Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного
Предложен метод оценки подвижности участков пептидной цепи молекул глобулярных белков, основанный на анализе рыхлости трехмерной структуры белка и величин невалентных взаимодействий между его остатками. При этом молекула рассматривается в единственной конформации, взятой из данных рентгеноструктурн...
Збережено в:
| Дата: | 2006 |
|---|---|
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2006
|
| Назва видання: | Біополімери і клітина |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156584 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного альбумина человека / И.Е. Щечкин, Т.О. Гуща // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 225-230. — Бібліогр.: 24 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-156584 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1565842019-06-19T01:29:23Z Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного Щечкин, И.Е. Гуща, Т.О. Молекулярна біофізика Предложен метод оценки подвижности участков пептидной цепи молекул глобулярных белков, основанный на анализе рыхлости трехмерной структуры белка и величин невалентных взаимодействий между его остатками. При этом молекула рассматривается в единственной конформации, взятой из данных рентгеноструктурного анализа. Применение предложенного метода к молекуле сывороточного альбумина человека показало, что наибольшую подвижность можно ожидать от участков, находящихся как на концах цепи (в диапазоне остатков 33—137 и 500—582), так и в ее середине (остатки 257—304). Полученные результаты могут быть использованы для выбора модели подвижности при изучении динамики альбуминов. Запропоновано метод оцінки рухливості ділянок пептидного ланцюга молекул глобулярних білків, який грунтується на аналізі пухкості тривимірної структури білка та величин невалентних взаємодій між його залишками. При цьому молекула розглядається в єдиній конформації, взятій із даних рентгеноструктурного аналізу. Застосування запропонованого методу до молекули сироваткового альбуміну людини показало, що найбільшу рухливість можна очікувати як для ділянок, розташованих на кінцях ланцюга (в діапазоні залишків 33— 137 і 500—582,) так і в його середині (залишки 257—304). Отримані результати можуть бути використані для вибору моделі рухливості при вивченні динаміки альбумінів. The method for evaluation of mobility of peptide chain fragments in globular proteins is proposed. The method is based on the analysis of both the protein 3D structure friability and the values of non valent interactions between protein chain residues. The analysis is performed for a single protein conformation taken from X-ray structural data. The application of the proposed method to the molecule of human serum albumin has shown that the best mobility may be expected for the terminal chain segments (in the range of 33–137 and 500–582 residues), as well as for the segments located in the middle of the chain (257–304 residues). The obtained results may be used for selection of a mobility model while studying albumins dynamics. 2006 Article Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного альбумина человека / И.Е. Щечкин, Т.О. Гуща // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 225-230. — Бібліогр.: 24 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000734 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156584 577.112.824 ru Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика |
| spellingShingle |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика Щечкин, И.Е. Гуща, Т.О. Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного Біополімери і клітина |
| description |
Предложен метод оценки подвижности участков пептидной цепи молекул глобулярных белков, основанный на анализе рыхлости трехмерной структуры белка и величин невалентных взаимодействий между его остатками. При этом молекула рассматривается в единственной конформации, взятой из данных рентгеноструктурного анализа. Применение предложенного метода к молекуле сывороточного альбумина человека показало, что наибольшую подвижность можно ожидать от участков, находящихся как на концах цепи (в диапазоне остатков 33—137 и 500—582), так и в ее середине (остатки 257—304). Полученные результаты могут быть использованы для выбора модели подвижности при изучении динамики альбуминов. |
| format |
Article |
| author |
Щечкин, И.Е. Гуща, Т.О. |
| author_facet |
Щечкин, И.Е. Гуща, Т.О. |
| author_sort |
Щечкин, И.Е. |
| title |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| title_short |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| title_full |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| title_fullStr |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| title_full_unstemmed |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| title_sort |
теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2006 |
| topic_facet |
Молекулярна біофізика |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156584 |
| citation_txt |
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного
альбумина человека / И.Е. Щечкин, Т.О. Гуща // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 225-230. — Бібліогр.: 24 назв. — рос. |
| series |
Біополімери і клітина |
| work_keys_str_mv |
AT ŝečkinie teoretičeskaâocenkapodvižnostiučastkovpeptidnojcepimolekulysyvorotočnogo AT guŝato teoretičeskaâocenkapodvižnostiučastkovpeptidnojcepimolekulysyvorotočnogo |
| first_indexed |
2023-05-20T17:50:06Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:50:06Z |
| _version_ |
1796154201459392512 |