Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa

З метою вивчення молекулярної організації ділянки геному, що кодує 5S рРНК у диплоїдного виду Rosa rugosa, клоновано та секвеновано декілька повторюваних одиниць 5S рДНК. Аналіз отриманих послідовностей показав наявність в геномі єдиного за довжиною повторюваної одиниці варіанта 5S рДНК, який містит...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Цитология и генетика
Datum:2014
Hauptverfasser: Тинкевич, Ю.О., Волков, Р.А.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126612
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 3-9. — Бібліогр.: 28 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-126612
record_format dspace
spelling Тинкевич, Ю.О.
Волков, Р.А.
2017-11-28T19:08:36Z
2017-11-28T19:08:36Z
2014
Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 3-9. — Бібліогр.: 28 назв. — укр.
0564-3783
DOI: 10.3103/S0095452714010095
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126612
577.212.3:595.789
З метою вивчення молекулярної організації ділянки геному, що кодує 5S рРНК у диплоїдного виду Rosa rugosa, клоновано та секвеновано декілька повторюваних одиниць 5S рДНК. Аналіз отриманих послідовностей показав наявність в геномі єдиного за довжиною повторюваної одиниці варіанта 5S рДНК, який містить інтактні промоторні елементи в міжгенному спейсері (МГС) й імовірно є транскрипційно активним. Знайдено також невелику кількість 5S рДНК-псевдогенів, у яких повністю втрачено МГС та частину кодуючої ділянки. Високий рівень подібності (від 93,7 до 97,5 %), виявлений при порівнянні послідовностей МГС мажорних варіантів 5S рДНК східноазійської R. rugosa та північноамериканської R. nitida, свідчить про відносно недавню дивергенцію цих видів.
С целью изучения молекулярной организации участка генома, кодирующего 5S рРНК у диплоидного вида Rosa rugosa, клонированы и секвенированы несколько повторяющихся единиц 5S рДНК. Анализ полученных последовательностей показал наличие в геноме единственной по длине повторяющейся единицы варианта 5S рДНК, который содержит интактные промоторные элементы в межгенном спейсере (МГС) и, вероятно, является транскрипционно активным. Обнаружено также ограниченное количест-во 5S рДНК-псевдогенов, у которых полностью ут-рачены МГС и часть кодирующего участка. Высокий уровень сходства (от 93,7 до 97,5 %), выявленный при сравнении МГС мажорных вариантов 5S рДНК восточноазиатской R. rugosa и североамериканской R. nitida, свидетельствует об относительно недавней дивергенции этих видов.
For studying the molecular organization of the genomic region coding for 5S rRNA in the diploid species Rosa rugosa, several 5S rDNA repeat units were cloned and sequenced. An analysis of the obtained sequences revealed that in the genome only one length variant of the 5S rDNA repeated unit is present that contains intact promoter elements in the intergenic spacer (IGS) and appears to be transcriptionally active. In addition, a limited number of 5S rDNA pseudogenes were detected with a complete loss of the IGS and a portion of the coding region. The high level of sequence similarity (from 93.7 to 97.5%), revealed by comparing the IGS of the major 5S rDNA variants of East Asian R. rugosa and North American R. nitida, indicates a relatively recent divergence of these species.
ru
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
Структурная организация 5S рибосомной ДНК
Structural organization of 5S ribosomal DNA in Rosa rugosa
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
spellingShingle Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
Тинкевич, Ю.О.
Волков, Р.А.
Оригинальные работы
title_short Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
title_full Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
title_fullStr Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
title_full_unstemmed Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa
title_sort структурна організація 5s рибосомної днк rosa rugosa
author Тинкевич, Ю.О.
Волков, Р.А.
author_facet Тинкевич, Ю.О.
Волков, Р.А.
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2014
language Russian
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt Структурная организация 5S рибосомной ДНК
Structural organization of 5S ribosomal DNA in Rosa rugosa
description З метою вивчення молекулярної організації ділянки геному, що кодує 5S рРНК у диплоїдного виду Rosa rugosa, клоновано та секвеновано декілька повторюваних одиниць 5S рДНК. Аналіз отриманих послідовностей показав наявність в геномі єдиного за довжиною повторюваної одиниці варіанта 5S рДНК, який містить інтактні промоторні елементи в міжгенному спейсері (МГС) й імовірно є транскрипційно активним. Знайдено також невелику кількість 5S рДНК-псевдогенів, у яких повністю втрачено МГС та частину кодуючої ділянки. Високий рівень подібності (від 93,7 до 97,5 %), виявлений при порівнянні послідовностей МГС мажорних варіантів 5S рДНК східноазійської R. rugosa та північноамериканської R. nitida, свідчить про відносно недавню дивергенцію цих видів. С целью изучения молекулярной организации участка генома, кодирующего 5S рРНК у диплоидного вида Rosa rugosa, клонированы и секвенированы несколько повторяющихся единиц 5S рДНК. Анализ полученных последовательностей показал наличие в геноме единственной по длине повторяющейся единицы варианта 5S рДНК, который содержит интактные промоторные элементы в межгенном спейсере (МГС) и, вероятно, является транскрипционно активным. Обнаружено также ограниченное количест-во 5S рДНК-псевдогенов, у которых полностью ут-рачены МГС и часть кодирующего участка. Высокий уровень сходства (от 93,7 до 97,5 %), выявленный при сравнении МГС мажорных вариантов 5S рДНК восточноазиатской R. rugosa и североамериканской R. nitida, свидетельствует об относительно недавней дивергенции этих видов. For studying the molecular organization of the genomic region coding for 5S rRNA in the diploid species Rosa rugosa, several 5S rDNA repeat units were cloned and sequenced. An analysis of the obtained sequences revealed that in the genome only one length variant of the 5S rDNA repeated unit is present that contains intact promoter elements in the intergenic spacer (IGS) and appears to be transcriptionally active. In addition, a limited number of 5S rDNA pseudogenes were detected with a complete loss of the IGS and a portion of the coding region. The high level of sequence similarity (from 93.7 to 97.5%), revealed by comparing the IGS of the major 5S rDNA variants of East Asian R. rugosa and North American R. nitida, indicates a relatively recent divergence of these species.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126612
fulltext
citation_txt Структурна організація 5S рибосомної ДНК Rosa rugosa / Ю.О. Тинкевич, Р.А. Волков // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 3-9. — Бібліогр.: 28 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT tinkevičûo strukturnaorganízacíâ5sribosomnoídnkrosarugosa
AT volkovra strukturnaorganízacíâ5sribosomnoídnkrosarugosa
AT tinkevičûo strukturnaâorganizaciâ5sribosomnoidnk
AT volkovra strukturnaâorganizaciâ5sribosomnoidnk
AT tinkevičûo structuralorganizationof5sribosomaldnainrosarugosa
AT volkovra structuralorganizationof5sribosomaldnainrosarugosa
first_indexed 2025-11-24T12:29:29Z
last_indexed 2025-11-24T12:29:29Z
_version_ 1850846731376263169