Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry
Aim. To investigate the ability of «core» 2'-5'- and 3'-5'-oligoadenylates (OA) to interact with α-interferon – a key protein of the 2'- 5'-OAS/RNAase L system responsible for antiviral cell defense. Methods. MALDI-TOF mass spectrometry was used in the studies on protei...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2013 |
| Main Authors: | , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2013
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152396 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry / S.M. Levchenko, A.V. Rebriev, V.V. Tkachuk, L.V. Dubey, I.Ya. Dubey, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 1. — С. 42-48. — Бібліогр.: 39 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152396 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Levchenko, S.M. Rebriev, A.V. Tkachuk, V.V. Dubey, L.V. Dubey, I.Ya. Tkachuk, Z.Yu. 2019-06-10T20:05:00Z 2019-06-10T20:05:00Z 2013 Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry / S.M. Levchenko, A.V. Rebriev, V.V. Tkachuk, L.V. Dubey, I.Ya. Dubey, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 1. — С. 42-48. — Бібліогр.: 39 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000804 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152396 577.113.6:577.322:543.51 Aim. To investigate the ability of «core» 2'-5'- and 3'-5'-oligoadenylates (OA) to interact with α-interferon – a key protein of the 2'- 5'-OAS/RNAase L system responsible for antiviral cell defense. Methods. MALDI-TOF mass spectrometry was used in the studies on protein-ligand interactions. Results. It was shown that 2'-5'-A3 and its epoxy-modified analog 2'-5'-A3-epo can bind to α-interferon in vitro. 3'-5'-tri- adenylate is also capable of binding to this protein. One to five ligand molecules can bind simultaneously to the molecule of α-interferon. At the same time, all studied oligonucleotides do not bind to insulin. Conclusions. It was established that «core» 2'-5'- and 3'-5'-triadenylates are capable of multiple interaction with α-interferon to form stable complexes. However, they do not bind to insulin which is not involved in the 2'-5'-OAS/RNAase L system. Мета. Дослідити здатність «корових» 2'-5'- і 3'-5'-олігоаденілатів взаємодіяти з α-інтерфероном – ключовим білком системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L, відповідальної за противірусний захист клітини. Методи. Для вивчення взаємодій білок–олігонуклеотид використано метод мас-спектрометрії MALDI-TOF. Результати. Встановлено здатність 2'-5'-А3 та його епокси-модифікованого аналога 2'-5'-А3-epo зв’язуватися з α-інтерфероном in vitro. З цим білком може також взаємодіяти і 3'-5'-триаденілат. При цьому до молекули α-інтерферону одночасно може приєднуватися від однієї до п’яти молекул ліганду. У той же час з інсуліном усі досліджені олігонуклеотиди не зв’язуються. Висновки. Показано, що «корові» 2'-5'- і 3'-5'-триаденілати множинно взаємодіють з α-інтерфероном з утворенням стійких комплексів. Однак вони не зв’язуються з інсуліном, який не є компонентом системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L. Цель. Исследовать способность «коровых» 2'-5'- и 3'-5'-олигоаденилатов взаимодействовать с α-интерфероном – ключевым белком системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L, ответственной за противовирусную защиту клетки. Методы. Для изучения взаимодействий белок–олигонуклеотид использован метод масс-спектрометрии MALDI-TOF. Результаты. Установлена способность 2'-5'-А3 и его эпокси-модифицированного аналога 2'-5'-А3-еpo связываться с α-интерфероном in vitro. С этим белком может также взаимодействовать и 3'-5'-триаденилат. При этом к молекуле α-интерферона одновременно может присоединяться от одной до пяти молекул лиганда. В то же время с инсулином все изученные олигонуклеотиды не связываются. Выводы. Показано, что «коровые» 2'-5'- и 3'-5'-триаденилаты способны к множественному взаимодействию с α-интерфероном с образованием устойчивых комплексов. Однако они не связываются с инсулином, не являющемся компонентом системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Structure and Function of Biopolymers Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry Дослідження взаємодії олігоаденілатів з білками in vitro методом мас-спектрометрії MALDI-TOF Исследование взаимодействия олигоаденилатов с белками in vitro методом масс-спектрометрии MALDI-TOF Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry |
| spellingShingle |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry Levchenko, S.M. Rebriev, A.V. Tkachuk, V.V. Dubey, L.V. Dubey, I.Ya. Tkachuk, Z.Yu. Structure and Function of Biopolymers |
| title_short |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry |
| title_full |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry |
| title_fullStr |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry |
| title_full_unstemmed |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry |
| title_sort |
studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by maldi-tof mass spectrometry |
| author |
Levchenko, S.M. Rebriev, A.V. Tkachuk, V.V. Dubey, L.V. Dubey, I.Ya. Tkachuk, Z.Yu. |
| author_facet |
Levchenko, S.M. Rebriev, A.V. Tkachuk, V.V. Dubey, L.V. Dubey, I.Ya. Tkachuk, Z.Yu. |
| topic |
Structure and Function of Biopolymers |
| topic_facet |
Structure and Function of Biopolymers |
| publishDate |
2013 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Вiopolymers and Cell |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Дослідження взаємодії олігоаденілатів з білками in vitro методом мас-спектрометрії MALDI-TOF Исследование взаимодействия олигоаденилатов с белками in vitro методом масс-спектрометрии MALDI-TOF |
| description |
Aim. To investigate the ability of «core» 2'-5'- and 3'-5'-oligoadenylates (OA) to interact with α-interferon – a key protein of the 2'- 5'-OAS/RNAase L system responsible for antiviral cell defense. Methods. MALDI-TOF mass spectrometry was used in the studies on protein-ligand interactions. Results. It was shown that 2'-5'-A3 and its epoxy-modified analog 2'-5'-A3-epo can bind to α-interferon in vitro. 3'-5'-tri- adenylate is also capable of binding to this protein. One to five ligand molecules can bind simultaneously to the molecule of α-interferon. At the same time, all studied oligonucleotides do not bind to insulin. Conclusions. It was established that «core» 2'-5'- and 3'-5'-triadenylates are capable of multiple interaction with α-interferon to form stable complexes. However, they do not bind to insulin which is not involved in the 2'-5'-OAS/RNAase L system.
Мета. Дослідити здатність «корових» 2'-5'- і 3'-5'-олігоаденілатів взаємодіяти з α-інтерфероном – ключовим білком системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L, відповідальної за противірусний захист клітини. Методи. Для вивчення взаємодій білок–олігонуклеотид використано метод мас-спектрометрії MALDI-TOF. Результати. Встановлено здатність 2'-5'-А3 та його епокси-модифікованого аналога 2'-5'-А3-epo зв’язуватися з α-інтерфероном in vitro. З цим білком може також взаємодіяти і 3'-5'-триаденілат. При цьому до молекули α-інтерферону одночасно може приєднуватися від однієї до п’яти молекул ліганду. У той же час з інсуліном усі досліджені олігонуклеотиди не зв’язуються. Висновки. Показано, що «корові» 2'-5'- і 3'-5'-триаденілати множинно взаємодіють з α-інтерфероном з утворенням стійких комплексів. Однак вони не зв’язуються з інсуліном, який не є компонентом системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L.
Цель. Исследовать способность «коровых» 2'-5'- и 3'-5'-олигоаденилатов взаимодействовать с α-интерфероном – ключевым белком системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L, ответственной за противовирусную защиту клетки. Методы. Для изучения взаимодействий белок–олигонуклеотид использован метод масс-спектрометрии MALDI-TOF. Результаты. Установлена способность 2'-5'-А3 и его эпокси-модифицированного аналога 2'-5'-А3-еpo связываться с α-интерфероном in vitro. С этим белком может также взаимодействовать и 3'-5'-триаденилат. При этом к молекуле α-интерферона одновременно может присоединяться от одной до пяти молекул лиганда. В то же время с инсулином все изученные олигонуклеотиды не связываются. Выводы. Показано, что «коровые» 2'-5'- и 3'-5'-триаденилаты способны к множественному взаимодействию с α-интерфероном с образованием устойчивых комплексов. Однако они не связываются с инсулином, не являющемся компонентом системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152396 |
| citation_txt |
Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry / S.M. Levchenko, A.V. Rebriev, V.V. Tkachuk, L.V. Dubey, I.Ya. Dubey, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 1. — С. 42-48. — Бібліогр.: 39 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT levchenkosm studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT rebrievav studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT tkachukvv studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT dubeylv studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT dubeyiya studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT tkachukzyu studiesoninteractionofoligoadenylateswithproteinsinvitrobymalditofmassspectrometry AT levchenkosm doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT rebrievav doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT tkachukvv doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT dubeylv doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT dubeyiya doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT tkachukzyu doslídžennâvzaêmodííolígoadenílatívzbílkamiinvitrometodommasspektrometríímalditof AT levchenkosm issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof AT rebrievav issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof AT tkachukvv issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof AT dubeylv issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof AT dubeyiya issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof AT tkachukzyu issledovanievzaimodeistviâoligoadenilatovsbelkamiinvitrometodommassspektrometriimalditof |
| first_indexed |
2025-12-07T19:57:24Z |
| last_indexed |
2025-12-07T19:57:24Z |
| _version_ |
1850880761125666816 |