КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В
The species-specific primers for identification of taxonomic positions of strains of Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A and Porcine Enterovirus B kinds were developed. The reclassification of 10 strains of Porcine Enterovirus isolated in Ukraine was performed. In conformity to the internatio...
Gespeichert in:
| Datum: | 2010 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainisch |
| Veröffentlicht: |
Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine
2010
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/322 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Agriciltural microbiology |
| Завантажити файл: |  |
Institution
Agriciltural microbiology| _version_ | 1871465971703611392 |
|---|---|
| author | Головко , А.М. Дерев’янко , С.В. Бова , Т.О. Сорока , В.І. Кацимон , В.В. |
| author_facet | Головко , А.М. Дерев’янко , С.В. Бова , Т.О. Сорока , В.І. Кацимон , В.В. |
| author_institution_txt_mv | [
{
"author": "А.М. Головко ",
"institution": "Українська академія аграрних наук"
},
{
"author": "С.В. Дерев’янко ",
"institution": "Інститут сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН"
},
{
"author": "Т.О. Бова ",
"institution": "Інститут сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН"
},
{
"author": "В.І. Сорока ",
"institution": "Інститут сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН"
},
{
"author": "В.В. Кацимон ",
"institution": "Державний науково-контрольний інститут біотехнології і штамів мікроорганізмів"
}
] |
| author_sort | Головко , А.М. |
| baseUrl_str | https://smic.in.ua/index.php/journal/oai |
| collection | OJS |
| datestamp_date | 2026-07-22T10:10:47Z |
| description | The species-specific primers for identification of taxonomic positions of strains of Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A and Porcine Enterovirus B kinds were developed. The reclassification of 10 strains of Porcine Enterovirus isolated in Ukraine was performed. In conformity to the international classification they were referred to the Тeschovirus genus of Porcine Teschovirus specie. Performed investigations had created a basis for elaboration of domestic moleculargenetic diagnostic test systems |
| doi_str_mv | 10.35868/1997-3004.10.156-165 |
| first_indexed | 2025-07-17T12:25:24Z |
| format | Article |
| fulltext |
156
ВІРУСОЛОГІЯ
УДК 578.8:578.835.11/636.4
КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ
ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ
ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА
ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А і В
1Головко А.М., 2Дерев’янко С.В., 2Бова Т.О., 2Сорока В.І.,
3Кацимон В.В.
1Українська академія аграрних наук,
вул. Суворова, 9, м. Київ, 01010, Україна
2Інститут сільськогосподарської мікробіології УААН,
вул. Шевченка, 97, м. Чернігів, 14027, Україна
3Державний науково-контрольний інститут біотехнології і штамів
мікроорганізмів,
вул. Донецька, 30, м. Київ, 03151, Україна
E-mail: biopreparat@mail.ru
Розроблено видоспецифічні праймери для встановлення
таксономічного положення штамів вірусів видів Porcine
Teschovirus, Porcine Enterovirus А, Porcine Enterovirus В. Проведено
рекласифікацію 10 штамів ентеровірусів свиней, виділених на те-
риторії України. Згідно міжнародної класифікації їх віднесено до
роду Тeschovirus виду Porcine Teschovirus. Проведені дослідження є
підґрунтям для розробки вітчизняних діагностичних тест-систем
на основі молекулярно-генетичних методів.
Ключові слова: Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus А,
Porcine Enterovirus В, штам, праймери, полімеразна ланцюгова
реакція, рекласифікація.
У 60-х роках ХХ століття встановлено основні морфологічні,
бiологiчнi, фiзико-хiмiчнi та антигенні властивості ентеровiрусiв
свиней, які лягли в основу їх міжнародної класифікації. В 1971 р.
на основі результатів вивчення антигенних властивостей 72
європейських, американських та японських штамів ентеровірусів
свиней, Dunne Н. et al. [1] розподілили їх на 8 серотипiв (ЕВС 1-
8), яку доповнили Knowles N. еt al. [2] 3-ма (ЕВС 9-11), J. Auerbach
еt al. [3, 4] – 2-ма (ЕВС 12 і 13) новими серотипами. Крім того,
Романенко В.П. з спiвавт. [5] встановили 14 нових серотипів ЕВС,
які поки що не увійшли до міжнародної класифікації.
157
Нами та іншими дослідниками виділено ентеровіруси свиней,
які в реакції нейтралізації вірусу мають міжтипові антигенні
властивості, що ускладнює встановлення їх таксономічного
положення на рівні серотипу [6].
По мірі накопичення даних щодо генетичної структури
вірусів на 11 Міжнародному конгресі з вірусології, який відбувся
у 1999 році у Сіднеї, було прийнято ряд змін щодо таксономії і
номенклатури пікорнавірусів [7].
Найбільш суттєвих змін зазнав рід Enterovirus, зокрема
ентеровіруси свиней. На основі генетичних досліджень проведених
Zell R. еt al., [8], Kaku Y. еt al. [9] та Doherty M. еt al. [10],
Міжнародний комітет з таксономії рекласифікував ентеровіруси
свиней на 3 види, які віднесено до 2 родів.
Так, ЕВС 1-7, 11-13 серотипів та один новий серотип [8]
віднесено до виду Porcine Teschovirus (PТV), який на сьогодні
налічує 11 серотипів і винесений в окремий рід Teschovirus. Назва
роду походить від назви самої хвороби свиней (Тешенської хвороби),
яку можуть викликати представники цього роду. Ентеровіруси
свиней 8 серотипу рекласифіковано як Porcine Еnterovirus A
(PEV-A), а 9 та 10 – як Porcine Еnterovirus В (PEV-B), які віднесені
до роду Enterovirus.
Інститут сільськогосподарської мікробіології УААН має
значний досвід щодо виділення та ідентифікації тешо- і енте-
ровірусів свиней. Роботи за цим напрямом розпочались у 1961 р.
За цей час співробітниками інституту ідентифіковано сотні
монотипових і поліантигенних штамів, віднесено до відомих і нових
серотипів [5, 11-13]. За серотиповою належністю 15,5 % виділених
вірусів мають антигенні зв’язки з референтними штамами одного
із серотипів ЕВС, 10,2 % – двох, 66,8 % – 3-18 серотипів, а 7,6 %
не мають таких зв’язків із жодним з відомих серотипів ЕВС [11].
В Інституті створено колекцію тешо-, ентеровірусів свиней, яка
налічує 92 штами, серед яких є еталонні, вакцинні, діагностичні,
прототипні.
Таким чином, у зв’язку зі змінами, внесеними Міжнарод-
ним комітетом з таксономії вірусів, існує необхідність у проведенні
молекулярно-генетичної рекласифікації штамів, виділених на
території України, та впровадження у практику ветеринарної
медицини діагностичних засобів, розроблених на основі генетичних
методів.
158
Враховуючи вищенаведене, метою наших досліджень
було розробити видоспецифічні праймери тешо- і ентеровірусів
свиней для проведення молекулярно-генетичної рекласифікації
ентеровірусів свиней та ідентифікації ізолятів вірусів.
Матеріали і методи. В роботі використано 10 штамів
(П 642, Б 652, Ч 2372, И 59, Р 501, Г 95, В 151, П 142, М 2323,
Д 33) ентеровірусів свиней, що виділені на території України
та зберігаються в колекції Інституту; еталонні штами тешо-,
ентеровірусів свиней 14 серотипів, люб’язно надані професором
Мальте Даубером з колекції Інституту вірусної діагностики
ім. Ф. Леффлера Федерального центру вірусних хвороб тварин
Німеччини (табл. 1). Штам ЗКСМ вірусу парагрипу-3, штам К
вірусу класичної чуми свиней, штам ВК-1 вірусу діареї великої
рогатої худоби, штам ВС-1 вірусу трансмісивного гастроентериту
свиней – з колекції Державного науково-контрольного інституту
біотехнології та штамів мікроорганізмів.
Підтримання та накопичення вірусів, визначення їх
інфекційної активності проводили в культурі клітин нирки ембріону
свині (СНЕВ).
Таблиця 1. Еталонні штами тешо-, ентеровірусів свиней
Рід Вид Серотип Назва штаму
Teschovirus Porcine Teschovirus
PTV-1 Teschen 199
PTV-2 O 3b
PTV-3 O 2b
PTV-4 PS 36
PTV-5 F 26
PTV-6 PS 37
PTV-7 F 43
PTV-8 UKG 173/74
PTV-9 VIR 2899/84
PTV-10 VIR 460/88
PTV-11 Dresden
Enterovirus
Porcine Enterovirus А PEV-8 V 13
Porcine Enterovirus В PEV-9 UKG 410/73
PEV-10 LP 54
Підбір гомологічних ділянок геному для конструювання
видоспецифічних праймерів проводили за допомогою комп’ютерної
159
програми Vector NTI за використання бази даних GenBank, EMBL
(Європейська молекулярно-біологічна бібліотека) [14], DDBJ
(Японська база даних нуклеотидних послідовностей) [15].
Для ефективного використання в полімеразній ланцюговій
реакції (ПЛР) розроблені олігонуклеотидні праймери повинні
відповідати певним вимогам:
− мати високу специфічність для зв'язування зі строго
визначеними ділянками геному;
− мати схожу температуру відпалу й константу зв'язування;
− не створювати жорстких вторинних структур.
Синтез праймерів здійснювали в науково-виробничому
підприємстві «ЛІТЕХ» (Росія, м. Москва).
Рибонуклеїнову кислоту (РНК) тешовірусів і ентеровірусів
свиней виділяли з досліджуваних проб за використання набору
«РНК-сорб-В» (Центральний науково-дослідний інститут епіде-
міології, м. Москва), в основі якого лежить метод сорбції на си-
лікагелі. З виділеної РНК отримували кДНК за допомогою реакції
зворотної транскрипції (ЗТ). ПЛР проводили на чотирьохканальному
ампліфікаторі «Терцик» НВФ «ДНК-Технологія» (Росія, м. Москва),
по Saiki R. еt al. Реакційна суміш об’ємом 25 мкл вміщувала:
67 ммоль трис-HCl (pH 8,8), 16,6 mM (NH4)2SO4, 2,0 ммоль
MgCl2, 0,01 % твін-20, по 100 мкмоль дАТФ, дГТФ, дТТФ, дЦТФ,
2 нмоль кожного з специфічних праймерів, 2 од. Taq-полімерази,
5 мкл зразків виділеної ДНК. Для попередження випаровування
у кожний зразок поверх реакційної суміші нашаровували по
30 мкл мінеральної олії. Ампліфікацію (помноження) специфічних
ділянок кДНК інфекційних агентів проводили за програмами,
представленими в табл. 2.
Детекцію продуктів реакції проводили за допомогою
електрофорезу у 1,5 % агарозному гелі, забарвленому бромідом
етидію з використанням трис-боратного буфера при градіенті
напруги 10 В/см. Результати оцінювали при перегляді гелю після
електрофорезу на трансілюмінаторі під УФ-світлом за наявністю
(або відсутністю) червоно-помаранчевих фрагментів ДНК певного
розміру. Специфічність ампліфікованого фрагмента ДНК визначали
за його розміром відносно фрагментів стандартних маркерів.
Для визначення специфічності сконструйованих праймерів
використовували вірусовмісну суспензію культури клітин
з титром тешо- і ентеровірусів свиней 5,0-8,5 lg ТЦД50/см3,
160
вірусовмісні суспензії головного та спинного мозку з титром
2,0-5,5 lg ТЦД50/см3, віруси інших таксономічних груп (вірус
парагрипу-3, вірус класичної чуми свиней, вірус діареї великої
рогатої худоби, вірус трансмісивного гастроентериту свиней),
суспензії культури клітин СНЕВ, спинного і головного мозку,
селезінки, легень свиней.
Таблиця 2. Температурні і часові параметри
ампліфікації специфічної ділянки кДНК
№
циклу
Температура ампліфікації, °С
Час, хв. Кількість
циклівтешовіруси
свиней
ентеровіруси
свиней А
ентеровіруси
свиней В
1 95 95 95 5 1
2
94 94 94 1
558 58 60 1
74 74 74 1
3
94 94 94 0,5
3558 58 60 0,5
73 73 73 0,5
4 72 72 72 5 1
5 зберігання
Результати та їх обговорення. У результаті аналізу
геномів ентеро- і тешовірусів свиней за використання програми
«Align X (Vector NTI Suite)» і баз даних GenBank, EMBL, DDBJ
було підібрано консервативні ділянки геномів, придатні для
розробки видоспецифічних праймерів. Так, для тешовірусів свиней
розроблені праймери мали наступні послідовності:
Sense Primer: TeschoF51 5’-CCAGCAGCCTCTGTTCAGAAAG
Antisense Primer: TeschoR51 5’-GC(A/G)TACTTGTATGAGGCCCATC
Вони фланкують ділянку молекули РНК довжиною 650
нуклеотидних залишків, починаючи з 5271 по 5908 нуклеотид
(AF296096). Їх ідентичність для всіх тешовірусів свиней за
результатами аналізу даних банку генів становила 100 % (95,5 %).
Для ідентифікації ентеровірусів свиней А були отримані
наступні праймери, які фланкують ділянку геному вірусу з 3141
по 3598 нуклеотиди (AF406813), довжиною 458 нуклеотидних
залишка:
161
Sense Primer: Pev8F6 5’-TGCCAAACTAAGAACGCCACTG
Antisense Primer: Pev8R6 5’-TCACCTTCTGCCATCCACAATC
Їх ідентичність для штамів ентеровірусів свиней А становила
100 %.
Для ідентифікації ентеровірусів свиней В були синтезовані
наступні праймери:
Sense Primer: Pev9F1 5’-GGATTGCGGTCAAGCACTTCTGTT
Antisense Primer: Pev9R1 5’-CGTGGTTAGGATTAGCCGCATTC
Вони були підібрані до ділянки геному ентеровірусів свиней
В у межах 187 – 513 нуклеотидів (AF363453), розмір ПЛР-фрагмен-
ту – 327 нуклеотидних залишка. Ідентичність ініціюючого прай-
мера становила 100 % (95,8 %), а термінуючого праймера – 100 %.
Для визначення специфічності праймерів проведено
молекулярно-генетичні дослідження еталонних штамів тешовірусів
та ентеровірусів свиней А і B, штамів ентеровірусів свиней,
виділених на території України, вірусів інших таксономічних
груп, зразки культури клітин СНЕВ, органів і тканин свиней у
полімеразній ланцюговій реакції (табл. 3).
Встановлено, що праймери, отримані до ділянки РНК
тешовірусів свиней, були специфічними як до РНК еталонних
штамів тешовірусів, так і до РНК усіх тестованих штамів енте-
ровірусів свиней, виділених на території України. Праймери, одер-
жані до ділянки РНК ентеровірусів свиней А, взаємодіяли лише
з РНК штаму V13, а праймери, сконструйовані для ідентифікації
ентеровірусів свиней В – з штамами UKG 410/73 та LP54.
Жодна з досліджуваних пар праймерів не вступала у взаємодію
з РНК вірусів інших таксономічних груп. Продуктів ампліфікації з
культурою клітин СНЕВ та суспензіями органів свиней також не
спостерігали. Отже, встановлена висока специфічність одержаних
праймерів, підтверджена їх видоспецифічність. Встановлено
таксономічне положення 10 штамів ентеровірусів свиней, виділених
на території України, які на підставі проведених досліджень
рекласифіковано як Porcine Teschovirus згідно з міжнародною
класифікацією.
Отримані дослідження відкривають перспективи розробки
діагностичних тест-систем на основі молекулярно-генетичних ме-
тодів з використанням розроблених олігонуклеотидних праймерів.
162
Таблиця 3. Специфічність сконструйованих праймерів
Зразок Праймери до
PTV PEV-A PEV-B
PTV-1 Teshen 199 + – –
PTV-2 03b + – –
PTV-3 02b + – –
PTV-4 PS36 + – –
PTV-5 F26 + – –
PTV-6 PS37 + – –
PTV-7 F43 + – –
PTV-8 UKG 173/74 + – –
PTV-9 VIR 2899/84 + – –
PTV-10 VIR461/88 + – –
PTV-11 Dresden + – –
PEV-A V13 – + –
PEV-B UKG 410/73 – – +
PEV-B LP54 – – +
EBC П 642 + – –
EBC Б 652 + – –
EBC И 59 + – –
EBC Г 95 + – –
ЕВС В 151 + – –
EBC П 142 + – –
EBC Р 501 + – –
EBC Ч 2372 + – –
Суспензія головного мозку EBC Ч 2372 + – –
Суспензія головного мозку EBC М 2323 + – –
Суспензія спинного мозку ЕВС Д 33 + – –
Вірус парагрипу-3 штам ЗКСМ – – –
Вірус класичної чуми свиней штам К – – –
Вірус діареї великої рогатої худоби штам ВК-1 – – –
Вірус трансмісивного гастроентериту свиней
штам ВС-1 – – –
Головний мозок – – –
Спинний мозок – – –
Легені – – –
Селезінка – – –
Культура клітин СНЕВ – – –
163
Таким чином, створено видоспецифічні праймери для
проведення молекулярно-генетичної ідентифікації Porcine
Teschovirus, Porcine Enterovirus А, Porcine Enterovirus В у зворотній
транскриптазній полімеразній ланцюговій реакції. Рекласифіковано
10 штамів ентеровірусів свиней, виділених в Україні. За
результатами молекулярно-генетичних досліджень їх віднесено до
роду Тeschovirus виду Porcine Teschovirus згідно з міжнародною
класифікацією.
1. Dunne H.W. Classification of North American porcine Enteroviruses:
a comparison with Europian and Japanese strains /Dunne H.W., Wang T.J.,
Ammermann E.H. //Infect. Immunol. – 1971. – Vol. 4, № 5. – P. 619-631.
2. Knowless N.J. Classification of porcine enteroviruses by antigenic
analysis and cytopathic effects in tissue culture: desciption of 3 new serotypes
/Knowless N.J., Buckley L.S., Pereira H.G. //Arch. Virol. – 1979. – Vol. 62,
№ 3. – P. 201-208.
3. Grouping of porcine enteroviruses by indirect immunofluorescence
and description of two new serotypes /Auerbach J., Prager D., Neuhaus S. [et
al.] //J. vet. Med. Ser. B. – 1994. – Vol. 41, № 4. – P. 277-282.
4. Auerbach J. Serologische Klassifizierung porziner Enterovirus
Feldisolate aus Schweinen mit zentralnervosen Storungen mittels
Neutralisationstest und indirekter Immunfluoreszenz und Beschreibung
von zwei neuen Serotypen (PEV12 und PEV13) /Auerbach J. //Fachbereich
Veterinar medizin, Justus-Liebig-Universitat. – Giessen, 1993. – P. 12.
5. Классификация энтеровирусов свиней /Романенко В.Ф., Прусс О.
Г., Бабич Н.В. [и др.] //Вiсник аграрної науки. – 1993. – № 1. – С. 94-101.
6. Дерев’янко С.В. Рекомбiнацiя i її значення в еволюцiї
ентеровiрусiв свиней /Дерев’янко С.В., Полевiк О.I., Сорока В.I. //Мат.
наук.-практич. конф. молодих вчених аграрiїв Чернiгiвщини [«Наукове
обгрунтування сталого розвитку агроекологiчних систем Чернiгiвщини
в ринкових умовах i обмеженого ресурсного забезпечення»]. – Чернiгiв :
ІСГМ, 1999. – С. 32-35.
7. Picornaviridae /King A.M.Q., Brown F., Christian [et al.] //Virus
Taxonomy. Seventh Report of the International Committee for the Taxonomy
of Viruses /eds Van Regenmortel M.H.V., Fauquet C.M., Bishop D.H.L. et al.
– New-York ; San Diego : Academic Press, 2000. – P. 657-673.
8. Porcine Teschovirus comprise at least eleven distinct serotypes:
molecular and evolutionary aspects /Zell R., Dauber M., Krumbolz A. [et al.]
//J. Virol. – 2001. – Vol. 75, № 4. – P. 1620-1631.
9. Kaku Y. Genetic reclassification of porcine enteroviruses /Kaku Y.,
Sarai A., Murakami Y. //J. Gen. Virol. – 2001. – Vol. 82. – P. 417-424.
10. Sequence analysis of a porcine enterovirus serotype 1 isolate:
164
relationships with other picornaviruses /Doherty M., Todd D., McFerran N.,
Hoey E.M. //J. Gen. Vir. – 1999. – Vol. 80. – P. 1929-1941.
11. Сорока В.І. Характеристика ентеровірусів, виділених від свиней
/Сорока В.І., Полевік О.І., Дерев’янко С.В. //Ветеринарна медицина:
міжвідом. темат. наук. зб. – Харків, 2003. – Вип. 82. – С. 531-535.
12. Дерев’янко С.В. Класифікація ентеровірусів свиней: сучасний
стан та проблеми /Дерев’янко С.В., Сорока В.І. //Ветеринарна медицина:
міжвідом. темат. наук. зб. – Харків, 2002. – Вип. 80. – С. 195-200.
13. Визначення таксономічного положення штамів тешо-,
ентеровірусів свиней, виділених на території України /Дерев’янко С.В.,
Сорока В.І., Бокун А.О., Бова Т.О. //ХІІ з’їзд товариства мікробіологів
України ім. С.М. Виноградського: тези доп. (м. Ужгород, 25-30 травня
2009 р.). – Ужгород: Патент, 2009. – С. 423.
14. European Molecular Biology Laboratory. – Режим доступу:
http://www.embl.org/
15. DNA Data Bank of Japan (DDBJ). – Режим доступу:
http://www.ddbj.nig.ac.jp/
КОНСТРУИРОВАНИЕ ВИДОСПЕЦИФИЧЕСКИХ
ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ
ИДЕНТИФИКАЦИИ ТЕШОВИРУСОВ И
ЭНТЕРОВИРУСОВ СВИНЕЙ А и В
1Головко А.Н., 2Деревянко С.В., 2Бова Т.А., 2Сорока В.И.,
3Кацимон В.В.
1Украинская академия аграрных наук, г. Киев
2Институт сельскохозяйственной микробиологии УААН,
г. Чернигов
3Государственный научно-контрольный институт биотехнологии и
штаммов микроорганизмов, г. Киев
Сконструированы видоспецифические праймеры для
определения таксономического положения штаммов видов Porcine
Teschovirus, Porcine Enterovirus А, Porcine Enterovirus В. Проведена
реклассификация 10 штаммов энтеровирусов свиней, выделенных
на территории У краины. В соответствии с международной
классификацией они отнесены к роду Тeschovirus виду Porcine
Teschovirus. Проведенные исследования создают основу для
разработки отечественных диагностических тест-систем на
основе молекулярно-генетических методов.
Ключевые слова: Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus А,
Porcine Enterovirus В, штамм, праймеры, полимеразная цепная
реакция, реклассификация.
165
CONSTRUCTION OF SPECIES-SPECIFIC PRIMERS
FOR MOLECULAR-GENETIC IDENTIFICATION OF
PORCINE TESCHOVIRUSES AND ETEROVIRUSES
A AND B
1Golovko A.N., 2Derevyanko S.V., 2Bova T.O., 2Soroka V.I.,
3Katsymon V.V.
1Ukrainian Academy of Agrarian Sciences, Kyiv
2Institute of Agricultural Microbiology, UAAS, Chernihiv
3State Scientifically-Control Institute of Biotechnology and Strains
Speeches of Microorganisms, Kyiv
The species-specific primers for identification of taxonomic
positions of strains of Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A and
Porcine Enterovirus B kinds were developed. The reclassification of
10 strains of Porcine Enterovirus isolated in Ukraine was performed.
In conformity to the international classification they were referred
to the Тeschovirus genus of Porcine Teschovirus specie. Performed
investigations had created a basis for elaboration of domestic molecular-
genetic diagnostic test systems.
Key words: Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A,
Porcine Enterovirus B, strains, primer, polymeraze chain reaction,
reclassification.
|
| id | oai:ojs2.smic.in.ua:article-322 |
| institution | Agriciltural microbiology |
| keywords_txt_mv | keywords |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2026-07-23T01:10:31Z |
| publishDate | 2010 |
| publisher | Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine |
| record_format | ojs |
| resource_txt_mv | smicinua/35/dc8527020fb0af6f69df5624b2ba0e35.pdf |
| spelling | oai:ojs2.smic.in.ua:article-3222026-07-22T10:10:47Z CONSTRUCTION OF SPECIES-SPECIFIC PRIMERS FOR MOLECULAR-GENETIC IDENTIFICATION OF PORCINE TESCHOVIRUSES AND ETEROVIRUSES A AND B КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В Головко , А.М. Дерев’янко , С.В. Бова , Т.О. Сорока , В.І. Кацимон , В.В. Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A, Porcine Enterovirus B, strains, primer, polymeraze chain reaction, reclassification Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus А, Porcine Enterovirus В, штам, праймери, полімеразна ланцюгова реакція, рекласифікація The species-specific primers for identification of taxonomic positions of strains of Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus A and Porcine Enterovirus B kinds were developed. The reclassification of 10 strains of Porcine Enterovirus isolated in Ukraine was performed. In conformity to the international classification they were referred to the Тeschovirus genus of Porcine Teschovirus specie. Performed investigations had created a basis for elaboration of domestic moleculargenetic diagnostic test systems Розроблено видоспецифічні праймери для встановлення таксономічного положення штамів вірусів видів Porcine Teschovirus, Porcine Enterovirus А, Porcine Enterovirus В. Проведено рекласифікацію 10 штамів ентеровірусів свиней, виділених на території україни. Згідно міжнародної класифікації їх віднесено до роду Тeschovirus виду Porcine Teschovirus. Проведені дослідження є підґрунтям для розробки вітчизняних діагностичних тест-систем на основі молекулярно-генетичних методів. Institute of Agrocultural Microbiology and Agro-industrial Manufacture of NAAS of Ukraine 2010-02-10 Article Article Рецензована Стаття application/pdf https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/322 10.35868/1997-3004.10.156-165 Agricultural microbiology; Vol. 10 (2010): Agriciltural microbiology; 156-165 Сільськогосподарська мікробіологія; Том 10 (2010): Сільськогосподарська мікробіологія; 156-165 1997-3004 10.35868/1997-3004.10 uk https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/322/407 Авторське право (c) 2010 A.M. Golovko , S.V. Derevyanko , T.O. Bova , V.I. Soroka , V.V. Katsymon https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |
| spellingShingle | Porcine Teschovirus Porcine Enterovirus А Porcine Enterovirus В штам праймери полімеразна ланцюгова реакція рекласифікація Головко , А.М. Дерев’янко , С.В. Бова , Т.О. Сорока , В.І. Кацимон , В.В. КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title | КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title_alt | CONSTRUCTION OF SPECIES-SPECIFIC PRIMERS FOR MOLECULAR-GENETIC IDENTIFICATION OF PORCINE TESCHOVIRUSES AND ETEROVIRUSES A AND B |
| title_full | КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title_fullStr | КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title_full_unstemmed | КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title_short | КОНСТРУЮВАННЯ ВИДОСПЕЦИФІЧНИХ ПРАЙМЕРІВ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОЇ ІДЕНТИФІКАЦІЇ ТЕШОВІРУСІВ ТА ЕНТЕРОВІРУСІВ СВИНЕЙ А І В |
| title_sort | конструювання видоспецифічних праймерів для молекулярно-генетичної ідентифікації тешовірусів та ентеровірусів свиней а і в |
| topic | Porcine Teschovirus Porcine Enterovirus А Porcine Enterovirus В штам праймери полімеразна ланцюгова реакція рекласифікація |
| topic_facet | Porcine Teschovirus Porcine Enterovirus A Porcine Enterovirus B strains primer polymeraze chain reaction reclassification Porcine Teschovirus Porcine Enterovirus А Porcine Enterovirus В штам праймери полімеразна ланцюгова реакція рекласифікація |
| url | https://smic.in.ua/index.php/journal/article/view/322 |
| work_keys_str_mv | AT golovkoam constructionofspeciesspecificprimersformoleculargeneticidentificationofporcineteschovirusesandeterovirusesaandb AT derevânkosv constructionofspeciesspecificprimersformoleculargeneticidentificationofporcineteschovirusesandeterovirusesaandb AT bovato constructionofspeciesspecificprimersformoleculargeneticidentificationofporcineteschovirusesandeterovirusesaandb AT sorokaví constructionofspeciesspecificprimersformoleculargeneticidentificationofporcineteschovirusesandeterovirusesaandb AT kacimonvv constructionofspeciesspecificprimersformoleculargeneticidentificationofporcineteschovirusesandeterovirusesaandb AT golovkoam konstruûvannâvidospecifíčnihprajmerívdlâmolekulârnogenetičnoíídentifíkacíítešovírusívtaenterovírusívsvinejaív AT derevânkosv konstruûvannâvidospecifíčnihprajmerívdlâmolekulârnogenetičnoíídentifíkacíítešovírusívtaenterovírusívsvinejaív AT bovato konstruûvannâvidospecifíčnihprajmerívdlâmolekulârnogenetičnoíídentifíkacíítešovírusívtaenterovírusívsvinejaív AT sorokaví konstruûvannâvidospecifíčnihprajmerívdlâmolekulârnogenetičnoíídentifíkacíítešovírusívtaenterovírusívsvinejaív AT kacimonvv konstruûvannâvidospecifíčnihprajmerívdlâmolekulârnogenetičnoíídentifíkacíítešovírusívtaenterovírusívsvinejaív |