Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system

Aim. To generate HEK-293 cells with disrupted expression of S6K1 isoforms: p85, p70 and p60. Methods. CRISPR/Cas9 gene editing, Western blotting, immunofluorescent analysis, RT-PCR analysis, MTT assay, scratch assay. Results. Several clones of HEK-293 cells with a complete loss of p85/p70/p60-S6K1 p...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Вiopolymers and Cell
Дата:2017
Автори: Zaiets, I.V., Sivchenko, A.S., Khoruzhenko, A.I., Filonenko, V.V.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2017
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152987
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system / I.V. Zaiets, A.S. Sivchenko, A.I. Khoruzhenko, V.V. Filonenko // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 5. — С. 356-366. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152987
record_format dspace
spelling Zaiets, I.V.
Sivchenko, A.S.
Khoruzhenko, A.I.
Filonenko, V.V.
2019-06-13T12:04:15Z
2019-06-13T12:04:15Z
2017
Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system / I.V. Zaiets, A.S. Sivchenko, A.I. Khoruzhenko, V.V. Filonenko // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 5. — С. 356-366. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00095F
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152987
576.322 577.22
Aim. To generate HEK-293 cells with disrupted expression of S6K1 isoforms: p85, p70 and p60. Methods. CRISPR/Cas9 gene editing, Western blotting, immunofluorescent analysis, RT-PCR analysis, MTT assay, scratch assay. Results. Several clones of HEK-293 cells with a complete loss of p85/p70/p60-S6K1 protein expression were generated. The effects of p85/p70/p60-S6K1 knockout on Akt/mTORC1/S6K1 signaling and cell proliferation and migration were assessed. Conclusions. The generated cell lines can be used to study a role played by S6K1 in cell physiology and to gain more detailed insight into cellular functions of the S6K1 isoforms. The HEK-293 cells exhibit down-regulation of Akt phosphorylation on Ser473 and subsequent attenuation of cell growth rate, as well as inhibition of cell motility.
Мета. Створити клітини HEK293 з порушеною експресією S6K1 ізоформ: p85, p70 і Р60. Методи. CRISPR/cas9 система редагування генома, Вестерн-блот, імунофлуоресцентний аналіз, ПЛР-аналіз, MTT тест, метод «раневої поверхні». Результати. Отримано декілька клонів клітин НЕК-293 з повною втратою експресії білка p85/p70/p60-S6K1. Було оцінено ефект нокауту p85/p70/p60-S6K1 на Akt/mTORC1/S6K1 сигналінг та клітинні проліферацію і міграцію. Висновки. Створені клітинні лінії можуть бути використані для вивчення ролі, яку відіграє S6K1 в фізіології клітини, що дозволяє отримати більш детальне уявлення про клітинні функції ізоформ S6K1. Клітини / / HEK-293 виявляють знижений рівень фосфорилювання Akt по Сер473 і подальше пригнічення швидкості клітинного росту разом з інгібуванням клітинної рухливості.
Цель. Создать клетки HEK293 с нарушенной экспрессией S6K1 изоформ: p85, p70 и Р60. Методы. CRISPR/cas9 система редактирования генома, Вестерн-блот, иммунофлуоресцентный анализ, ПЦР-анализ, MTT тест, метод «раневой поверхности». Результаты. Получено несколько клонов клеток НЕК-293 с полной потерей экспрессии белка p85/p70/p60-S6K1. Была проведена оценка влияния нокаута p85/p70/p60-S6K1 на Akt/mTORC1/S6K1 сигналинг и клеточные пролиферацию и миграцию. Выводы. Созданные клеточные линии могут быть использованы для изучения роли, которую играет S6K1 в физиологии клетки и позволить получить более детальное представление о клеточных функциях изоформ S6K1. Клетки / / HEK-293 показывают пониженный уровень фосфорилирования Akt по Сер473 и дальнейшее угнетение скорости клеточного роста вместе с ингибированием клеточной подвижности.
This work was supported in part by a fellowship from Boehringer Ingelheim Fonds (BIF) awarded to Igor Zaiets.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Molecular and Cell Biotechnologies
Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
Створення стабільних ліній клітин HEK-293 з порушеною експресією ізоформ кінази рибосомного білка S6 (S6K1) за допомогою системи редагування генома CRISPR/Cas9
Создание стабильных линий клеток HEK-293 с нарушенной экспрессией изоформ киназы рибосомного белка S6 (S6K1) при помощи системы редактирования генома CRISPR/Cas9
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
spellingShingle Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
Zaiets, I.V.
Sivchenko, A.S.
Khoruzhenko, A.I.
Filonenko, V.V.
Molecular and Cell Biotechnologies
title_short Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
title_full Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
title_fullStr Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
title_full_unstemmed Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system
title_sort generation of hek-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein s6 kinase (s6k1) isoforms using the crispr/cas9 genome editing system
author Zaiets, I.V.
Sivchenko, A.S.
Khoruzhenko, A.I.
Filonenko, V.V.
author_facet Zaiets, I.V.
Sivchenko, A.S.
Khoruzhenko, A.I.
Filonenko, V.V.
topic Molecular and Cell Biotechnologies
topic_facet Molecular and Cell Biotechnologies
publishDate 2017
language English
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Створення стабільних ліній клітин HEK-293 з порушеною експресією ізоформ кінази рибосомного білка S6 (S6K1) за допомогою системи редагування генома CRISPR/Cas9
Создание стабильных линий клеток HEK-293 с нарушенной экспрессией изоформ киназы рибосомного белка S6 (S6K1) при помощи системы редактирования генома CRISPR/Cas9
description Aim. To generate HEK-293 cells with disrupted expression of S6K1 isoforms: p85, p70 and p60. Methods. CRISPR/Cas9 gene editing, Western blotting, immunofluorescent analysis, RT-PCR analysis, MTT assay, scratch assay. Results. Several clones of HEK-293 cells with a complete loss of p85/p70/p60-S6K1 protein expression were generated. The effects of p85/p70/p60-S6K1 knockout on Akt/mTORC1/S6K1 signaling and cell proliferation and migration were assessed. Conclusions. The generated cell lines can be used to study a role played by S6K1 in cell physiology and to gain more detailed insight into cellular functions of the S6K1 isoforms. The HEK-293 cells exhibit down-regulation of Akt phosphorylation on Ser473 and subsequent attenuation of cell growth rate, as well as inhibition of cell motility. Мета. Створити клітини HEK293 з порушеною експресією S6K1 ізоформ: p85, p70 і Р60. Методи. CRISPR/cas9 система редагування генома, Вестерн-блот, імунофлуоресцентний аналіз, ПЛР-аналіз, MTT тест, метод «раневої поверхні». Результати. Отримано декілька клонів клітин НЕК-293 з повною втратою експресії білка p85/p70/p60-S6K1. Було оцінено ефект нокауту p85/p70/p60-S6K1 на Akt/mTORC1/S6K1 сигналінг та клітинні проліферацію і міграцію. Висновки. Створені клітинні лінії можуть бути використані для вивчення ролі, яку відіграє S6K1 в фізіології клітини, що дозволяє отримати більш детальне уявлення про клітинні функції ізоформ S6K1. Клітини / / HEK-293 виявляють знижений рівень фосфорилювання Akt по Сер473 і подальше пригнічення швидкості клітинного росту разом з інгібуванням клітинної рухливості. Цель. Создать клетки HEK293 с нарушенной экспрессией S6K1 изоформ: p85, p70 и Р60. Методы. CRISPR/cas9 система редактирования генома, Вестерн-блот, иммунофлуоресцентный анализ, ПЦР-анализ, MTT тест, метод «раневой поверхности». Результаты. Получено несколько клонов клеток НЕК-293 с полной потерей экспрессии белка p85/p70/p60-S6K1. Была проведена оценка влияния нокаута p85/p70/p60-S6K1 на Akt/mTORC1/S6K1 сигналинг и клеточные пролиферацию и миграцию. Выводы. Созданные клеточные линии могут быть использованы для изучения роли, которую играет S6K1 в физиологии клетки и позволить получить более детальное представление о клеточных функциях изоформ S6K1. Клетки / / HEK-293 показывают пониженный уровень фосфорилирования Akt по Сер473 и дальнейшее угнетение скорости клеточного роста вместе с ингибированием клеточной подвижности.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152987
citation_txt Generation of HEK-293 stable cell lines with disrupted expression of ribosomal protein S6 kinase (S6K1) isoforms using the CRISPR/Cas9 genome editing system / I.V. Zaiets, A.S. Sivchenko, A.I. Khoruzhenko, V.V. Filonenko // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 5. — С. 356-366. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT zaietsiv generationofhek293stablecelllineswithdisruptedexpressionofribosomalproteins6kinases6k1isoformsusingthecrisprcas9genomeeditingsystem
AT sivchenkoas generationofhek293stablecelllineswithdisruptedexpressionofribosomalproteins6kinases6k1isoformsusingthecrisprcas9genomeeditingsystem
AT khoruzhenkoai generationofhek293stablecelllineswithdisruptedexpressionofribosomalproteins6kinases6k1isoformsusingthecrisprcas9genomeeditingsystem
AT filonenkovv generationofhek293stablecelllineswithdisruptedexpressionofribosomalproteins6kinases6k1isoformsusingthecrisprcas9genomeeditingsystem
AT zaietsiv stvorennâstabílʹnihlíníiklítinhek293zporušenoûekspresíêûízoformkínaziribosomnogobílkas6s6k1zadopomogoûsistemiredaguvannâgenomacrisprcas9
AT sivchenkoas stvorennâstabílʹnihlíníiklítinhek293zporušenoûekspresíêûízoformkínaziribosomnogobílkas6s6k1zadopomogoûsistemiredaguvannâgenomacrisprcas9
AT khoruzhenkoai stvorennâstabílʹnihlíníiklítinhek293zporušenoûekspresíêûízoformkínaziribosomnogobílkas6s6k1zadopomogoûsistemiredaguvannâgenomacrisprcas9
AT filonenkovv stvorennâstabílʹnihlíníiklítinhek293zporušenoûekspresíêûízoformkínaziribosomnogobílkas6s6k1zadopomogoûsistemiredaguvannâgenomacrisprcas9
AT zaietsiv sozdaniestabilʹnyhliniikletokhek293snarušennoiékspressieiizoformkinazyribosomnogobelkas6s6k1pripomoŝisistemyredaktirovaniâgenomacrisprcas9
AT sivchenkoas sozdaniestabilʹnyhliniikletokhek293snarušennoiékspressieiizoformkinazyribosomnogobelkas6s6k1pripomoŝisistemyredaktirovaniâgenomacrisprcas9
AT khoruzhenkoai sozdaniestabilʹnyhliniikletokhek293snarušennoiékspressieiizoformkinazyribosomnogobelkas6s6k1pripomoŝisistemyredaktirovaniâgenomacrisprcas9
AT filonenkovv sozdaniestabilʹnyhliniikletokhek293snarušennoiékspressieiizoformkinazyribosomnogobelkas6s6k1pripomoŝisistemyredaktirovaniâgenomacrisprcas9
first_indexed 2025-11-30T13:42:10Z
last_indexed 2025-11-30T13:42:10Z
_version_ 1850857739463426048