Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии

• Date: 1998
• Main Authors: Итон, Р.Д., Веселков, Д.А., Дымант, Л.Н., Барановский, С.Ф., Осетров, С.Г., Дэвис, Д.Б., Веселков, А.Н.
• Format: Article
• Language: Russian
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1998
• Series: Биополимеры и клетка
• Subjects: Структура и функции биополимеров
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154986
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии / Р.Д. Итон, Д.А. Веселков, Л.Н. Дымант, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, Д.Б. Дэвис, А.Н. Веселков // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 2. — С. 117-126. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.

Исследовано взаимодействие красителя акридинового ряда профлавина с самокомплементарным дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе методом одномерной и двухмерной Х ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодействующих молекул Рассмотрены различные модели образования комплексов молекул красителя с тетрануклеотидом, рассчитаны равновесные константы, энтальпии ΔН и энтропии ΔS реакций образования комплексов состава 1:1, 2:1, 1:2 и 2:2. Выявлены особенности динамического равновесия комплексов различного типа в зависимости от соотношения концентраций красителя и гпетрануклеотида. Сделано заключение о преимущественной интеркаляции профлавина в пиримидин-пуриновые TG- и СА-сайты тетрануклеотида. Сравнение закономерностей интеркаляционного взаимодействия профлавина и исследованного ранее фенантридинового красителя бромистого этидия показало, что интенсивность селективного связывания ароматических лигандов с пиримидин-пуриновыми сайтами дезокситетрануклеотидов зависит от их состава и от вида оснований, фланкирующих места посадки лиганда. На основании рассчитанных значений индуцированных химических сдвигов для протонов красителя и данных 2M-NOESY определены наиболее вероятные пространственные структуры 1:2- и 2:2-комплексов профлавина с тетрануклеотидом.