Класифікація конформацій сайтів зв’язування тирозинфосфатази 1B

Класифікація конформацій сайтів зв’язування тирозинфосфатази 1B

Our previous work on classification of binding site conformations of protein tyrosine phosphatase 1B was published in 2012. It was found that 102 active sites from 91 PDB files can be divided into 5 major clusters. The number of structures in the RSCB Protein data bank has almost tripled since that...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2024
Автори:	Tanchuk, Vsevolod Y., Kobzar, Olexandr L., Vovk, Andriy I.
Формат:	Стаття
Опубліковано:	V.P. Kukhar Institute of Bioorganic Chemistry and Petrochemistry of the National Academy of Sciences of Ukraine 2024
Теми:	PTP1B binding sites conformations clustering structure similarity
Онлайн доступ:	https://bioorganica.com.ua/index.php/journal/article/view/84
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Ukrainica Bioorganica Acta

Репозитарії

Ukrainica Bioorganica Acta

Схожі ресурси

In silico дослідження афінності зв’язування азотистих біциклічних гетероциклів: пофрагментний підхід
за авторством: Velihina, Yevheniia S., та інші
Опубліковано: (2020)

Спектральні властивості одноланцюгових фрагментів вірусної ДНК
за авторством: Kudrya, V. Yu., та інші
Опубліковано: (2018)

Інгібітори ацетилхолінестерази з тіазолієвим скафолдом: структурні особливості і способи зв’язування
за авторством: Kobzar, O. L., та інші
Опубліковано: (2019)

Ionic chromophores Xe⁺p (p≤ 4) in multishell rare-gas clusters Xem(NF₃)kNe₇₅₀₀ (m, k ≤ 100) studied with fluorescence spectroscopy
за авторством: Kanaev, A., та інші
Опубліковано: (2006)

Desorption of water cluster ions from the surface of solid rare gases
за авторством: Tachibana, T., та інші
Опубліковано: (2006)

The polymerization of acetylene on supported metal clusters
за авторством: Gilb, S., та інші
Опубліковано: (2006)

Параметри зв’язування алкалоїдів берберину та сангвінарину з ДНК
за авторством: Gumenyuk, V.G., та інші
Опубліковано: (2022)

Тестування нової оціночної функції для молекулярного докінгу на прикладі інгібіторів протеїнотирозинфосфатази 1B
за авторством: Tanchuk, V. Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

Спектроскопічний та термічний аналіз кристалічного поліморфізму орто-бензилфенолу
за авторством: Baran, J., та інші
Опубліковано: (2018)

Дослідження кополімеру декстран-полі(N-ізопропілакриламіду) як потенційного температурозалежного наноносія для фотосенсибілізаторів з різними властивостями
за авторством: Kutsevol, N., та інші
Опубліковано: (2020)

Конформацiйнi ефекти i спектри фотолюмiнесценцiї нанокомпозитiв рiдкий кристал 5CB–вуглецевi нанотрубки
за авторством: Klishevich, G. V., та інші
Опубліковано: (2019)

Дослідження комплексоутворення калікс[4]aрену та калікс[4]резорцинарену із смоляними кислотами методом ОФ ВЕРХ. Визначення констант зв’язування
за авторством: Kalchenko, O. I., та інші
Опубліковано: (2016)

Механізми та параметри зв’язування амітозинобераміду з ДНК у водному розчині
за авторством: Kutovyy, S. Yu., та інші
Опубліковано: (2018)

Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини
за авторством: Мінаєв, Б.П., та інші
Опубліковано: (2009)

In silico дослідження афінності зв’язування фенілзаміщенних 1,3-оксазолів з молекулами білків
за авторством: Zhuravlova, Maryna Yu., та інші
Опубліковано: (2020)

Мiкроскопiчний опис ядер 8Li та 8B у рамках трикластерної моделi
за авторством: Vasilevsky, V. S., та інші
Опубліковано: (2018)

Black tern nest-site fidelity in unstable habitat: preliminary study
за авторством: Atamas, N. S., та інші
Опубліковано: (2020)

Black tern nest-site fidelity in unstable habitat: preliminary study
за авторством: Atamas, N. S., та інші
Опубліковано: (2020)

On solving reverse problems of geophysics applying the methods of the theory of dynamic systems
за авторством: Stepanova, I. E., та інші
Опубліковано: (2014)

One or Two: How Many Species of the Genus Pyrrhocorax (Passeriformes, Corvidae) Inhabited the Crimea During the Late Pleistocene?
за авторством: Gorobets, L., та інші
Опубліковано: (2023)

One or Two: How Many Species of the Genus Pyrrhocorax (Passeriformes, Corvidae) Inhabited the Crimea During the Late Pleistocene?
за авторством: Gorobets, L., та інші
Опубліковано: (2023)

Як довгi неправильнi пуриново-пуриновi пари основ днк набувають ензиматично-компетентної конформацiї? Структурний механiзм тайогоквантово-механiчнеобґрунтування
за авторством: Brovarets, O. O., та інші
Опубліковано: (2019)

Спектр зв’язаних станiв ядра 10B у трикластернiй мiкроскопiчнiй моделi
за авторством: Nesterov, A. V., та інші
Опубліковано: (2018)

Чи можна класифікувати кульові скупчення галактики по їх параметру анізотропії швидкостей?
за авторством: Tadjibaev, I. U., та інші
Опубліковано: (2019)

Diversity of Mosquitoes (Diptera, Culicidae) and Physico-Chemical Characterization of Th eir Larval Habitats in Tizi-Ouzou area, Algeria: Mosquitoes diversity and physico-chemical characterization of their larvae habitats
за авторством: Oussad, N., та інші
Опубліковано: (2021)

Diversity of Mosquitoes (Diptera, Culicidae) and Physico-Chemical Characterization of Th eir Larval Habitats in Tizi-Ouzou area, Algeria: Mosquitoes diversity and physico-chemical characterization of their larvae habitats
за авторством: Oussad, N., та інші
Опубліковано: (2021)

Інфрачервонi спектри трифенiл фосфiту та їх iнтерпретацiя на основi квантово-хiмiчних розрахункiв
за авторством: Babkov, L. M., та інші
Опубліковано: (2019)

Про швидкість ферментативних реакцій у міхаеліс–ментен-подібних схемах (ансамблева та одномолекулярна версії)
за авторством: Christophorov, L. N.
Опубліковано: (2020)

Indecomposable and irreducible \(t\)-monomial matrices over commutative rings
за авторством: Bondarenko, Vitaliy Mykhaylovych, та інші
Опубліковано: (2016)

Роль неколагенових білків у in vitro мінералізації: дослідження зв'язування кальцію з остеокальцином методом наноспрей мас-спектрометрії
за авторством: Суходуб, Л.Ф., та інші
Опубліковано: (2008)

Класифікація низькочастотних сигналів за допомогою методів кластеризаці
за авторством: Rahozin, D.V., та інші
Опубліковано: (2024)

Morphometric Analysis and Interrelationship of Seven Indonesian Hornbill Species (Aves, Bucerotidae) Utilizing Principal Component and Cluster Analyses
за авторством: Jarulis, J., та інші
Опубліковано: (2024)

Morphometric Analysis and Interrelationship of Seven Indonesian Hornbill Species (Aves, Bucerotidae) Utilizing Principal Component and Cluster Analyses
за авторством: Jarulis, J., та інші
Опубліковано: (2024)

Автолокалiзованi стани надлишкового електрона в iонному кластерi
за авторством: Grigorishin, K V.
Опубліковано: (2018)

Визначення ступеня семантичної подібності з використанням апарату дескриптивних логік
за авторством: Zakharova, O.V.
Опубліковано: (2021)

Формування рiдко-кристалiчної фази в полi(дi-н-гексилсиланi)
за авторством: Ostapenko, N. I., та інші
Опубліковано: (2018)

Variants of a lattice of partitions of a countable set
за авторством: Desiateryk, Oleksandra, та інші
Опубліковано: (2018)

Archaic Dialect of Chaffinch, Fringilla coelebs (Passeriformes, Fringillidae), Song in the Lower-Dnipro Area (South Ukraine) and Its Territorial Relations
за авторством: Yablonovska-Grishchenko, E., та інші
Опубліковано: (2021)

Archaic Dialect of Chaffinch, Fringilla coelebs (Passeriformes, Fringillidae), Song in the Lower-Dnipro Area (South Ukraine) and Its Territorial Relations
за авторством: Yablonovska-Grishchenko, E., та інші
Опубліковано: (2021)

Температурна еволюцiя кластерної структури н-нонан-1-олу: експериментальне дослiдження та квантово-хiмiчнi розрахунки
за авторством: Chernolevska, Ye., та інші
Опубліковано: (2019)