Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation

• Дата: 2006
• Автори: Pydiura, N.A., Tereshchenko, F.A., Kornelyuk, A.I.
• Формат: Стаття
• Мова: English
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2006
• Назва видання: Біополімери і клітина
• Теми: Структура та функції біополімерів
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156882
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation / N.A. Pydiura, F.A. Tereshchenko, A.I. Kornelyuk // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 6. — С. 433-438. — Бібліогр.: 29 назв. — англ.

Here we report a study of molecular dynamics of a YCD2 fragment of mammalian tyrosyl-tRNA synthethase (Asp322-Ser528), which includes the COOH-terminal cytokine-like domain, intermodular flexible linker, and H5-α-helix of catalytic core of synthetase. Our calculations show that while compact C-termi...