Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2013 |
| Main Authors: | , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2013
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153676 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862732211675987968 |
|---|---|
| author | Didan, Yu.V. Kryvorotenko, D.V. Negrutska, V.V. Dubey, I.Ya. |
| author_facet | Didan, Yu.V. Kryvorotenko, D.V. Negrutska, V.V. Dubey, I.Ya. |
| citation_txt | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in LO-7-stained agarose gel using a laser scanner, and 0.3 ng with UV-transilluminator. This sensitivity is several times higher than can be achieved with ethidium bromide, and close to that of SYBR Green I. Conclusions. LO-7 belongs to the most efficient stains for dsDNA visualization and thus can be used in bioanalytical applications where high sensitivity is required.
Мета. Дослідження нового ціанінового барвника LO-7 як реагента при візуалізації дволанцюгової ДНК в електрофоретичних гелях. Методи. Гель-електрофорез, рестрикція, флуоресцентна детекція, mobility shift (зміна електрофоретичної рухливості). Результати. LO-7 зв’язується з ДНК, утворюючи стійкі високофлуоресцентні комплекси. У пофарбованих ним агарозних гелях можна визначати ~ 80 пг ДНК за допомогою лазерного сканера і 0,3 нг – за використання УФ-трансілюмінатора. Подібна чутливість у кілька разів вища, ніж у бромистого етидію, і близька до такої для SYBR Green I. Висновки. LO-7 належить до найефективіших барвників для візуалізації дволанцюгової ДНК і може застосовуватись при вирішенні біоаналітичних завдань, де необхідна висока чутливість.
Цель. Изучение нового цианинового красителя LO-7 как реагента при визуализации двухцепочечной ДНК в электрофоретических гелях. Методы. Гель-электрофорез, рестрикция, флуоресцентная детекция, mobility shift (изменение электро- форетической подвижности). Результаты. LO-7 связывается с ДНК, образуя устойчивые высокофлуоресцентные комплексы. В окрашенных им агарозных гелях можно определить ~ 80 пг ДНК при помощи лазерного сканера и 0,3 нг – при использовании УФ-трансиллюминатора. Подобная чувствительность в несколько раз выше, чем у бромистого этидия, и близка к таковой для SYBR Green I. Выводы. LO-7 принадлежит к наиболее эффективным красителям для визуализации двухцепочечной ДНК и может применяться для решения биоаналитических задач, где необходима высокая чувствительность.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:30:32Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153676 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-07T19:30:32Z |
| publishDate | 2013 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Didan, Yu.V. Kryvorotenko, D.V. Negrutska, V.V. Dubey, I.Ya. 2019-06-14T12:54:56Z 2019-06-14T12:54:56Z 2013 Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000842 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153676 577.113 + 577.336 + 543.545.2 Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in LO-7-stained agarose gel using a laser scanner, and 0.3 ng with UV-transilluminator. This sensitivity is several times higher than can be achieved with ethidium bromide, and close to that of SYBR Green I. Conclusions. LO-7 belongs to the most efficient stains for dsDNA visualization and thus can be used in bioanalytical applications where high sensitivity is required. Мета. Дослідження нового ціанінового барвника LO-7 як реагента при візуалізації дволанцюгової ДНК в електрофоретичних гелях. Методи. Гель-електрофорез, рестрикція, флуоресцентна детекція, mobility shift (зміна електрофоретичної рухливості). Результати. LO-7 зв’язується з ДНК, утворюючи стійкі високофлуоресцентні комплекси. У пофарбованих ним агарозних гелях можна визначати ~ 80 пг ДНК за допомогою лазерного сканера і 0,3 нг – за використання УФ-трансілюмінатора. Подібна чутливість у кілька разів вища, ніж у бромистого етидію, і близька до такої для SYBR Green I. Висновки. LO-7 належить до найефективіших барвників для візуалізації дволанцюгової ДНК і може застосовуватись при вирішенні біоаналітичних завдань, де необхідна висока чутливість. Цель. Изучение нового цианинового красителя LO-7 как реагента при визуализации двухцепочечной ДНК в электрофоретических гелях. Методы. Гель-электрофорез, рестрикция, флуоресцентная детекция, mobility shift (изменение электро- форетической подвижности). Результаты. LO-7 связывается с ДНК, образуя устойчивые высокофлуоресцентные комплексы. В окрашенных им агарозных гелях можно определить ~ 80 пг ДНК при помощи лазерного сканера и 0,3 нг – при использовании УФ-трансиллюминатора. Подобная чувствительность в несколько раз выше, чем у бромистого этидия, и близка к таковой для SYBR Green I. Выводы. LO-7 принадлежит к наиболее эффективным красителям для визуализации двухцепочечной ДНК и может применяться для решения биоаналитических задач, где необходима высокая чувствительность. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Bioorganic Chemistry Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA Похідна Лепідинового Оранжевого як новий барвник для чутливої флуоресцентної детекції ДНК Производное Лепидинового Оранжевого как новый краситель для чувствительной флуоресцентной детекции ДНК Article published earlier |
| spellingShingle | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA Didan, Yu.V. Kryvorotenko, D.V. Negrutska, V.V. Dubey, I.Ya. Bioorganic Chemistry |
| title | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA |
| title_alt | Похідна Лепідинового Оранжевого як новий барвник для чутливої флуоресцентної детекції ДНК Производное Лепидинового Оранжевого как новый краситель для чувствительной флуоресцентной детекции ДНК |
| title_full | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA |
| title_fullStr | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA |
| title_full_unstemmed | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA |
| title_short | Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA |
| title_sort | lepidine orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of dna |
| topic | Bioorganic Chemistry |
| topic_facet | Bioorganic Chemistry |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153676 |
| work_keys_str_mv | AT didanyuv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna AT kryvorotenkodv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna AT negrutskavv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna AT dubeyiya lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna AT didanyuv pohídnalepídinovogooranževogoâknoviibarvnikdlâčutlivoífluorescentnoídetekcíídnk AT kryvorotenkodv pohídnalepídinovogooranževogoâknoviibarvnikdlâčutlivoífluorescentnoídetekcíídnk AT negrutskavv pohídnalepídinovogooranževogoâknoviibarvnikdlâčutlivoífluorescentnoídetekcíídnk AT dubeyiya pohídnalepídinovogooranževogoâknoviibarvnikdlâčutlivoífluorescentnoídetekcíídnk AT didanyuv proizvodnoelepidinovogooranževogokaknovyikrasitelʹdlâčuvstvitelʹnoifluorescentnoidetekciidnk AT kryvorotenkodv proizvodnoelepidinovogooranževogokaknovyikrasitelʹdlâčuvstvitelʹnoifluorescentnoidetekciidnk AT negrutskavv proizvodnoelepidinovogooranževogokaknovyikrasitelʹdlâčuvstvitelʹnoifluorescentnoidetekciidnk AT dubeyiya proizvodnoelepidinovogooranževogokaknovyikrasitelʹdlâčuvstvitelʹnoifluorescentnoidetekciidnk |