal version are established in terms of the system parameters (rate constants). It is shown that the cooperativity extent is...
Збережено в:
| Дата: | 2023 |
|---|---|
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Publishing house "Academperiodika"
2023
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2023242 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Ukrainian Journal of Physics |
Репозитарії
Ukrainian Journal of Physics| id |
ujp2-article-2023242 |
|---|---|
| record_format |
ojs |
| spelling |
ujp2-article-20232422023-11-29T15:44:25Z Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази On the Minimal Model of Kinetic Cooperativity Christophorov, L.N. мономернi ферменти кiнетична кооперативнiсть конформацiйна регуляцiя немiхаелiсовi схеми кiнетичний резонанс глюкокiназа monomeric enzymes kinetic cooperativity conformational regulation nonMichaelis schemes kinetic resonance glucokinase The minimal 3-state scheme of kinetic cooperativity of monomeric enzymes is subjected to a detailed analysis. The rigorous criteria of the positive cooperativity and its sigmoidal version are established in terms of the system parameters (rate constants). It is shown that the cooperativity extent is especially sensitive to the rates and direction of the exchange between conformational states of the free enzyme. However, no necessity of the “kinetic resonance” (or, moreover, its generality claimed recently) for enhancing the cooperativity is revealed. Overall, while the minimal 3-state model serves well for the qualitative understanding of the origin of kinetic cooperativity, it is hardly suitable for the quantitative description of reactions of real enzymes, as it is shown with the case of glucokinase. Детально розглянуто тристанову мiнiмальну схему кiнетичної кооперативностi мономерних ферментiв. Встановлено строгi критерiї позитивної кооперативностi та її сигмоїдної версiї в термiнах параметрiв системи (констант швидкостей). Показано, що ступiнь кооперативностi особливо чутливий до швидкостей та напряму обмiну мiж конформацiйними станами вiльного ферменту. Проте нiякої необхiдностi “кiнетичного резонансу” (i тим бiльше, його загальностi), заявленої нещодавно для посилення кооперативностi, виявлено не було. Загалом, хоча мiнiмальна тристанова модель добре слугує для якiсного розумiння природи кiнетичної кооперативностi, вона навряд чи придатна для кiлькiсного опису реакцiй реальних ферментiв, що показано у випадку глюкокiнази. Publishing house "Academperiodika" 2023-11-29 Article Article Original Research Article (peer-reviewed) Оригінальна дослідницька стаття (з незалежним рецензуванням) application/pdf https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2023242 10.15407/ujpe68.10.684 Ukrainian Journal of Physics; Vol. 68 No. 10 (2023); 684 Український фізичний журнал; Том 68 № 10 (2023); 684 2071-0194 2071-0186 10.15407/ujpe68.10 en https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2023242/3040 Copyright (c) 2023 Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, National Academy of Sciences of Ukraine |
| institution |
Ukrainian Journal of Physics |
| collection |
OJS |
| language |
English |
| topic |
мономернi ферменти кiнетична кооперативнiсть конформацiйна регуляцiя немiхаелiсовi схеми кiнетичний резонанс глюкокiназа monomeric enzymes kinetic cooperativity conformational regulation nonMichaelis schemes kinetic resonance glucokinase |
| spellingShingle |
мономернi ферменти кiнетична кооперативнiсть конформацiйна регуляцiя немiхаелiсовi схеми кiнетичний резонанс глюкокiназа monomeric enzymes kinetic cooperativity conformational regulation nonMichaelis schemes kinetic resonance glucokinase Christophorov, L.N. Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| topic_facet |
мономернi ферменти кiнетична кооперативнiсть конформацiйна регуляцiя немiхаелiсовi схеми кiнетичний резонанс глюкокiназа monomeric enzymes kinetic cooperativity conformational regulation nonMichaelis schemes kinetic resonance glucokinase |
| format |
Article |
| author |
Christophorov, L.N. |
| author_facet |
Christophorov, L.N. |
| author_sort |
Christophorov, L.N. |
| title |
Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| title_short |
Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| title_full |
Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| title_fullStr |
Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| title_full_unstemmed |
Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази |
| title_sort |
про мінімальну модель кінетичної кооперативності. випадок глюкокінази |
| title_alt |
On the Minimal Model of Kinetic Cooperativity |
| description |
The minimal 3-state scheme of kinetic cooperativity of monomeric enzymes is subjected to a detailed analysis. The rigorous criteria of the positive cooperativity and its sigmoidal version are established in terms of the system parameters (rate constants). It is shown that the cooperativity extent is especially sensitive to the rates and direction of the exchange between conformational states of the free enzyme. However, no necessity of the “kinetic resonance” (or, moreover, its generality claimed recently) for enhancing the cooperativity is revealed. Overall, while the minimal 3-state model serves well for the qualitative understanding of the origin of kinetic cooperativity, it is hardly suitable for the quantitative description of reactions of real enzymes, as it is shown with the case of glucokinase. |
| publisher |
Publishing house "Academperiodika" |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://ujp.bitp.kiev.ua/index.php/ujp/article/view/2023242 |
| work_keys_str_mv |
AT christophorovln promínímalʹnumodelʹkínetičnoíkooperativnostívipadokglûkokínazi AT christophorovln ontheminimalmodelofkineticcooperativity |
| first_indexed |
2024-03-31T09:28:29Z |
| last_indexed |
2024-03-31T09:28:29Z |
| _version_ |
1795757775151693824 |