DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine
Aim. to determine DNA interaction modes for a series of 1,4-dihydropyridines with different biological activities synthesized in the Latvian Institute of Or-ganic Synthesis. Methods. Affinity of the compounds to DNA was detected by UV/VIS spec-trometry and re-proofed by means of spectrofluorimetry,...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2018 |
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154284 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine / E. Leonova, E. Rostoka, L. Baumane, V. Borisovs, E. Smelovs, I. Bisenieks, I. Brūvere, E. Bisenieks, G. Duburs, N. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 2. — С. 127-141. — Бібліогр.: 22 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154284 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Leonova, E. Rostoka, E. Baumane, L. Borisovs, V. Smelovs, E. Bisenieks, I. Brūvere, I. Bisenieks, E. Duburs, G. Sjakste, N. 2019-06-15T12:20:48Z 2019-06-15T12:20:48Z 2018 DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine / E. Leonova, E. Rostoka, L. Baumane, V. Borisovs, E. Smelovs, I. Bisenieks, I. Brūvere, E. Bisenieks, G. Duburs, N. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 2. — С. 127-141. — Бібліогр.: 22 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000977 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154284 547.82 + 577.1 Aim. to determine DNA interaction modes for a series of 1,4-dihydropyridines with different biological activities synthesized in the Latvian Institute of Or-ganic Synthesis. Methods. Affinity of the compounds to DNA was detected by UV/VIS spec-trometry and re-proofed by means of spectrofluorimetry, EBr extrusion assay, cyclic voltammetry and DNA melting. Radical scavenging was tested by electron paramagnetic resonance spectros-copy, peroxynitrite binding was monitored spectrophotometrically, protection of DNA against hydroxyl radical was determined by gel electrophoresis. Results. In a series of water-soluble monocyclic derivatives of 1,4-dihydropyridine with carboxylate groups in position-4 the different affinity to DNA was determined mainly by substituents in positions 3 and 5. 1,4-DHP with eth-oxycarbonyl groups in positions 3 and 5 (AV-153) manifested high affinity to DNA. Strong ef-fects were observed in the spectra of tricyclic fused derivatives (PP-150-Na and PP-544-NH4). Unlike AV-153, J-4-96 did not extrude EtBr from the complex with DNA, this indicates binding to minor groove. Ability of PP-544-NH4 to intercalate DNA molecule was proved electrochemi-cally and by DNA melting. No correlation between affinity of a 1,4‑DHP to DNA and capabili-ties of the compound to bind peroxynitrite, to scavenge hydroxyl radical or to protect DNA against the above radical were observed. Discussion. DNA-binding activities of 1,4-DHP are evi-dently determined by groups in positions 3 and 5. Tricyclic fused 1,4-DHP derivatives are also good DNA binders. Ability to interact with DNA does not correlate with other effects produced by the compounds. Мета. Дослідження способу взаємодії з ДНК серії синтезованих в Латвійському університеті органічного синтезу 1,4-ДГП з різною біологічною активністю. Meтоди. Спорідненість речовин до ДНК визначалося спектрофотометрично і було перевірені ще спектрофлуоріметрічно за виштовхуванням бромистого етидія, циклічної вольтамметріі і за плавленням ДНК. Здатність речовин зв'язувати пероксинітрит визначали спектрофотометрично, здатність пов'язувати гідроксильних радикалів - методом електронного парамагнітного резонансу, здатність захищати ДНК від ушкодження цим радикалом - методом електрофорезу. Результати. У серії водорозчинних моноциклических 1,4-ДГП з карбоксилатного групою у позиції 4, різна спорідненість до ДНК визначалося в основному замысниками у позиціях 3 і 5. 1,4-ДГП з етоксікарбонільним групами у позиціях 3 і 5 (AV-153) ефективно зв'язувався з ДНК. Сильні ефекти спостерігали в спектрах з'єднаних трициклічних похідних 1,4-ДГП (PP-150-Na і PP-544-NH4). На відміну від AV-153, J-4-96 витісняють бромистий етидій з комплексу з ДНК, що вказує на зв'язування цього з'єднання з малої борозенкою ДНК. За даними електрохімічних досліджень і кривих плавлення ДНК PP-544-NH4 повинен інтеркалювати в ДНК. Нам не вдалося зв'язати спорідненість до ДНК зі здатністю речовин зв'язувати пероксинітрит, гідроксильний радикал або захищати ДНК від ушкодження цим радикалом. Висновки. Спорідненість 1,4-ДГП до ДНК визначаються замісниками у позиції 3 і 5. Добре зв'язуються з ДНК також трициклічні 1,4-ДГП. Спорідненість 1,4-ДГП до ДНК не корелює з іншими активностями з'єднання Цель. Исследование образа взаимодействия с ДНК серии синтезированных в Латвийском институте органического синтеза 1,4-ДГП с различной биологической активностью. Meтоды. Сродство веществ к ДНК опредедялось спектрофотометрически и было перепроверено спектрофлуори-метрически, по выталкиванию бромистого этидия, циклической вольтамметрии и по плавлению ДНК. Способ-ность веществ связывать пероксинитрит определяли спектрофотометрически, способность связывать гидроксиль-ный радикалил – методом электронного парамагнитного резонанса, способность защищать ДНК от повреждения этим радикалом – методом электрофореза. Результаты. В серии водорастворимых моноциклических 1,4‑ДГП с карбоксилатной группой в позиции 4, различное сродство к ДНК определялось в основном заместителями в пози-циях 3 и 5. 1,4-ДГП с этоксикарбонильным группами в позициях 3 и 5 (AV-153) эффективно связывался с ДНК. Сильные эффекты наблюдали в спектрах соединенных трициклических производных 1,4-ДГП (PP-150-Na и PP-544-NH4). В отличие от AV-153, J-4-96 не вытеснял бромистый этидий из комплекса с ДНК, что указывает на свя-зывание этого соединения с малой бороздкой ДНК. По данным электрохимических исследований и кривых плав-ления ДНК PP-544-NH4 должен интеркалировать в ДНК. Нам не удалось связать сродство к ДНК со способностью веществ связывать пероксинитрит. гидроксильный радикал или защищать ДНК от повреждения этим радикалом. Обсуждение. Сродство 1,4-ДГП к ДНК определяются заместителями в позицих 3 и 5. Хорошо связываются с ДНК также трициклические 1,4-ДГП. Сродство 1,4-ДГП к ДНК не коррелирует с другими активностями соединения. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Bioorganic Chemistry DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine Дослідження взаємодії з ДНК серії нових водорозчинних похідних 1,4-дигідропіридину Исследование взаимодействия с ДНК серии новых водорастворимых производных 1,4-дигидропиридина Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| spellingShingle |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine Leonova, E. Rostoka, E. Baumane, L. Borisovs, V. Smelovs, E. Bisenieks, I. Brūvere, I. Bisenieks, E. Duburs, G. Sjakste, N. Bioorganic Chemistry |
| title_short |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| title_full |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| title_fullStr |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| title_full_unstemmed |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| title_sort |
dna-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine |
| author |
Leonova, E. Rostoka, E. Baumane, L. Borisovs, V. Smelovs, E. Bisenieks, I. Brūvere, I. Bisenieks, E. Duburs, G. Sjakste, N. |
| author_facet |
Leonova, E. Rostoka, E. Baumane, L. Borisovs, V. Smelovs, E. Bisenieks, I. Brūvere, I. Bisenieks, E. Duburs, G. Sjakste, N. |
| topic |
Bioorganic Chemistry |
| topic_facet |
Bioorganic Chemistry |
| publishDate |
2018 |
| language |
English |
| container_title |
Вiopolymers and Cell |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Дослідження взаємодії з ДНК серії нових водорозчинних похідних 1,4-дигідропіридину Исследование взаимодействия с ДНК серии новых водорастворимых производных 1,4-дигидропиридина |
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154284 |
| citation_txt |
DNA-binding studies of a series of novel water-soluble derivatives of 1,4-dihydropyridine / E. Leonova, E. Rostoka, L. Baumane, V. Borisovs, E. Smelovs, I. Bisenieks, I. Brūvere, E. Bisenieks, G. Duburs, N. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 2. — С. 127-141. — Бібліогр.: 22 назв. — англ. |
| work_keys_str_mv |
AT leonovae dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT rostokae dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT baumanel dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT borisovsv dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT smelovse dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT bisenieksi dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT bruverei dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT biseniekse dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT dubursg dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT sjaksten dnabindingstudiesofaseriesofnovelwatersolublederivativesof14dihydropyridine AT leonovae doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT rostokae doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT baumanel doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT borisovsv doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT smelovse doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT bisenieksi doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT bruverei doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT biseniekse doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT dubursg doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT sjaksten doslídžennâvzaêmodíízdnkseríínovihvodorozčinnihpohídnih14digídropíridinu AT leonovae issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT rostokae issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT baumanel issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT borisovsv issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT smelovse issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT bisenieksi issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT bruverei issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT biseniekse issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT dubursg issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina AT sjaksten issledovanievzaimodeistviâsdnkseriinovyhvodorastvorimyhproizvodnyh14digidropiridina |
| first_indexed |
2025-11-27T09:33:54Z |
| last_indexed |
2025-11-27T09:33:54Z |
| _version_ |
1850852102561071104 |
| description |
Aim. to determine DNA interaction modes for a series of 1,4-dihydropyridines with different biological activities synthesized in the Latvian Institute of Or-ganic Synthesis. Methods. Affinity of the compounds to DNA was detected by UV/VIS spec-trometry and re-proofed by means of spectrofluorimetry, EBr extrusion assay, cyclic voltammetry and DNA melting. Radical scavenging was tested by electron paramagnetic resonance spectros-copy, peroxynitrite binding was monitored spectrophotometrically, protection of DNA against hydroxyl radical was determined by gel electrophoresis. Results. In a series of water-soluble monocyclic derivatives of 1,4-dihydropyridine with carboxylate groups in position-4 the different affinity to DNA was determined mainly by substituents in positions 3 and 5. 1,4-DHP with eth-oxycarbonyl groups in positions 3 and 5 (AV-153) manifested high affinity to DNA. Strong ef-fects were observed in the spectra of tricyclic fused derivatives (PP-150-Na and PP-544-NH4). Unlike AV-153, J-4-96 did not extrude EtBr from the complex with DNA, this indicates binding to minor groove. Ability of PP-544-NH4 to intercalate DNA molecule was proved electrochemi-cally and by DNA melting. No correlation between affinity of a 1,4‑DHP to DNA and capabili-ties of the compound to bind peroxynitrite, to scavenge hydroxyl radical or to protect DNA against the above radical were observed. Discussion. DNA-binding activities of 1,4-DHP are evi-dently determined by groups in positions 3 and 5. Tricyclic fused 1,4-DHP derivatives are also good DNA binders. Ability to interact with DNA does not correlate with other effects produced by the compounds.
Мета. Дослідження способу взаємодії з ДНК серії синтезованих в Латвійському університеті органічного синтезу 1,4-ДГП з різною біологічною активністю. Meтоди. Спорідненість речовин до ДНК визначалося спектрофотометрично і було перевірені ще спектрофлуоріметрічно за виштовхуванням бромистого етидія, циклічної вольтамметріі і за плавленням ДНК. Здатність речовин зв'язувати пероксинітрит визначали спектрофотометрично, здатність пов'язувати гідроксильних радикалів - методом електронного парамагнітного резонансу, здатність захищати ДНК від ушкодження цим радикалом - методом електрофорезу. Результати. У серії водорозчинних моноциклических 1,4-ДГП з карбоксилатного групою у позиції 4, різна спорідненість до ДНК визначалося в основному замысниками у позиціях 3 і 5. 1,4-ДГП з етоксікарбонільним групами у позиціях 3 і 5 (AV-153) ефективно зв'язувався з ДНК. Сильні ефекти спостерігали в спектрах з'єднаних трициклічних похідних 1,4-ДГП (PP-150-Na і PP-544-NH4). На відміну від AV-153, J-4-96 витісняють бромистий етидій з комплексу з ДНК, що вказує на зв'язування цього з'єднання з малої борозенкою ДНК. За даними електрохімічних досліджень і кривих плавлення ДНК PP-544-NH4 повинен інтеркалювати в ДНК. Нам не вдалося зв'язати спорідненість до ДНК зі здатністю речовин зв'язувати пероксинітрит, гідроксильний радикал або захищати ДНК від ушкодження цим радикалом. Висновки. Спорідненість 1,4-ДГП до ДНК визначаються замісниками у позиції 3 і 5. Добре зв'язуються з ДНК також трициклічні 1,4-ДГП. Спорідненість 1,4-ДГП до ДНК не корелює з іншими активностями з'єднання
Цель. Исследование образа взаимодействия с ДНК серии синтезированных в Латвийском институте органического синтеза 1,4-ДГП с различной биологической активностью. Meтоды. Сродство веществ к ДНК опредедялось спектрофотометрически и было перепроверено спектрофлуори-метрически, по выталкиванию бромистого этидия, циклической вольтамметрии и по плавлению ДНК. Способ-ность веществ связывать пероксинитрит определяли спектрофотометрически, способность связывать гидроксиль-ный радикалил – методом электронного парамагнитного резонанса, способность защищать ДНК от повреждения этим радикалом – методом электрофореза. Результаты. В серии водорастворимых моноциклических 1,4‑ДГП с карбоксилатной группой в позиции 4, различное сродство к ДНК определялось в основном заместителями в пози-циях 3 и 5. 1,4-ДГП с этоксикарбонильным группами в позициях 3 и 5 (AV-153) эффективно связывался с ДНК. Сильные эффекты наблюдали в спектрах соединенных трициклических производных 1,4-ДГП (PP-150-Na и PP-544-NH4). В отличие от AV-153, J-4-96 не вытеснял бромистый этидий из комплекса с ДНК, что указывает на свя-зывание этого соединения с малой бороздкой ДНК. По данным электрохимических исследований и кривых плав-ления ДНК PP-544-NH4 должен интеркалировать в ДНК. Нам не удалось связать сродство к ДНК со способностью веществ связывать пероксинитрит. гидроксильный радикал или защищать ДНК от повреждения этим радикалом. Обсуждение. Сродство 1,4-ДГП к ДНК определяются заместителями в позицих 3 и 5. Хорошо связываются с ДНК также трициклические 1,4-ДГП. Сродство 1,4-ДГП к ДНК не коррелирует с другими активностями соединения.
|